Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(006)-Segment cluster 1570 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 129 structure(s)
Representative structure 2hgi:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VRARMK
Cluster members
AGAGUA
1ffk:0, 368-375, 1jj2:0, 369-376, 1k73:A, 369-376, 1k8a:A, 369-376, 1k9m:A, 369-376, 1kc8:A, 369-376, 1kd1:A, 369-376, 1kqs:0, 369-376, 1m1k:A, 369-376, 1m90:A, 369-376, 1n8r:A, 369-376, 1nji:A, 369-376, 1q7y:A, 369-376, 1q81:A, 369-376, 1q82:A, 369-376, 1q86:A, 369-376, 1qvf:0, 369-376, 1qvg:0, 369-376, 1s72:0, 369-376, 1vq4:0, 369-376, 1vq5:0, 369-376, 1vq6:0, 369-376, 1vq7:0, 369-376, 1vq8:0, 369-376, 1vq9:0, 369-376, 1vqk:0, 369-376, 1vql:0, 369-376, 1vqm:0, 369-376, 1vqn:0, 369-376, 1vqo:0, 369-376, 1vqp:0, 369-376, 1w2b:0, 369-376, 1yhq:0, 369-376, 1yi2:0, 369-376, 1yij:0, 369-376, 1yit:0, 369-376, 1yj9:0, 369-376, 1yjn:0, 369-376, 1yjw:0, 369-376, 2otj:0, 369-376, 2otl:0, 369-376, 2qa4:0, 369-376, 2qex:0, 369-376, 3cc2:0, 369-376, 3cc4:0, 369-376, 3cc7:0, 369-376, 3cce:0, 369-376, 3ccj:0, 369-376, 3ccl:0, 369-376, 3ccm:0, 369-376, 3ccq:0, 369-376, 3ccr:0, 369-376, 3ccs:0, 369-376, 3ccu:0, 369-376, 3ccv:0, 369-376, 3cd6:0, 369-376, 3cma:0, 369-376, 3cpw:0, 369-376
CAAAUC
3bbn:A, 548-555
GAAAGA
1fjg:A, 584-591, 1hnw:A, 584-591, 1hnx:A, 584-591, 1hnz:A, 584-591, 1hr0:A, 584-591, 1i94:A, 587-594, 1i95:A, 587-594, 1i96:A, 587-594, 1ibk:A, 584-591, 1ibl:A, 584-591, 1ibm:A, 584-591, 1j5e:A, 584-591, 1n32:A, 584-591, 1n33:A, 584-591, 1n34:A, 584-591, 1n36:A, 584-591, 1pns:A, 598-605, 1pnx:A, 598-605, 1s1h:A, 589-596, 1xmo:A, 584-591, 1xmq:A, 584-591, 1xnq:A, 584-591, 1xnr:A, 584-591, 1yl4:A, 584-591, 2e5l:A, 585-592, 2f4v:A, 584-591, 2hgi:A, 584-591, 2hgp:A, 584-591, 2hgr:A, 584-591, 2hhh:A, 584-591, 2jl5:A, 584-591, 2jl7:A, 584-591, 2ow8:y, 584-591, 2qnh:y, 584-591, 2uu9:A, 584-591, 2uua:A, 584-591, 2uub:A, 584-591, 2uuc:A, 584-591, 2uxb:A, 584-591, 2uxc:A, 584-591, 2uxd:A, 562-569, 2v46:A, 584-591, 2v48:A, 584-591, 2vqe:A, 584-591, 2vqf:A, 584-591, 3d5a:A, 584-591, 3d5c:A, 584-591
GAAAUC
1vs5:A, 601-608, 1vs7:A, 601-608, 2avy:A, 601-608, 2aw7:A, 601-608, 2gy9:A, 571-578, 2i2p:A, 601-608, 2i2u:A, 601-608, 2qal:A, 601-608, 2qan:A, 601-608, 2qb9:A, 601-608, 2qbb:A, 601-608, 2qbd:A, 601-608, 2qbf:A, 601-608, 2qbh:A, 601-608, 2qbj:A, 601-608, 2qou:A, 601-608, 2qow:A, 601-608, 2qoy:A, 601-608, 2qp0:A, 601-608, 2z4k:A, 601-608, 2z4m:A, 601-608, 3df1:A, 601-608, 3df3:A, 601-608