Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1420 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 143 structure(s)
Representative structure 1vq9:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDNNN
Cluster members
AACUA
1p5m:A, 10-16, 1p5p:A, 10-16
CAUUC
1o0b:B, 41-47, 1o0c:B, 41-47, 1qtq:B, 41-47, 1zjw:B, 41-47, 2rd2:B, 41-47, 2re8:B, 41-47
CGGAC
3d5b:A, 292-298, 3d5d:A, 292-298
GAAAU
1ond:0, 780-786, 1p9x:0, 757-763, 1xbp:0, 780-786, 1z58:2, 774-780, 2d3o:0, 780-786, 3bbo:A, 798-804
GAACC
1z43:A, 55-61, 2v3c:M, 51-57, 2v3c:N, 51-57
GACAU
1ffk:0, 687-693, 1jj2:0, 688-694, 1k73:A, 688-694, 1k8a:A, 688-694, 1k9m:A, 688-694, 1kc8:A, 688-694, 1kd1:A, 688-694, 1kqs:0, 688-694, 1m90:A, 688-694, 1n8r:A, 688-694, 1nji:A, 688-694, 1q7y:A, 688-694, 1q81:A, 688-694, 1q82:A, 688-694, 1q86:A, 688-694, 1qvf:0, 688-694, 1qvg:0, 688-694, 1s1i:3, 690-696, 1s72:0, 688-694, 1vq4:0, 688-694, 1vq5:0, 688-694, 1vq6:0, 688-694, 1vq7:0, 688-694, 1vq8:0, 688-694, 1vq9:0, 688-694, 1vqk:0, 688-694, 1vql:0, 688-694, 1vqm:0, 688-694, 1vqn:0, 688-694, 1vqo:0, 688-694, 1vqp:0, 688-694, 1w2b:0, 688-694, 1yhq:0, 688-694, 1yi2:0, 688-694, 1yij:0, 688-694, 1yit:0, 688-694, 1yj9:0, 688-694, 1yjn:0, 688-694, 1yjw:0, 688-694, 2otj:0, 688-694, 2otl:0, 688-694, 2qa4:0, 687-693, 2qex:0, 688-694, 3cc2:0, 688-694, 3cc4:0, 688-694, 3cc7:0, 688-694, 3cce:0, 688-694, 3ccj:0, 688-694, 3ccl:0, 688-694, 3ccm:0, 688-694, 3ccq:0, 688-694, 3ccr:0, 688-694, 3ccs:0, 688-694, 3ccu:0, 688-694, 3ccv:0, 688-694, 3cd6:0, 688-694, 3cma:0, 688-694, 3cme:0, 688-694, 3cpw:0, 688-694
GGGCG
1i94:A, 1199-1205
GGUCG
2j01:A, 275-281, 2j03:A, 275-281, 2jl6:A, 275-281, 2jl8:A, 275-281
UGUCA
1ffk:0, 258-264, 1jj2:0, 259-265, 1k73:A, 259-265, 1k8a:A, 259-265, 1k9m:A, 259-265, 1kc8:A, 259-265, 1kd1:A, 259-265, 1kqs:0, 259-265, 1m1k:A, 259-265, 1m90:A, 259-265, 1n8r:A, 259-265, 1nji:A, 259-265, 1q7y:A, 259-265, 1q81:A, 259-265, 1q82:A, 259-265, 1q86:A, 259-265, 1qvf:0, 259-265, 1qvg:0, 259-265, 1s72:0, 259-265, 1vq4:0, 259-265, 1vq5:0, 259-265, 1vq6:0, 259-265, 1vq7:0, 259-265, 1vq8:0, 259-265, 1vq9:0, 259-265, 1vqk:0, 259-265, 1vql:0, 259-265, 1vqm:0, 259-265, 1vqn:0, 259-265, 1vqo:0, 259-265, 1vqp:0, 259-265, 1w2b:0, 259-265, 1yhq:0, 259-265, 1yi2:0, 259-265, 1yij:0, 259-265, 1yit:0, 259-265, 1yj9:0, 259-265, 1yjn:0, 259-265, 1yjw:0, 259-265, 2otj:0, 259-265, 2otl:0, 259-265, 2qa4:0, 259-265, 2qex:0, 259-265, 3cc2:0, 259-265, 3cc4:0, 259-265, 3cc7:0, 259-265, 3cce:0, 259-265, 3ccj:0, 259-265, 3ccl:0, 259-265, 3ccm:0, 259-265, 3ccq:0, 259-265, 3ccr:0, 259-265, 3ccs:0, 259-265, 3ccu:0, 259-265, 3ccv:0, 259-265, 3cd6:0, 259-265, 3cma:0, 259-265, 3cme:0, 259-265, 3cpw:0, 259-265
UUAGG
3bbo:A, 752-758