Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 2850 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 113 structure(s)
Representative structure 2qa4:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DNRVN
Cluster members
AAAGC
1vs5:A, 567-573, 1vs7:A, 567-573, 2avy:A, 567-573, 2gyb:A, 537-543, 2i2p:A, 567-573, 2i2u:A, 567-573, 2qbd:A, 567-573, 2qbf:A, 567-573, 2qbh:A, 567-573, 2qbj:A, 567-573, 2qou:A, 567-573, 2qow:A, 567-573, 2z4k:A, 567-573, 2z4m:A, 567-573, 3bbn:A, 514-520, 3df1:A, 567-573, 3df3:A, 567-573
AAAGG
1i95:A, 553-559, 1i97:A, 553-559, 1pns:A, 564-570, 2b9m:A, 550-556, 2e5l:A, 551-557, 2hhh:A, 550-556, 3d5a:A, 550-556, 3d5c:A, 550-556
AGGAA
1ffk:0, 1523-1529, 1jj2:0, 1573-1579, 1k73:A, 1573-1579, 1k8a:A, 1573-1579, 1k9m:A, 1573-1579, 1kc8:A, 1573-1579, 1kd1:A, 1573-1579, 1kqs:0, 1573-1579, 1m1k:A, 1573-1579, 1m90:A, 1573-1579, 1n8r:A, 1573-1579, 1nji:A, 1573-1579, 1q7y:A, 1573-1579, 1q81:A, 1573-1579, 1q82:A, 1573-1579, 1q86:A, 1573-1579, 1qvf:0, 1573-1579, 1qvg:0, 1573-1579, 1s1i:3, 1681-1687, 1s72:0, 1573-1579, 1vq4:0, 1573-1579, 1vq5:0, 1573-1579, 1vq6:0, 1573-1579, 1vq7:0, 1573-1579, 1vq8:0, 1573-1579, 1vq9:0, 1573-1579, 1vqk:0, 1573-1579, 1vql:0, 1573-1579, 1vqm:0, 1573-1579, 1vqn:0, 1573-1579, 1vqo:0, 1573-1579, 1vqp:0, 1573-1579, 1w2b:0, 1573-1579, 1yhq:0, 1573-1579, 1yi2:0, 1573-1579, 1yij:0, 1573-1579, 1yit:0, 1573-1579, 1yj9:0, 1573-1579, 1yjn:0, 1573-1579, 1yjw:0, 1573-1579, 1ysh:F, 27-33, 2j37:Z, 248-254, 2otj:0, 1573-1579, 2otl:0, 1573-1579, 2qa4:0, 1578-1584, 2qex:0, 1573-1579, 3cc2:0, 1573-1579, 3cc4:0, 1573-1579, 3cc7:0, 1573-1579, 3cce:0, 1573-1579, 3ccj:0, 1573-1579, 3ccl:0, 1573-1579, 3ccm:0, 1573-1579, 3ccq:0, 1573-1579, 3ccr:0, 1573-1579, 3ccs:0, 1573-1579, 3ccu:0, 1573-1579, 3ccv:0, 1573-1579, 3cd6:0, 1573-1579, 3cma:0, 1573-1579, 3cme:0, 1573-1579, 3cpw:0, 1573-1579
GAGAG
1z58:2, 907-913
GAGCG
1vsa:w, 995-1001, 1vsp:w, 995-1001, 2hgj:A, 994-1000, 2hgq:A, 994-1000, 2hgu:A, 994-1000, 2j01:A, 972-978, 2j03:A, 972-978, 2jl6:A, 999-1005, 2jl8:A, 999-1005, 2v47:A, 972-978, 2v49:A, 972-978, 3d5b:A, 990-996, 3d5d:A, 990-996
UCGAU
3ccr:0, 2712-2718
UUAAG
1ond:0, 2718-2724
UUGAA
2cky:A, 39-45, 2cky:B, 39-45, 3d2g:A, 39-45, 3d2g:B, 39-45, 3d2v:A, 39-45, 3d2v:B, 39-45, 3d2x:A, 39-45, 3d2x:B, 39-45
UUGAU
2gya:0, 2669-2675, 2gyc:0, 2669-2675