Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1535 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 69 structure(s)
Representative structure 1vqo:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DDNBR
Cluster members
AACUA
1p5m:A, 10-16, 1p5p:A, 10-16
GGGCG
1i94:A, 1199-1205
GGUCG
2j01:A, 275-281, 2j03:A, 275-281, 2jl6:A, 275-281, 2jl8:A, 275-281, 2v47:A, 275-281, 2v49:A, 275-281
UGUCA
1ffk:0, 258-264, 1jj2:0, 259-265, 1k73:A, 259-265, 1k8a:A, 259-265, 1k9m:A, 259-265, 1kc8:A, 259-265, 1kd1:A, 259-265, 1kqs:0, 259-265, 1m1k:A, 259-265, 1m90:A, 259-265, 1n8r:A, 259-265, 1nji:A, 259-265, 1q7y:A, 259-265, 1q81:A, 259-265, 1q82:A, 259-265, 1q86:A, 259-265, 1qvf:0, 259-265, 1qvg:0, 259-265, 1s72:0, 259-265, 1vq4:0, 259-265, 1vq5:0, 259-265, 1vq6:0, 259-265, 1vq7:0, 259-265, 1vq8:0, 259-265, 1vq9:0, 259-265, 1vqk:0, 259-265, 1vql:0, 259-265, 1vqm:0, 259-265, 1vqn:0, 259-265, 1vqo:0, 259-265, 1vqp:0, 259-265, 1w2b:0, 259-265, 1yhq:0, 259-265, 1yi2:0, 259-265, 1yij:0, 259-265, 1yit:0, 259-265, 1yj9:0, 259-265, 1yjn:0, 259-265, 1yjw:0, 259-265, 2otj:0, 259-265, 2otl:0, 259-265, 2qa4:0, 259-265, 2qex:0, 259-265, 3cc2:0, 259-265, 3cc4:0, 259-265, 3cc7:0, 259-265, 3cce:0, 259-265, 3ccj:0, 259-265, 3ccl:0, 259-265, 3ccm:0, 259-265, 3ccq:0, 259-265, 3ccr:0, 259-265, 3ccs:0, 259-265, 3ccu:0, 259-265, 3ccv:0, 259-265, 3cd6:0, 259-265, 3cma:0, 259-265, 3cme:0, 259-265, 3cpw:0, 259-265
UUAGG
3bbo:A, 752-758