Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 3725 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 78 structure(s)
Representative structure 3cce:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DRKRH
Cluster members
AGCAA
1ffk:0, 1649-1655, 1jj2:0, 1699-1705, 1k73:A, 1699-1705, 1k8a:A, 1699-1705, 1k9m:A, 1699-1705, 1kc8:A, 1699-1705, 1kd1:A, 1699-1705, 1kqs:0, 1699-1705, 1m1k:A, 1699-1705, 1m90:A, 1699-1705, 1n8r:A, 1699-1705, 1nji:A, 1699-1705, 1q7y:A, 1699-1705, 1q81:A, 1699-1705, 1q82:A, 1699-1705, 1q86:A, 1699-1705, 1qvf:0, 1699-1705, 1qvg:0, 1699-1705, 1s1i:3, 1807-1813, 1s72:0, 1699-1705, 1vq4:0, 1699-1705, 1vq5:0, 1699-1705, 1vq6:0, 1699-1705, 1vq7:0, 1699-1705, 1vq8:0, 1699-1705, 1vq9:0, 1699-1705, 1vqk:0, 1699-1705, 1vql:0, 1699-1705, 1vqm:0, 1699-1705, 1vqn:0, 1699-1705, 1vqo:0, 1699-1705, 1vqp:0, 1699-1705, 1w2b:0, 1699-1705, 1yhq:0, 1699-1705, 1yi2:0, 1699-1705, 1yij:0, 1699-1705, 1yit:0, 1699-1705, 1yj9:0, 1699-1705, 1yjn:0, 1699-1705, 1yjw:0, 1699-1705, 2otj:0, 1699-1705, 2otl:0, 1699-1705, 2qa4:0, 1704-1710, 2qex:0, 1699-1705, 3cc2:0, 1699-1705, 3cc4:0, 1699-1705, 3cc7:0, 1699-1705, 3cce:0, 1699-1705, 3ccj:0, 1699-1705, 3ccl:0, 1699-1705, 3ccm:0, 1699-1705, 3ccq:0, 1699-1705, 3ccr:0, 1699-1705, 3ccs:0, 1699-1705, 3ccu:0, 1699-1705, 3ccv:0, 1699-1705, 3cd6:0, 1699-1705, 3cma:0, 1699-1705, 3cme:0, 1699-1705, 3cpw:0, 1699-1705
GAAGC
1yl3:A, 321-327
GAAGU
1voq:A, 1482-1488, 1vor:B, 268-274, 1vos:A, 1482-1488, 1vou:B, 268-274, 1vov:A, 1482-1488, 1vow:B, 268-274, 1vox:A, 1482-1488, 1voy:B, 268-274, 1voz:A, 1482-1488, 1vp0:B, 268-274
UGCAC
1nkw:0, 2734-2740, 1nwx:0, 2734-2740, 1nwy:0, 2734-2740, 1ond:0, 2733-2739, 2o43:A, 2734-2740, 2o45:A, 2719-2725, 2ogo:0, 2733-2739