Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1419 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 171 structure(s)
Representative structure 1vq9:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BAGUA
Cluster members
CAGUA
1vs6:B, 239-245, 1vs8:B, 239-245, 2aw4:B, 239-245, 2awb:B, 239-245, 2gya:0, 193-199, 2gyc:0, 193-199, 2i2t:B, 239-245, 2i2v:B, 239-245, 2j28:B, 239-245, 2qam:B, 239-245, 2qao:B, 239-245, 2qba:B, 239-245, 2qbc:B, 239-245, 2qbe:B, 239-245, 2qbg:B, 239-245, 2qbi:B, 239-245, 2qbk:B, 239-245, 2qov:B, 239-245, 2qox:B, 239-245, 2qoz:B, 239-245, 2qp1:B, 239-245, 2z4l:B, 239-245, 2z4n:B, 239-245, 3bbx:B, 239-245, 3df2:B, 239-245, 3df4:B, 239-245
GAGUA
1f84:A, 4-10, 1ffk:9, 75-81, 1fqz:A, 3-9, 1jj2:9, 75-81, 1k73:B, 75-81, 1k8a:B, 75-81, 1k9m:B, 75-81, 1kc8:B, 75-81, 1kd1:B, 75-81, 1kqs:9, 75-81, 1m1k:B, 75-81, 1m90:B, 75-81, 1n8r:B, 75-81, 1nbs:B, 79-85, 1nji:B, 75-81, 1q7y:B, 75-81, 1q81:B, 75-81, 1q82:B, 75-81, 1q86:B, 75-81, 1qvf:9, 75-81, 1qvg:9, 75-81, 1s1i:4, 75-81, 1s72:9, 75-81, 1vq4:9, 75-81, 1vq5:9, 75-81, 1vq6:9, 75-81, 1vq7:9, 75-81, 1vq8:9, 75-81, 1vq9:9, 75-81, 1vqk:9, 75-81, 1vql:9, 75-81, 1vqm:9, 75-81, 1vqn:9, 75-81, 1vqo:9, 75-81, 1vqp:9, 75-81, 1vsa:w, 229-235, 1vsp:w, 229-235, 1w2b:9, 75-81, 1yhq:9, 75-81, 1yi2:9, 75-81, 1yij:9, 75-81, 1yit:9, 75-81, 1yj9:9, 75-81, 1yjn:9, 75-81, 1yjw:9, 75-81, 2b66:A, 228-234, 2b9n:A, 228-234, 2b9p:A, 228-234, 2hgj:A, 228-234, 2hgj:A, 396-402, 2hgq:A, 228-234, 2hgq:A, 396-402, 2hgu:A, 228-234, 2hgu:A, 396-402, 2j01:A, 221-227, 2j03:A, 221-227, 2jl6:A, 221-227, 2jl8:A, 221-227, 2otj:9, 75-81, 2otl:9, 75-81, 2qex:9, 75-81, 2v47:A, 221-227, 2v49:A, 221-227, 3cc2:9, 75-81, 3cc4:9, 75-81, 3cc7:9, 75-81, 3cce:9, 75-81, 3ccl:9, 75-81, 3ccm:9, 75-81, 3ccq:9, 75-81, 3ccr:9, 75-81, 3ccs:9, 75-81, 3ccu:9, 75-81, 3ccv:9, 75-81, 3cd6:9, 75-81, 3cma:9, 75-81, 3cme:9, 75-81, 3cpw:9, 75-81, 3d5b:A, 224-230, 3d5d:A, 224-230
UAGUA
1ffk:0, 201-207, 1jj2:0, 202-208, 1k73:A, 202-208, 1k8a:A, 202-208, 1k9m:A, 202-208, 1kc8:A, 202-208, 1kd1:A, 202-208, 1kqs:0, 202-208, 1m1k:A, 202-208, 1m90:A, 202-208, 1n8r:A, 202-208, 1nji:A, 202-208, 1p5n:A, 25-31, 1p5o:A, 49-55, 1p5p:A, 49-55, 1q7y:A, 202-208, 1q81:A, 202-208, 1q82:A, 202-208, 1q86:A, 202-208, 1qvf:0, 202-208, 1qvg:0, 202-208, 1s1i:3, 201-207, 1s72:0, 202-208, 1un6:F, 25-31, 1vq4:0, 202-208, 1vq5:0, 202-208, 1vq6:0, 202-208, 1vq7:0, 202-208, 1vq8:0, 202-208, 1vq9:0, 202-208, 1vqk:0, 202-208, 1vql:0, 202-208, 1vqm:0, 202-208, 1vqn:0, 202-208, 1vqo:0, 202-208, 1vqp:0, 202-208, 1w2b:0, 202-208, 1yhq:0, 202-208, 1yi2:0, 202-208, 1yij:0, 202-208, 1yit:0, 202-208, 1yj9:0, 202-208, 1yjn:0, 202-208, 1yjw:0, 202-208, 2hgh:B, 23-29, 2otj:0, 202-208, 2otl:0, 202-208, 2qa4:0, 202-208, 2qex:0, 202-208, 3cc2:0, 202-208, 3cc4:0, 202-208, 3cc7:0, 202-208, 3cce:0, 202-208, 3ccj:0, 202-208, 3ccl:0, 202-208, 3ccm:0, 202-208, 3ccq:0, 202-208, 3ccr:0, 202-208, 3ccs:0, 202-208, 3ccu:0, 202-208, 3ccv:0, 202-208, 3cd6:0, 202-208, 3cma:0, 202-208, 3cme:0, 202-208, 3cpw:0, 202-208