Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 928 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 85 structure(s)
Representative structure 1q81:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DNVAD
Cluster members
AACAG
1gid:A, 19-25, 1gid:B, 19-25, 1grz:A, 26-32, 1grz:B, 26-32, 1hr2:A, 19-25, 1hr2:B, 20-26, 1x8w:A, 26-32, 1x8w:C, 26-32, 1x8w:D, 26-32, 2r8s:R, 20-26
AGGAA
1ffk:0, 1523-1529, 1jj2:0, 1573-1579, 1k73:A, 1573-1579, 1k8a:A, 1573-1579, 1k9m:A, 1573-1579, 1kc8:A, 1573-1579, 1kd1:A, 1573-1579, 1kqs:0, 1573-1579, 1m1k:A, 1573-1579, 1m90:A, 1573-1579, 1n8r:A, 1573-1579, 1nji:A, 1573-1579, 1q7y:A, 1573-1579, 1q81:A, 1573-1579, 1q82:A, 1573-1579, 1q86:A, 1573-1579, 1qvf:0, 1573-1579, 1qvg:0, 1573-1579, 1s1i:3, 1681-1687, 1s72:0, 1573-1579, 1vq4:0, 1573-1579, 1vq5:0, 1573-1579, 1vq6:0, 1573-1579, 1vq7:0, 1573-1579, 1vq8:0, 1573-1579, 1vqk:0, 1573-1579, 1vql:0, 1573-1579, 1vqm:0, 1573-1579, 1vqn:0, 1573-1579, 1vqo:0, 1573-1579, 1vqp:0, 1573-1579, 1w2b:0, 1573-1579, 1yhq:0, 1573-1579, 1yi2:0, 1573-1579, 1yij:0, 1573-1579, 1yit:0, 1573-1579, 1yj9:0, 1573-1579, 1yjn:0, 1573-1579, 1yjw:0, 1573-1579, 1ysh:F, 27-33, 2j37:Z, 248-254, 2otj:0, 1573-1579, 2qa4:0, 1578-1584, 2qex:0, 1573-1579, 3cc2:0, 1573-1579, 3cc4:0, 1573-1579, 3cc7:0, 1573-1579, 3cce:0, 1573-1579, 3ccj:0, 1573-1579, 3ccl:0, 1573-1579, 3ccm:0, 1573-1579, 3ccq:0, 1573-1579, 3ccr:0, 1573-1579, 3ccs:0, 1573-1579, 3ccu:0, 1573-1579, 3ccv:0, 1573-1579, 3cd6:0, 1573-1579, 3cma:0, 1573-1579, 3cpw:0, 1573-1579
GAGAG
1z58:2, 907-913
UCGAU
3ccr:0, 2712-2718
UGGAU
2b66:A, 2747-2753, 2b9n:A, 2747-2753, 2b9p:A, 2747-2753
UUAAG
1ond:0, 2718-2724
UUGAA
2cky:A, 39-45, 2cky:B, 39-45, 3d2g:A, 39-45, 3d2g:B, 39-45, 3d2v:A, 39-45, 3d2v:B, 39-45, 3d2x:A, 39-45, 3d2x:B, 39-45
UUGAU
2gya:0, 2669-2675, 2gyc:0, 2669-2675