Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1388 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 208 structure(s)
Representative structure 1vq7:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MHNWR
Cluster members
GCAAA
1ffk:0, 1775-1781, 1jj2:0, 1825-1831, 1k73:A, 1825-1831, 1k8a:A, 1825-1831, 1k9m:A, 1825-1831, 1kc8:A, 1825-1831, 1kd1:A, 1825-1831, 1kqs:0, 1825-1831, 1m1k:A, 1825-1831, 1m90:A, 1825-1831, 1n8r:A, 1825-1831, 1nji:A, 1825-1831, 1q7y:A, 1825-1831, 1q81:A, 1825-1831, 1q82:A, 1825-1831, 1q86:A, 1825-1831, 1qvf:0, 1825-1831, 1qvg:0, 1825-1831, 1s1i:3, 1933-1939, 1s72:0, 1825-1831, 1vq4:0, 1825-1831, 1vq5:0, 1825-1831, 1vq6:0, 1825-1831, 1vq7:0, 1825-1831, 1vq8:0, 1825-1831, 1vq9:0, 1825-1831, 1vqk:0, 1825-1831, 1vql:0, 1825-1831, 1vqm:0, 1825-1831, 1vqn:0, 1825-1831, 1vqo:0, 1825-1831, 1vqp:0, 1825-1831, 1vs6:B, 1782-1788, 1vs8:B, 1782-1788, 1w2b:0, 1825-1831, 1yhq:0, 1825-1831, 1yi2:0, 1825-1831, 1yij:0, 1825-1831, 1yit:0, 1825-1831, 1yj9:0, 1825-1831, 1yjn:0, 1825-1831, 1yjw:0, 1825-1831, 2aw4:B, 1782-1788, 2awb:B, 1782-1788, 2gya:0, 1696-1702, 2i2t:B, 1782-1788, 2i2v:B, 1782-1788, 2j28:B, 1782-1788, 2otj:0, 1825-1831, 2otl:0, 1825-1831, 2qa4:0, 1830-1836, 2qam:B, 1782-1788, 2qao:B, 1782-1788, 2qba:B, 1782-1788, 2qbc:B, 1782-1788, 2qbe:B, 1782-1788, 2qbg:B, 1782-1788, 2qbi:B, 1782-1788, 2qbk:B, 1782-1788, 2qex:0, 1825-1831, 2qov:B, 1782-1788, 2qox:B, 1782-1788, 2qoz:B, 1782-1788, 2qp1:B, 1782-1788, 2z4l:B, 1782-1788, 2z4n:B, 1782-1788, 3bbx:B, 1872-1878, 3cc2:0, 1825-1831, 3cc4:0, 1825-1831, 3cc7:0, 1825-1831, 3cce:0, 1825-1831, 3ccj:0, 1825-1831, 3ccl:0, 1825-1831, 3ccm:0, 1825-1831, 3ccq:0, 1825-1831, 3ccr:0, 1825-1831, 3ccs:0, 1825-1831, 3ccu:0, 1825-1831, 3ccv:0, 1825-1831, 3cd6:0, 1825-1831, 3cma:0, 1825-1831, 3cme:0, 1825-1831, 3cpw:0, 1825-1831, 3df2:B, 1782-1788, 3df4:B, 1782-1788
GCCAA
1njm:0, 1723-1729, 1njn:0, 1723-1729, 1njo:0, 1723-1729, 1njp:0, 1723-1729, 1nkw:0, 1723-1729, 1nwx:0, 1723-1729, 1nwy:0, 1723-1729, 1ond:0, 1722-1728, 1p9x:0, 1698-1704, 1pnu:0, 1739-1745, 1pny:0, 1739-1745, 1sm1:0, 1723-1729, 1vor:B, 1739-1745, 1vou:B, 1739-1745, 1vow:B, 1739-1745, 1voy:B, 1739-1745, 1vp0:B, 1739-1745, 1xbp:0, 1723-1729, 2aar:0, 1723-1729, 2d3o:0, 1723-1729, 2o43:A, 1723-1729, 2o45:A, 1720-1726, 2ogm:0, 1723-1729, 2ogn:0, 1723-1729, 2ogo:0, 1722-1728, 2zjp:X, 1701-1707, 2zjq:X, 1701-1707, 2zjr:X, 1698-1704, 3cf5:X, 1701-1707, 3dll:X, 1701-1707
GCGAA
1vsa:w, 1807-1813, 1vsp:w, 1807-1813, 1yl3:A, 1807-1813, 2hgj:A, 1807-1813, 2hgq:A, 1807-1813, 2hgu:A, 1807-1813, 2j01:A, 1724-1730, 2j03:A, 1724-1730, 2jl6:A, 1803-1809, 2jl8:A, 1803-1809, 2v47:A, 1724-1730, 2v49:A, 1724-1730, 3d5b:A, 1802-1808, 3d5d:A, 1802-1808
GUUAG
3cul:D, 50-56, 3cun:C, 50-56
UAGUA
1fjg:A, 1321-1327, 1hnw:A, 1321-1327, 1hnx:A, 1321-1327, 1hnz:A, 1321-1327, 1hr0:A, 1321-1327, 1i94:A, 1324-1330, 1i95:A, 1324-1330, 1i96:A, 1324-1330, 1ibk:A, 1321-1327, 1ibl:A, 1321-1327, 1ibm:A, 1321-1327, 1j5e:A, 1321-1327, 1n32:A, 1321-1327, 1n36:A, 1321-1327, 1pns:A, 1337-1343, 1pnx:A, 1337-1343, 1s1h:A, 1322-1328, 1voq:A, 1337-1343, 1vos:A, 1337-1343, 1vov:A, 1337-1343, 1vox:A, 1337-1343, 1voz:A, 1337-1343, 1vs5:A, 1340-1346, 1vs7:A, 1340-1346, 1xmo:A, 1316-1322, 1xmq:A, 1316-1322, 1xnq:A, 1316-1322, 1xnr:A, 1316-1322, 2avy:A, 1340-1346, 2aw7:A, 1340-1346, 2b64:A, 1321-1327, 2b9m:A, 1321-1327, 2b9o:A, 1321-1327, 2e5l:A, 1322-1328, 2gy9:A, 1303-1309, 2hgi:A, 1321-1327, 2hgp:A, 1321-1327, 2hgr:A, 1321-1327, 2hhh:A, 1321-1327, 2i2p:A, 1340-1346, 2i2u:A, 1340-1346, 2j00:A, 1321-1327, 2j02:A, 1321-1327, 2jl5:A, 1321-1327, 2jl7:A, 1321-1327, 2ow8:y, 1321-1327, 2qal:A, 1340-1346, 2qan:A, 1340-1346, 2qb9:A, 1340-1346, 2qbb:A, 1340-1346, 2qbd:A, 1340-1346, 2qbf:A, 1340-1346, 2qbh:A, 1340-1346, 2qbj:A, 1340-1346, 2qnh:y, 1321-1327, 2qou:A, 1340-1346, 2qow:A, 1340-1346, 2qoy:A, 1340-1346, 2qp0:A, 1340-1346, 2uu9:A, 1321-1327, 2uua:A, 1321-1327, 2uub:A, 1321-1327, 2uuc:A, 1321-1327, 2uxb:A, 1321-1327, 2uxc:A, 1321-1327, 2uxd:A, 1299-1305, 2v46:A, 1321-1327, 2v48:A, 1321-1327, 2vqe:A, 1321-1327, 2vqf:A, 1321-1327, 2z4k:A, 1340-1346, 2z4m:A, 1340-1346, 3bbn:A, 1287-1293, 3d5a:A, 1321-1327, 3d5c:A, 1321-1327, 3df1:A, 1340-1346, 3df3:A, 1340-1346