Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 2600 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 97 structure(s)
Representative structure 2jl5:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence RWBWR
Cluster members
AUGAA
1vs6:B, 2829-2835, 1vs8:B, 2829-2835, 2aw4:B, 2829-2835, 2awb:B, 2829-2835, 2i2t:B, 2829-2835, 2i2v:B, 2829-2835, 2j28:B, 2829-2835, 2qam:B, 2829-2835, 2qao:B, 2829-2835, 2qba:B, 2829-2835, 2qbc:B, 2829-2835, 2qbe:B, 2829-2835, 2qbg:B, 2829-2835, 2qbi:B, 2829-2835, 2qbk:B, 2829-2835, 2qov:B, 2829-2835, 2qox:B, 2829-2835, 2qoz:B, 2829-2835, 2qp1:B, 2829-2835, 2z4l:B, 2829-2835, 2z4n:B, 2829-2835, 3bbx:B, 3112-3118, 3df2:B, 2829-2835, 3df4:B, 2829-2835
GACUG
1fjg:A, 1133-1139, 1hnw:A, 1133-1139, 1hnx:A, 1133-1139, 1hnz:A, 1133-1139, 1hr0:A, 1133-1139, 1i94:A, 1136-1142, 1i95:A, 1136-1142, 1i96:A, 1136-1142, 1i97:A, 1136-1142, 1ibk:A, 1133-1139, 1ibl:A, 1133-1139, 1ibm:A, 1133-1139, 1j5e:A, 1133-1139, 1n32:A, 1133-1139, 1pns:A, 1149-1155, 1pnx:A, 1149-1155, 1s1h:A, 1134-1140, 1voq:A, 1149-1155, 1vos:A, 1149-1155, 1vov:A, 1149-1155, 1vox:A, 1149-1155, 1voz:A, 1149-1155, 1vs5:A, 1151-1157, 1vs7:A, 1151-1157, 1xmo:A, 1128-1134, 1xmq:A, 1128-1134, 1xnq:A, 1128-1134, 1xnr:A, 1128-1134, 1yl4:A, 1133-1139, 2avy:A, 1151-1157, 2aw7:A, 1151-1157, 2b64:A, 1133-1139, 2b9m:A, 1133-1139, 2b9o:A, 1133-1139, 2e5l:A, 1134-1140, 2gy9:A, 1115-1121, 2gyb:A, 1115-1121, 2hgi:A, 1133-1139, 2hgp:A, 1133-1139, 2hgr:A, 1133-1139, 2i2p:A, 1151-1157, 2i2u:A, 1151-1157, 2jl5:A, 1133-1139, 2jl7:A, 1133-1139, 2ow8:y, 1133-1139, 2qal:A, 1151-1157, 2qan:A, 1151-1157, 2qb9:A, 1151-1157, 2qbb:A, 1151-1157, 2qbd:A, 1151-1157, 2qbf:A, 1151-1157, 2qbh:A, 1151-1157, 2qbj:A, 1151-1157, 2qnh:y, 1133-1139, 2qou:A, 1151-1157, 2qow:A, 1151-1157, 2qoy:A, 1151-1157, 2qp0:A, 1151-1157, 2uu9:A, 1133-1139, 2uua:A, 1133-1139, 2uub:A, 1133-1139, 2uuc:A, 1133-1139, 2uxc:A, 1133-1139, 2z4k:A, 1151-1157, 2z4m:A, 1151-1157, 3bbn:A, 1098-1104, 3d5a:A, 1133-1139, 3d5c:A, 1133-1139, 3df1:A, 1151-1157, 3df3:A, 1151-1157
GUCUA
3d5b:A, 671-677, 3d5d:A, 671-677
GUUAA
2gya:0, 587-593