Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 178 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 133 structure(s)
Representative structure 1i96:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNNNN
Cluster members
ACAAA
1fjg:A, 1224-1230, 1hnw:A, 1224-1230, 1hnx:A, 1224-1230, 1hnz:A, 1224-1230, 1hr0:A, 1224-1230, 1i94:A, 1227-1233, 1i95:A, 1227-1233, 1i96:A, 1227-1233, 1ibk:A, 1224-1230, 1ibl:A, 1224-1230, 1ibm:A, 1224-1230, 1j5e:A, 1224-1230, 1n32:A, 1224-1230, 1n33:A, 1224-1230, 1pns:A, 1240-1246, 1pnx:A, 1240-1246, 1s1h:A, 1225-1231, 1vs5:A, 1243-1249, 1vs7:A, 1243-1249, 1xmo:A, 1219-1225, 1xmq:A, 1219-1225, 1xnq:A, 1219-1225, 1xnr:A, 1219-1225, 1yl4:A, 1224-1230, 2avy:A, 1243-1249, 2aw7:A, 1243-1249, 2e5l:A, 1225-1231, 2hgi:A, 1224-1230, 2hgp:A, 1224-1230, 2hgr:A, 1224-1230, 2hhh:A, 1224-1230, 2ow8:y, 1224-1230, 2qal:A, 1243-1249, 2qan:A, 1243-1249, 2qb9:A, 1243-1249, 2qbb:A, 1243-1249, 2qbd:A, 1243-1249, 2qbf:A, 1243-1249, 2qbh:A, 1243-1249, 2qbj:A, 1243-1249, 2qnh:y, 1224-1230, 2qou:A, 1243-1249, 2qoy:A, 1243-1249, 2uu9:A, 1224-1230, 2uua:A, 1224-1230, 2uub:A, 1224-1230, 2uuc:A, 1224-1230, 2uxb:A, 1224-1230, 2uxc:A, 1224-1230, 2uxd:A, 1202-1208, 2v46:A, 1224-1230, 2v48:A, 1224-1230, 2vqe:A, 1224-1230, 2vqf:A, 1224-1230, 2z4k:A, 1243-1249, 2z4m:A, 1243-1249, 3d5a:A, 1224-1230, 3d5c:A, 1224-1230
AUGAA
3bbo:A, 682-688
CUUGA
1yl3:A, 2610-2616
GAACC
1j5a:A, 230-236, 1jzx:A, 230-236, 1jzy:A, 230-236, 1jzz:A, 230-236, 1k01:A, 230-236, 1njm:0, 230-236, 1njn:0, 230-236, 1njo:0, 230-236, 1njp:0, 230-236, 1nkw:0, 230-236, 1nwx:0, 230-236, 1nwy:0, 230-236, 1ond:0, 230-236, 1pnu:0, 230-236, 1pny:0, 230-236, 1sm1:0, 230-236, 1y69:0, 230-236, 2aar:0, 230-236, 2d3o:0, 230-236, 2o43:A, 230-236, 2o45:A, 230-236, 2ogn:0, 230-236, 2ogo:0, 229-235, 2zjq:X, 230-236, 2zjr:X, 230-236, 3cf5:X, 230-236, 3dll:X, 230-236
GAACU
1j5a:A, 165-171, 1jzx:A, 165-171, 1jzy:A, 165-171, 1jzz:A, 165-171, 1k01:A, 165-171, 1njm:0, 165-171, 1njn:0, 165-171, 1njo:0, 165-171, 1njp:0, 165-171, 1pnu:0, 165-171, 1pny:0, 165-171, 1sm1:0, 165-171, 2d3o:0, 165-171
GAUAA
1vs5:A, 143-149, 1vs7:A, 143-149, 2avy:A, 143-149, 2aw7:A, 143-149, 2qal:A, 143-149, 2qan:A, 143-149, 2qb9:A, 143-149, 2qbb:A, 143-149, 2qbf:A, 143-149, 2qou:A, 143-149, 2qow:A, 143-149, 2qoy:A, 143-149, 2qp0:A, 143-149
GCGAG
1p9x:0, 2215-2221
GGAAG
1vsp:w, 1549-1555
GGAUA
1voq:A, 63-69, 1vos:A, 63-69, 1vov:A, 63-69, 1vox:A, 63-69, 1voz:A, 63-69
GGAUG
2hgj:A, 25-31, 2hgu:A, 25-31
GGGAG
2b64:A, 607-613, 2b9m:A, 607-613, 2b9o:A, 607-613, 2j00:A, 607-613, 2j02:A, 607-613
GGGUU
2o43:A, 2016-2022
UGAAA
2o43:A, 665-671
UGCCA
1ykq:D, 11-17
UUUCA
2i2p:A, 432-438, 2i2u:A, 432-438, 2qbh:A, 432-438