Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1125 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 51 structure(s)
Representative structure 1sm1:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNNHN
Cluster members
AAGUA
2hgj:A, 454-460, 2hgu:A, 454-460
AGCCU
1nkw:0, 797-803, 1nwx:0, 797-803, 1nwy:0, 797-803, 1ond:0, 797-803
CAAUG
1n33:A, 362-368, 1xmo:A, 362-368, 2e5l:A, 363-369, 2hhh:A, 362-368, 2uxb:A, 362-368, 2uxd:A, 346-352
CACUG
2qa4:0, 2586-2592, 2vhm:B, 2627-2633, 2vhn:B, 2627-2633
CCGAG
1fka:A, 1417-1423
CGACU
2o45:A, 1183-1189
CGCUG
1njm:0, 2572-2578, 1njn:0, 2572-2578, 1njo:0, 2572-2578, 1njp:0, 2572-2578, 1pnu:0, 2616-2622, 1pny:0, 2616-2622, 1sm1:0, 2572-2578, 1xbp:0, 2572-2578, 2o43:A, 2572-2578, 2o44:A, 2572-2578, 2o45:A, 2560-2566, 2ogo:0, 2571-2577
CUCUG
2v47:A, 2553-2559, 2v49:A, 2553-2559
GAACC
1sm1:9, 22-28
GAGCC
1n32:A, 1011-1017
GAUCU
2b66:A, 2375-2381, 2b9n:A, 2375-2381, 2b9p:A, 2375-2381
GUUUG
1njm:0, 2381-2387, 1njn:0, 2381-2387, 1njo:0, 2381-2387, 1njp:0, 2381-2387, 1pnu:0, 2425-2431, 1pny:0, 2425-2431, 1sm1:0, 2381-2387, 1xbp:0, 2381-2387, 2d3o:0, 2402-2408, 2o43:A, 2381-2387, 2o45:A, 2369-2375, 2vhm:B, 2436-2442
UAACC
2o44:A, 2092-2098
UCACU
2gyc:0, 1027-1033, 2o43:A, 1045-1051