Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 581 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 129 structure(s)
Representative structure 1n36:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence SSRVK
Cluster members
CGACC
1vs6:B, 1328-1334, 1vs8:B, 1328-1334, 2aw4:B, 1328-1334, 2awb:B, 1328-1334, 2i2t:B, 1328-1334, 2i2v:B, 1328-1334, 2j28:B, 1328-1334, 2qam:B, 1328-1334, 2qao:B, 1328-1334, 2qba:B, 1328-1334, 2qbc:B, 1328-1334, 2qbe:B, 1328-1334, 2qbg:B, 1328-1334, 2qbi:B, 1328-1334, 2qbk:B, 1328-1334, 2qov:B, 1328-1334, 2qox:B, 1328-1334, 2qoz:B, 1328-1334, 2qp1:B, 1328-1334, 2z4l:B, 1328-1334, 2z4n:B, 1328-1334, 3bbx:B, 1409-1415, 3df2:B, 1328-1334, 3df4:B, 1328-1334
CGGGA
1j5a:A, 1299-1305, 1jzx:A, 1299-1305, 1jzy:A, 1299-1305, 1jzz:A, 1299-1305, 1k01:A, 1299-1305, 1p9x:0, 1267-1273, 1vor:B, 1307-1313, 1vou:B, 1307-1313, 1vp0:B, 1307-1313, 1y69:0, 1291-1297, 1yl3:A, 1368-1374, 2aar:0, 1291-1297, 2d3o:0, 1291-1297, 2hgj:A, 1368-1374, 2hgq:A, 1368-1374, 2hgu:A, 1368-1374, 2j01:A, 1294-1300, 2j03:A, 1294-1300, 2jl6:A, 1373-1379, 2jl8:A, 1373-1379, 2o43:A, 1291-1297, 2o44:A, 1291-1297, 2ogm:0, 1291-1297, 2ogn:0, 1291-1297, 2ogo:0, 1290-1296, 2zjq:X, 1269-1275, 2zjr:X, 1266-1272, 3cf5:X, 1269-1275, 3d5b:A, 1364-1370, 3d5d:A, 1364-1370, 3dll:X, 1269-1275
GCAAC
1fjg:A, 1085-1091, 1hnw:A, 1085-1091, 1hnx:A, 1085-1091, 1hnz:A, 1085-1091, 1hr0:A, 1085-1091, 1i94:A, 1088-1094, 1i95:A, 1088-1094, 1i96:A, 1088-1094, 1ibk:A, 1085-1091, 1ibl:A, 1085-1091, 1ibm:A, 1085-1091, 1j5e:A, 1085-1091, 1n32:A, 1085-1091, 1n33:A, 1085-1091, 1n34:A, 1085-1091, 1n36:A, 1085-1091, 1pns:A, 1101-1107, 1pnx:A, 1101-1107, 1s1h:A, 1086-1092, 1voq:A, 1101-1107, 1vos:A, 1101-1107, 1vov:A, 1101-1107, 1vox:A, 1101-1107, 1voz:A, 1101-1107, 1vs5:A, 1103-1109, 1vs7:A, 1103-1109, 1xmo:A, 1080-1086, 1xmq:A, 1080-1086, 1xnq:A, 1080-1086, 1xnr:A, 1080-1086, 1yl4:A, 1085-1091, 2avy:A, 1103-1109, 2aw7:A, 1103-1109, 2e5l:A, 1086-1092, 2f4v:A, 1085-1091, 2gy9:A, 1067-1073, 2hgi:A, 1085-1091, 2hgp:A, 1085-1091, 2hgr:A, 1085-1091, 2hhh:A, 1085-1091, 2i2p:A, 1103-1109, 2i2u:A, 1103-1109, 2j00:A, 1085-1091, 2j02:A, 1085-1091, 2jl5:A, 1085-1091, 2jl7:A, 1085-1091, 2qal:A, 1103-1109, 2qan:A, 1103-1109, 2qb9:A, 1103-1109, 2qbb:A, 1103-1109, 2qbd:A, 1103-1109, 2qbf:A, 1103-1109, 2qbh:A, 1103-1109, 2qbj:A, 1103-1109, 2qou:A, 1103-1109, 2qow:A, 1103-1109, 2qoy:A, 1103-1109, 2qp0:A, 1103-1109, 2uu9:A, 1085-1091, 2uua:A, 1085-1091, 2uub:A, 1085-1091, 2uuc:A, 1085-1091, 2uxb:A, 1085-1091, 2uxc:A, 1085-1091, 2uxd:A, 1064-1070, 2vhp:A, 1103-1109, 2vqe:A, 1085-1091, 2vqf:A, 1085-1091, 2z4k:A, 1103-1109, 2z4m:A, 1103-1109, 3d5a:A, 1085-1091, 3d5c:A, 1085-1091, 3df1:A, 1103-1109, 3df3:A, 1103-1109