Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 3798 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 73 structure(s)
Representative structure 3ccm:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NSNNN
Cluster members
ACAUC
2vhm:B, 1574-1580
ACCAC
2qal:A, 1460-1466, 2qan:A, 1460-1466, 2qou:A, 1460-1466, 2qow:A, 1460-1466
ACGAA
1ffk:0, 1847-1853, 1jj2:0, 1897-1903, 1k73:A, 1897-1903, 1k8a:A, 1897-1903, 1k9m:A, 1897-1903, 1kc8:A, 1897-1903, 1kd1:A, 1897-1903, 1m1k:A, 1897-1903, 1m90:A, 1897-1903, 1n8r:A, 1897-1903, 1nji:A, 1897-1903, 1q7y:A, 1897-1903, 1q82:A, 1897-1903, 1q86:A, 1897-1903, 1qvf:0, 1897-1903, 1qvg:0, 1897-1903, 1s1i:3, 2005-2011, 1s72:0, 1897-1903, 1vq4:0, 1897-1903, 1vq5:0, 1897-1903, 1vq6:0, 1897-1903, 1vq7:0, 1897-1903, 1vq8:0, 1897-1903, 1vq9:0, 1897-1903, 1vqk:0, 1897-1903, 1vql:0, 1897-1903, 1vqm:0, 1897-1903, 1vqn:0, 1897-1903, 1vqo:0, 1897-1903, 1vqp:0, 1897-1903, 1yhq:0, 1897-1903, 1yi2:0, 1897-1903, 1yij:0, 1897-1903, 1yit:0, 1897-1903, 1yj9:0, 1897-1903, 1yjn:0, 1897-1903, 1yjw:0, 1897-1903, 2otj:0, 1897-1903, 2otl:0, 1897-1903, 2qex:0, 1897-1903, 3cc2:0, 1897-1903, 3cc4:0, 1897-1903, 3cc7:0, 1897-1903, 3cce:0, 1897-1903, 3ccj:0, 1897-1903, 3ccl:0, 1897-1903, 3ccm:0, 1897-1903, 3ccq:0, 1897-1903, 3ccu:0, 1897-1903, 3ccv:0, 1897-1903, 3cma:0, 1897-1903, 3cme:0, 1897-1903, 3cpw:0, 1897-1903
AGUCC
1nkw:0, 1148-1154, 1nwx:0, 1148-1154, 1nwy:0, 1148-1154, 1ond:0, 1148-1154, 2o45:A, 1145-1151
CCGAA
3bbn:A, 1408-1414
CCGAG
2uxd:A, 1408-1414
CGUGA
2f4v:A, 1451-1457
GCCAA
2r8s:R, 112-118
GCCGA
2f4v:A, 1436-1442
GGUAA
3d5b:A, 2788-2794, 3d5d:A, 2788-2794
GGUGU
2vhm:B, 1390-1396
UCAAA
1l9a:B, 100-106
UCUAA
2o43:A, 1525-1531