Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Segment cluster 1700 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 113 structure(s)
Representative structure 1w2b:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence RDHBN
Cluster members
AAACC
1yl3:A, 922-928
AUUCA
2d3o:0, 1108-1114
GAACA
1ffk:0, 1828-1834, 1jj2:0, 1878-1884, 1k73:A, 1878-1884, 1k8a:A, 1878-1884, 1k9m:A, 1878-1884, 1kc8:A, 1878-1884, 1kd1:A, 1878-1884, 1kqs:0, 1878-1884, 1m1k:A, 1878-1884, 1m90:A, 1878-1884, 1n8r:A, 1878-1884, 1nji:A, 1878-1884, 1q7y:A, 1878-1884, 1q81:A, 1878-1884, 1q82:A, 1878-1884, 1q86:A, 1878-1884, 1qvf:0, 1878-1884, 1qvg:0, 1878-1884, 1s1i:3, 1986-1992, 1s72:0, 1878-1884, 1vq4:0, 1878-1884, 1vq5:0, 1878-1884, 1vq6:0, 1878-1884, 1vq7:0, 1878-1884, 1vq8:0, 1878-1884, 1vq9:0, 1878-1884, 1vqk:0, 1878-1884, 1vql:0, 1878-1884, 1vqm:0, 1878-1884, 1vqn:0, 1878-1884, 1vqo:0, 1878-1884, 1vqp:0, 1878-1884, 1w2b:0, 1878-1884, 1yhq:0, 1878-1884, 1yi2:0, 1878-1884, 1yij:0, 1878-1884, 1yit:0, 1878-1884, 1yj9:0, 1878-1884, 1yjn:0, 1878-1884, 1yjw:0, 1878-1884, 2otj:0, 1878-1884, 2otl:0, 1878-1884, 2qa4:0, 1883-1889, 2qex:0, 1878-1884, 3cc2:0, 1878-1884, 3cc4:0, 1878-1884, 3cc7:0, 1878-1884, 3cce:0, 1878-1884, 3ccj:0, 1878-1884, 3ccl:0, 1878-1884, 3ccm:0, 1878-1884, 3ccq:0, 1878-1884, 3ccr:0, 1878-1884, 3ccs:0, 1878-1884, 3ccu:0, 1878-1884, 3ccv:0, 1878-1884, 3cd6:0, 1878-1884, 3cma:0, 1878-1884, 3cme:0, 1878-1884, 3cpw:0, 1878-1884
GAAGU
1fjg:A, 1409-1415, 1hnw:A, 1409-1415, 1hnx:A, 1409-1415, 1hnz:A, 1409-1415, 1hr0:A, 1409-1415, 1i94:A, 1412-1418, 1i95:A, 1412-1418, 1i96:A, 1412-1418, 1ibk:A, 1409-1415, 1ibl:A, 1409-1415, 1ibm:A, 1409-1415, 1j5e:A, 1409-1415, 1n32:A, 1409-1415, 1n33:A, 1409-1415, 1pnx:A, 1425-1431, 1s1h:A, 1410-1416, 1xmo:A, 1403-1409, 1xmq:A, 1403-1409, 1xnq:A, 1403-1409, 1xnr:A, 1403-1409, 1yl4:A, 1409-1415, 2b64:A, 1409-1415, 2b9m:A, 1409-1415, 2b9o:A, 1409-1415, 2e5l:A, 1410-1416, 2hgi:A, 1409-1415, 2hgp:A, 1409-1415, 2hgr:A, 1409-1415, 2hhh:A, 1409-1415, 2j00:A, 1409-1415, 2j02:A, 1409-1415, 2jl5:A, 1409-1415, 2jl7:A, 1409-1415, 2om7:C, 31-37, 2ow8:y, 1409-1415, 2qnh:y, 1409-1415, 2uu9:A, 1409-1415, 2uua:A, 1409-1415, 2uub:A, 1409-1415, 2uuc:A, 1409-1415, 2uxb:A, 1409-1415, 2uxc:A, 1409-1415, 2v46:A, 1409-1415, 2v48:A, 1409-1415, 2vqe:A, 1409-1415, 2vqf:A, 1409-1415, 3d5a:A, 1409-1415, 3d5c:A, 1409-1415
GAUGG
1p9x:0, 1341-1347, 2ogm:0, 1365-1371
GGCUA
1yl3:A, 898-904