Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Segment cluster 1440 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 68 structure(s)
Representative structure 1s1h:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDNH
Cluster members
AAGA
2gya:0, 899-904
AAUC
2b66:A, 2797-2802, 2b9n:A, 2797-2802, 2b9p:A, 2797-2802
AUCA
1fjg:A, 233-238, 1hnw:A, 233-238, 1hnx:A, 233-238, 1hnz:A, 233-238, 1hr0:A, 233-238, 1i95:A, 236-241, 1ibk:A, 233-238, 1ibl:A, 233-238, 1ibm:A, 233-238, 1j5e:A, 233-238, 1n32:A, 233-238, 1n33:A, 233-238, 1pns:A, 237-242, 1s1h:A, 238-243, 1xmo:A, 233-238, 1xmq:A, 233-238, 1xnq:A, 233-238, 1xnr:A, 233-238, 2b64:A, 233-238, 2b9m:A, 233-238, 2b9o:A, 233-238, 2f4v:A, 233-238, 2hgi:A, 233-238, 2hgp:A, 233-238, 2hgr:A, 233-238, 2hhh:A, 233-238, 2j00:A, 233-238, 2j02:A, 233-238, 2jl5:A, 233-238, 2jl7:A, 233-238, 2uu9:A, 233-238, 2uua:A, 233-238, 2uub:A, 233-238, 2uuc:A, 233-238, 2uxb:A, 233-238, 2uxc:A, 233-238, 2uxd:A, 217-222, 2vqe:A, 233-238, 2vqf:A, 233-238, 3d5a:A, 233-238, 3d5c:A, 233-238
AUUA
2gy9:A, 220-225, 2qbd:A, 238-243, 2qbf:A, 238-243, 2qbh:A, 238-243, 2qbj:A, 238-243
CAUC
1ond:0, 2768-2773
GGAC
1j5a:A, 1380-1385, 1jzx:A, 1380-1385, 1jzy:A, 1380-1385, 1jzz:A, 1380-1385, 1k01:A, 1380-1385, 1njm:0, 1372-1377, 1njn:0, 1372-1377, 1njo:0, 1372-1377, 1njp:0, 1372-1377, 1pnu:0, 1388-1393, 1pny:0, 1388-1393, 2zjq:X, 1350-1355, 2zjr:X, 1347-1352
GUAA
2vhm:B, 1185-1190, 2vhn:B, 1185-1190
UUAU
2gya:0, 859-864
UUCA
1vsa:w, 2573-2578