Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(005)-Hairpin cluster 1092 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 77 structure(s)
Representative structure 2otj:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BUVRU
Cluster members
CUGAU
1ffk:0, 1352-1358, 1jj2:0, 1399-1405, 1k73:A, 1399-1405, 1k8a:A, 1399-1405, 1k9m:A, 1399-1405, 1kc8:A, 1399-1405, 1kd1:A, 1399-1405, 1kqs:0, 1399-1405, 1m1k:A, 1399-1405, 1m90:A, 1399-1405, 1n8r:A, 1399-1405, 1nji:A, 1399-1405, 1q7y:A, 1399-1405, 1q81:A, 1399-1405, 1q82:A, 1399-1405, 1q86:A, 1399-1405, 1qvf:0, 1399-1405, 1qvg:0, 1399-1405, 1s1i:3, 1510-1516, 1s72:0, 1399-1405, 1vq4:0, 1399-1405, 1vq5:0, 1399-1405, 1vq6:0, 1399-1405, 1vq7:0, 1399-1405, 1vq8:0, 1399-1405, 1vq9:0, 1399-1405, 1vqk:0, 1399-1405, 1vql:0, 1399-1405, 1vqm:0, 1399-1405, 1vqn:0, 1399-1405, 1vqo:0, 1399-1405, 1vqp:0, 1399-1405, 1yhq:0, 1399-1405, 1yi2:0, 1399-1405, 1yij:0, 1399-1405, 1yit:0, 1399-1405, 1yj9:0, 1399-1405, 1yjn:0, 1399-1405, 1yjw:0, 1399-1405, 2j37:Z, 97-103, 2otj:0, 1399-1405, 2otl:0, 1399-1405, 2qa4:0, 1404-1410, 2qex:0, 1399-1405, 3cc2:0, 1399-1405, 3cc4:0, 1399-1405, 3cc7:0, 1399-1405, 3cce:0, 1399-1405, 3ccj:0, 1399-1405, 3ccl:0, 1399-1405, 3ccm:0, 1399-1405, 3ccr:0, 1399-1405, 3ccs:0, 1399-1405, 3ccu:0, 1399-1405, 3ccv:0, 1399-1405, 3cd6:0, 1399-1405, 3cma:0, 1399-1405, 3cme:0, 1399-1405, 3cpw:0, 1399-1405, 3dkn:F, 16-22
GUCGU
2aar:0, 1271-1277, 2d3o:0, 1271-1277, 2j01:A, 1274-1280, 2j03:A, 1274-1280, 2jl6:A, 1353-1359, 2jl8:A, 1353-1359, 2o44:A, 1271-1277, 2ogm:0, 1271-1277, 2v47:A, 1274-1280, 2v49:A, 1274-1280, 2zjq:X, 1249-1255, 3cf5:X, 1249-1255, 3d5b:A, 1344-1350, 3d5d:A, 1344-1350, 3dll:X, 1249-1255
UUAAU
2qbe:B, 1308-1314, 2qbg:B, 1308-1314