Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Segment cluster 1419 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 182 structure(s)
Representative structure 1qvg:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence MDAH
Cluster members
GAAA
3bbo:A, 1264-1269
GGAA
1vs6:B, 1282-1287, 1vs8:B, 1282-1287, 2aw4:B, 1282-1287, 2awb:B, 1282-1287, 2gya:0, 1222-1227, 2gyc:0, 1222-1227, 2i2t:B, 1282-1287, 2i2v:B, 1282-1287, 2j28:B, 1282-1287, 2qam:B, 1282-1287, 2qao:B, 1282-1287, 2qba:B, 1282-1287, 2qbc:B, 1282-1287, 2qbe:B, 1282-1287, 2qbg:B, 1282-1287, 2qbi:B, 1282-1287, 2qbk:B, 1282-1287, 2qov:B, 1282-1287, 2qox:B, 1282-1287, 2qoz:B, 1282-1287, 2qp1:B, 1282-1287, 2vhm:B, 1282-1287, 2vhn:B, 1282-1287, 2z4l:B, 1282-1287, 2z4n:B, 1282-1287, 3bbx:B, 1363-1368, 3df2:B, 1282-1287, 3df4:B, 1282-1287
GUAA
1j5a:A, 1253-1258, 1jzx:A, 1253-1258, 1jzy:A, 1253-1258, 1jzz:A, 1253-1258, 1k01:A, 1253-1258, 1njm:0, 1245-1250, 1njn:0, 1245-1250, 1njo:0, 1245-1250, 1njp:0, 1245-1250, 1nkw:0, 1245-1250, 1nwx:0, 1245-1250, 1nwy:0, 1245-1250, 1ond:0, 1245-1250, 1p9x:0, 1221-1226, 1pnu:0, 1261-1266, 1pny:0, 1261-1266, 1xbp:0, 1245-1250, 1y69:0, 1245-1250, 2aar:0, 1245-1250, 2b9n:A, 1322-1327, 2b9p:A, 1322-1327, 2d3o:0, 1245-1250, 2j01:A, 1248-1253, 2j03:A, 1248-1253, 2jl6:A, 1327-1332, 2jl8:A, 1327-1332, 2o43:A, 1245-1250, 2o45:A, 1242-1247, 2ogm:0, 1245-1250, 2ogn:0, 1245-1250, 2ogo:0, 1244-1249, 2v47:A, 1248-1253, 2v49:A, 1248-1253, 2zjp:X, 1223-1228, 2zjq:X, 1223-1228, 2zjr:X, 1220-1225, 3cf5:X, 1223-1228, 3d5b:A, 1318-1323, 3d5d:A, 1318-1323, 3dll:X, 1223-1228
UAAU
1ffk:0, 1326-1331, 1jj2:0, 1373-1378, 1k73:A, 1373-1378, 1k8a:A, 1373-1378, 1k9m:A, 1373-1378, 1kc8:A, 1373-1378, 1kd1:A, 1373-1378, 1kqs:0, 1373-1378, 1m1k:A, 1373-1378, 1m90:A, 1373-1378, 1n8r:A, 1373-1378, 1nji:A, 1373-1378, 1q7y:A, 1373-1378, 1q81:A, 1373-1378, 1q82:A, 1373-1378, 1q86:A, 1373-1378, 1qvf:0, 1373-1378, 1qvg:0, 1373-1378, 1s1i:3, 1484-1489, 1s72:0, 1373-1378, 1vq4:0, 1373-1378, 1vq5:0, 1373-1378, 1vq6:0, 1373-1378, 1vq7:0, 1373-1378, 1vq8:0, 1373-1378, 1vq9:0, 1373-1378, 1vqk:0, 1373-1378, 1vql:0, 1373-1378, 1vqm:0, 1373-1378, 1vqn:0, 1373-1378, 1vqo:0, 1373-1378, 1vqp:0, 1373-1378, 1w2b:0, 1373-1378, 1yhq:0, 1373-1378, 1yi2:0, 1373-1378, 1yij:0, 1373-1378, 1yit:0, 1373-1378, 1yj9:0, 1373-1378, 1yjn:0, 1373-1378, 1yjw:0, 1373-1378, 2otj:0, 1373-1378, 2otl:0, 1373-1378, 2qa4:0, 1378-1383, 2qex:0, 1373-1378, 3cc2:0, 1373-1378, 3cc4:0, 1373-1378, 3cc7:0, 1373-1378, 3cce:0, 1373-1378, 3ccj:0, 1373-1378, 3ccl:0, 1373-1378, 3ccm:0, 1373-1378, 3ccq:0, 1373-1378, 3ccr:0, 1373-1378, 3ccs:0, 1373-1378, 3ccu:0, 1373-1378, 3ccv:0, 1373-1378, 3cd6:0, 1373-1378, 3cma:0, 1373-1378, 3cme:0, 1373-1378, 3cpw:0, 1373-1378
UUAC
1fjg:A, 1187-1192, 1hnw:A, 1187-1192, 1hnx:A, 1187-1192, 1hnz:A, 1187-1192, 1hr0:A, 1187-1192, 1i95:A, 1190-1195, 1i96:A, 1190-1195, 1i97:A, 1190-1195, 1ibk:A, 1187-1192, 1ibl:A, 1187-1192, 1ibm:A, 1187-1192, 1j5e:A, 1187-1192, 1n32:A, 1187-1192, 1n33:A, 1187-1192, 1pns:A, 1203-1208, 1pnx:A, 1203-1208, 1s1h:A, 1188-1193, 1vs7:A, 1206-1211, 1xmo:A, 1182-1187, 1xmq:A, 1182-1187, 1xnq:A, 1182-1187, 1xnr:A, 1182-1187, 2aw7:A, 1206-1211, 2e5l:A, 1188-1193, 2hhh:A, 1187-1192, 2i2p:A, 1206-1211, 2i2u:A, 1206-1211, 2j00:A, 1187-1192, 2j02:A, 1187-1192, 2jl5:A, 1187-1192, 2jl7:A, 1187-1192, 2qal:A, 1206-1211, 2qan:A, 1206-1211, 2qb9:A, 1206-1211, 2qbb:A, 1206-1211, 2qbd:A, 1206-1211, 2qbf:A, 1206-1211, 2qbh:A, 1206-1211, 2qbj:A, 1206-1211, 2qow:A, 1206-1211, 2qp0:A, 1206-1211, 2uu9:A, 1187-1192, 2uua:A, 1187-1192, 2uub:A, 1187-1192, 2uuc:A, 1187-1192, 2uxb:A, 1187-1192, 2uxc:A, 1187-1192, 2uxd:A, 1165-1170, 2vqe:A, 1187-1192, 2vqf:A, 1187-1192, 2z4k:A, 1206-1211, 2z4m:A, 1206-1211
UUAU
3bbn:A, 1153-1158