Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Hairpin cluster 3131 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 91 structure(s)
Representative structure 2vhm:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDHN
Cluster members
AAAA
3bbo:A, 210-215
AACC
1vs6:B, 225-230, 1vs8:B, 225-230, 2aw4:B, 225-230, 2i2t:B, 225-230, 2i2v:B, 225-230, 2qam:B, 225-230, 2qao:B, 225-230, 2qba:B, 225-230, 2qbc:B, 225-230, 2qbe:B, 225-230, 2qbg:B, 225-230, 2qbi:B, 225-230, 2qbk:B, 225-230, 2qov:B, 225-230, 2qox:B, 225-230, 2z4l:B, 225-230, 2z4n:B, 225-230, 3bbx:B, 225-230, 3df2:B, 225-230, 3df4:B, 225-230
AUUA
1d0t:A, 9-14, 1d0u:A, 9-14
CAAG
2j01:A, 556-561, 2j03:A, 556-561, 2v47:A, 556-561, 2v49:A, 556-561
CUUG
1fjg:A, 182-187, 1hnw:A, 182-187, 1hnx:A, 182-187, 1hnz:A, 182-187, 1hr0:A, 182-187, 1i94:A, 185-190, 1i95:A, 185-190, 1i96:A, 185-190, 1i97:A, 185-190, 1ibk:A, 182-187, 1ibl:A, 182-187, 1ibm:A, 182-187, 1j5e:A, 182-187, 1n32:A, 182-187, 1n33:A, 182-187, 1n34:A, 182-187, 1pns:A, 78-83, 1pnx:A, 78-83, 1s1h:A, 184-189, 1xmo:A, 182-187, 1xmq:A, 182-187, 1xnq:A, 182-187, 1xnr:A, 182-187, 1yl4:A, 182-187, 2b64:A, 182-187, 2b9m:A, 182-187, 2b9o:A, 182-187, 2e5l:A, 183-188, 2f4v:A, 182-187, 2hgi:A, 182-187, 2hgp:A, 182-187, 2hgr:A, 182-187, 2jl5:A, 182-187, 2jl7:A, 182-187, 2qnh:y, 182-187, 2uu9:A, 182-187, 2uua:A, 182-187, 2uub:A, 182-187, 2uuc:A, 182-187, 2uxb:A, 182-187, 2uxc:A, 182-187, 2vqe:A, 182-187, 2vqf:A, 182-187
GAAA
2zjp:X, 550-555, 2zjr:X, 550-555
GAAU
2d3o:0, 202-207
UGUU
2oj8:A, 2-7
UUAU
1vs8:B, 1156-1161, 2aw4:B, 1156-1161, 2awb:B, 1156-1161, 2i2t:B, 1156-1161, 2i2v:B, 1156-1161, 2j28:B, 1156-1161, 2qao:B, 1156-1161, 2qbc:B, 1156-1161, 2qbg:B, 1156-1161, 2qbk:B, 1156-1161, 2qov:B, 1156-1161, 2qp1:B, 1156-1161, 2vhm:B, 1156-1161, 2z4n:B, 1156-1161, 3bbx:B, 1237-1242, 3df4:B, 1156-1161
UUCG
1fka:A, 410-415