Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Segment cluster 4512 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 181 structure(s)
Representative structure 2z4m:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNHN
Cluster members
AACC
3bbn:A, 1087-1092
AACU
1vs5:A, 1140-1145, 2avy:A, 1140-1145, 2aw7:A, 1140-1145, 2qal:A, 1140-1145, 2qan:A, 1140-1145, 2qb9:A, 1140-1145, 2qbb:A, 1140-1145, 2qbd:A, 1140-1145, 2qbf:A, 1140-1145, 2qbh:A, 1140-1145, 2qbj:A, 1140-1145, 2qou:A, 1140-1145, 2qow:A, 1140-1145, 2qoy:A, 1140-1145, 2qp0:A, 1140-1145, 2vho:A, 1140-1145, 2z4k:A, 1140-1145, 2z4m:A, 1140-1145, 3df1:A, 1140-1145, 3df3:A, 1140-1145
CAAU
1fjg:A, 362-367, 1hnw:A, 362-367, 1hnx:A, 362-367, 1hnz:A, 362-367, 1hr0:A, 362-367, 1i94:A, 365-370, 1i95:A, 365-370, 1i96:A, 365-370, 1i97:A, 365-370, 1ibk:A, 362-367, 1ibl:A, 362-367, 1ibm:A, 362-367, 1j5e:A, 362-367, 1n32:A, 362-367, 1pns:A, 366-371, 1pnx:A, 366-371, 1s1h:A, 367-372, 1vs5:A, 367-372, 1vs7:A, 367-372, 1xmq:A, 362-367, 1xnq:A, 362-367, 1xnr:A, 362-367, 1yl4:A, 362-367, 2avy:A, 367-372, 2aw7:A, 367-372, 2b64:A, 362-367, 2b9m:A, 362-367, 2b9o:A, 362-367, 2gy9:A, 349-354, 2gyb:A, 349-354, 2hgi:A, 362-367, 2hgp:A, 362-367, 2hgr:A, 362-367, 2i2p:A, 367-372, 2i2u:A, 367-372, 2jl5:A, 362-367, 2jl7:A, 362-367, 2qal:A, 367-372, 2qan:A, 367-372, 2qb9:A, 367-372, 2qbb:A, 367-372, 2qbd:A, 367-372, 2qbf:A, 367-372, 2qbh:A, 367-372, 2qbj:A, 367-372, 2qou:A, 367-372, 2qow:A, 367-372, 2qoy:A, 367-372, 2qp0:A, 367-372, 2uu9:A, 362-367, 2uua:A, 362-367, 2uub:A, 362-367, 2uuc:A, 362-367, 2uxc:A, 362-367, 2v46:A, 362-367, 2v48:A, 362-367, 2vqe:A, 362-367, 2vqf:A, 362-367, 2z4k:A, 367-372, 2z4m:A, 367-372, 3bbn:A, 337-342, 3df1:A, 367-372, 3df3:A, 367-372
CGCU
1j5a:A, 2580-2585, 1jzx:A, 2580-2585, 1jzy:A, 2580-2585, 1jzz:A, 2580-2585, 1k01:A, 2580-2585, 1p9x:0, 2547-2552
GAAA
1pnu:9, 54-59, 1pny:9, 54-59, 1xbp:9, 54-59, 2qam:A, 54-59, 2qao:A, 54-59, 2qoz:A, 54-59, 2qp1:A, 54-59, 2z4l:A, 54-59, 2z4n:A, 54-59
GCUU
1w2b:0, 2387-2392
GUUU
1vs6:B, 2436-2441, 1vs8:B, 2436-2441, 1yl3:A, 2465-2470, 2aar:0, 2381-2386, 2aw4:B, 2436-2441, 2awb:B, 2436-2441, 2gyc:0, 2351-2356, 2j28:B, 2436-2441, 2ogo:0, 2380-2385, 2qam:B, 2436-2441, 2qao:B, 2436-2441, 2qba:B, 2436-2441, 2qbc:B, 2436-2441, 2qbe:B, 2436-2441, 2qbg:B, 2436-2441, 2qbi:B, 2436-2441, 2qbk:B, 2436-2441, 2qox:B, 2436-2441, 2v47:A, 2362-2367, 2v49:A, 2362-2367, 2z4l:B, 2436-2441, 2z4n:B, 2436-2441, 3bbx:B, 2719-2724, 3df2:B, 2436-2441, 3df4:B, 2436-2441
UAAG
1ffk:9, 54-59, 1jj2:9, 54-59, 1k73:B, 54-59, 1k8a:B, 54-59, 1k9m:B, 54-59, 1kc8:B, 54-59, 1kd1:B, 54-59, 1kqs:9, 54-59, 1m1k:B, 54-59, 1m90:B, 54-59, 1n8r:B, 54-59, 1nji:B, 54-59, 1q7y:B, 54-59, 1q81:B, 54-59, 1q82:B, 54-59, 1q86:B, 54-59, 1qvf:9, 54-59, 1qvg:9, 54-59, 1s1i:4, 54-59, 1s72:9, 54-59, 1vq4:9, 54-59, 1vq5:9, 54-59, 1vq6:9, 54-59, 1vq7:9, 54-59, 1vq8:9, 54-59, 1vq9:9, 54-59, 1vqk:9, 54-59, 1vql:9, 54-59, 1vqm:9, 54-59, 1vqn:9, 54-59, 1vqo:9, 54-59, 1vqp:9, 54-59, 1w2b:9, 54-59, 1yhq:9, 54-59, 1yi2:9, 54-59, 1yij:9, 54-59, 1yit:9, 54-59, 1yj9:9, 54-59, 1yjn:9, 54-59, 1yjw:9, 54-59, 2otj:9, 54-59, 2otl:9, 54-59, 2qex:9, 54-59, 3cc2:9, 54-59, 3cc4:9, 54-59, 3cc7:9, 54-59, 3cce:9, 54-59, 3ccl:9, 54-59, 3ccm:9, 54-59, 3ccq:9, 54-59, 3ccu:9, 54-59, 3ccv:9, 54-59, 3cd6:9, 54-59, 3cma:9, 54-59, 3cme:9, 54-59, 3cpw:9, 54-59