Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 5061 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 218 structure(s)
Representative structure 2o43:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
AAU
1c2w:B, 1551-1555, 1f1t:A, 29-33, 1q8n:A, 29-33
AGG
1ffk:0, 856-860, 1j5a:A, 741-745, 1jj2:0, 860-864, 1jzx:A, 741-745, 1jzy:A, 741-745, 1jzz:A, 741-745, 1k01:A, 741-745, 1k73:A, 860-864, 1k8a:A, 860-864, 1k9m:A, 860-864, 1kc8:A, 860-864, 1kd1:A, 860-864, 1kqs:0, 860-864, 1m1k:A, 860-864, 1m90:A, 860-864, 1n8r:A, 860-864, 1nji:A, 860-864, 1njm:0, 736-740, 1njn:0, 736-740, 1njo:0, 736-740, 1njp:0, 736-740, 1ond:0, 736-740, 1p9x:0, 713-717, 1pnu:0, 736-740, 1pny:0, 736-740, 1q7y:A, 860-864, 1q81:A, 860-864, 1q82:A, 860-864, 1q86:A, 860-864, 1qvf:0, 860-864, 1qvg:0, 860-864, 1s1i:3, 859-863, 1s72:0, 860-864, 1sm1:0, 736-740, 1vq4:0, 860-864, 1vq5:0, 860-864, 1vq6:0, 860-864, 1vq7:0, 860-864, 1vq8:0, 860-864, 1vq9:0, 860-864, 1vqk:0, 860-864, 1vql:0, 860-864, 1vqm:0, 860-864, 1vqn:0, 860-864, 1vqo:0, 860-864, 1vqp:0, 860-864, 1vsa:w, 799-803, 1vsp:w, 799-803, 1w2b:0, 860-864, 1xbp:0, 736-740, 1y69:0, 736-740, 1yhq:0, 860-864, 1yi2:0, 860-864, 1yij:0, 860-864, 1yit:0, 860-864, 1yj9:0, 860-864, 1yjn:0, 860-864, 1yjw:0, 860-864, 2aar:0, 736-740, 2b66:A, 798-802, 2b9n:A, 798-802, 2b9p:A, 798-802, 2d3o:0, 736-740, 2j01:A, 782-786, 2j03:A, 782-786, 2jl6:A, 809-813, 2jl8:A, 809-813, 2o43:A, 736-740, 2o44:A, 736-740, 2ogm:0, 736-740, 2ogo:0, 735-739, 2otj:0, 860-864, 2otl:0, 860-864, 2qa4:0, 859-863, 2qex:0, 860-864, 2zjp:X, 714-718, 2zjq:X, 714-718, 2zjr:X, 714-718, 3cc2:0, 860-864, 3cc4:0, 860-864, 3cc7:0, 860-864, 3cce:0, 860-864, 3ccj:0, 860-864, 3ccl:0, 860-864, 3ccm:0, 860-864, 3ccq:0, 860-864, 3ccr:0, 860-864, 3ccs:0, 860-864, 3ccu:0, 860-864, 3ccv:0, 860-864, 3cd6:0, 860-864, 3cf5:X, 714-718, 3cma:0, 860-864, 3cme:0, 860-864, 3cpw:0, 860-864, 3d5b:A, 794-798, 3d5d:A, 794-798, 3dll:X, 714-718
AGU
2b64:A, 240-244
AUU
1c2w:B, 844-848
CAA
1c2w:B, 2466-2470, 1c2w:B, 875-879
CAU
1j5a:A, 2611-2615, 1jzx:A, 2611-2615, 1jzy:A, 2611-2615, 1jzz:A, 2611-2615, 1k01:A, 2611-2615, 1p9x:0, 2578-2582, 1y69:0, 2603-2607, 1z58:2, 2582-2586, 2aar:0, 2603-2607, 2d3o:0, 2624-2628, 2o43:A, 2603-2607, 2o44:A, 2603-2607, 2o45:A, 2591-2595, 2ogm:0, 2603-2607, 2ogn:0, 2603-2607, 2ogo:0, 2602-2606, 2zjp:X, 2514-2518, 2zjq:X, 2514-2518, 2zjr:X, 2511-2515, 3cf5:X, 2514-2518, 3dll:X, 2514-2518
CGA
3d0u:A, 75-79, 3d0x:A, 75-79, 3dig:X, 78-82, 3dil:A, 78-82, 3dim:A, 78-82, 3dio:X, 78-82, 3diq:A, 78-82, 3dir:A, 78-82, 3dis:A, 78-82, 3dix:A, 78-82, 3diy:A, 78-82, 3diz:A, 78-82, 3dj0:A, 78-82, 3dj2:A, 78-82
CGU
1vq8:0, 2610-2614, 1vq9:0, 2610-2614, 1vqm:0, 2610-2614, 1vqn:0, 2610-2614, 1vqp:0, 2610-2614, 3ccm:0, 2610-2614
GAC
1c2w:B, 2480-2484
GAG
1c2w:B, 1357-1361, 1z58:2, 590-594, 2aar:0, 596-600, 2d3o:0, 596-600, 2o43:A, 596-600, 2ogm:0, 596-600, 2v46:A, 524-528, 2v48:A, 524-528, 2vhn:B, 635-639, 2zjr:X, 574-578, 3dll:X, 574-578
GAU
1c2w:B, 1376-1380
GCG
1yl4:A, 1198-1202, 2b64:A, 1198-1202, 2b9o:A, 1198-1202, 2hgp:A, 1198-1202, 2ow8:y, 1198-1202, 2qnh:y, 1198-1202
GGG
1vs6:B, 773-777, 1vs8:B, 773-777, 2aw4:B, 773-777, 2awb:B, 773-777, 2i2t:B, 773-777, 2i2v:B, 773-777, 2j28:B, 773-777, 2qam:B, 773-777, 2qao:B, 773-777, 2qba:B, 773-777, 2qbc:B, 773-777, 2qbe:B, 773-777, 2qbg:B, 773-777, 2qbi:B, 773-777, 2qbk:B, 773-777, 2qov:B, 773-777, 2qox:B, 773-777, 2qoz:B, 773-777, 2qp1:B, 773-777, 2vhm:B, 773-777, 2vhn:B, 773-777, 2z4l:B, 773-777, 2z4n:B, 773-777, 3bbx:B, 773-777, 3df2:B, 773-777, 3df4:B, 773-777
GUA
1c2w:B, 1370-1374, 1ebs:A, 22-26
GUU
3bbn:A, 1027-1031
UAA
1c2w:B, 1202-1206, 1yl3:A, 2687-2691, 2hgu:A, 2701-2705, 2j01:A, 2589-2593, 2j03:A, 2589-2593, 2jl6:A, 2668-2672, 2jl8:A, 2668-2672, 2v49:A, 2584-2588, 3d5b:A, 2696-2700, 3d5d:A, 2696-2700
UCU
1uud:B, 6-10, 1uui:B, 6-10
UGA
1vsa:w, 2853-2857, 1vsp:w, 2853-2857, 3bwp:A, 218-222, 3ccm:0, 1132-1136, 3eog:A, 232-236, 3eoh:A, 233-237
UUA
1c2w:B, 930-934
UUU
1foq:A, 65-69, 1foq:B, 65-69, 1foq:C, 65-69, 1foq:D, 65-69, 1foq:E, 65-69