Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 5938 (cutoff=3.0 Å)
Cluster size 347 structure(s)
Representative structure 2qbi:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
AAA
1fjg:A, 196-200, 1hnw:A, 196-200, 1hnx:A, 196-200, 1hnz:A, 196-200, 1hr0:A, 196-200, 1i94:A, 199-203, 1i95:A, 199-203, 1i96:A, 199-203, 1ibk:A, 196-200, 1ibl:A, 196-200, 1ibm:A, 196-200, 1j5e:A, 196-200, 1n32:A, 196-200, 1n33:A, 196-200, 1n36:A, 196-200, 1pns:A, 189-193, 1pnx:A, 189-193, 1s1h:A, 198-202, 1vs6:B, 343-347, 1vs8:B, 343-347, 1xmo:A, 196-200, 1xmq:A, 196-200, 1xnq:A, 196-200, 1xnr:A, 196-200, 2aw4:B, 343-347, 2awb:B, 343-347, 2e5l:A, 197-201, 2f4v:A, 196-200, 2hgi:A, 196-200, 2hgp:A, 196-200, 2hgr:A, 196-200, 2hhh:A, 196-200, 2i2t:B, 343-347, 2i2v:B, 343-347, 2j00:A, 196-200, 2j02:A, 196-200, 2j28:B, 343-347, 2jl5:A, 196-200, 2jl7:A, 196-200, 2ow8:y, 196-200, 2qam:B, 343-347, 2qao:B, 343-347, 2qbc:B, 343-347, 2qbg:B, 343-347, 2qbk:B, 343-347, 2qnh:y, 196-200, 2qov:B, 343-347, 2qox:B, 343-347, 2qoz:B, 343-347, 2qp1:B, 343-347, 2uu9:A, 196-200, 2uua:A, 196-200, 2uub:A, 196-200, 2uuc:A, 196-200, 2uxb:A, 196-200, 2uxc:A, 196-200, 2uxd:A, 180-184, 2vqe:A, 196-200, 2vqf:A, 196-200, 2z4l:B, 343-347, 2z4n:B, 343-347, 3bbx:B, 343-347, 3d5a:A, 196-200, 3d5c:A, 196-200, 3df2:B, 343-347, 3df4:B, 343-347
AGA
1njm:0, 932-936, 1njn:0, 932-936, 1njo:0, 932-936, 1njp:0, 932-936, 1nkw:0, 932-936, 1nwx:0, 932-936, 1nwy:0, 932-936, 1ond:0, 932-936, 1pnu:0, 948-952, 1pny:0, 948-952, 1sm1:0, 932-936, 1vor:B, 948-952, 1vou:B, 948-952, 1voy:B, 948-952, 1vs6:B, 971-975, 1vs8:B, 971-975, 1y69:0, 932-936, 2aar:0, 932-936, 2aw4:B, 971-975, 2awb:B, 971-975, 2d3o:0, 932-936, 2i2t:B, 971-975, 2i2v:B, 971-975, 2j01:A, 989-993, 2j03:A, 989-993, 2j28:B, 971-975, 2jl5:A, 130-134, 2jl6:A, 1016-1020, 2jl7:A, 130-134, 2jl8:A, 1016-1020, 2o43:A, 932-936, 2o45:A, 929-933, 2ogm:0, 932-936, 2ogn:0, 932-936, 2ogo:0, 931-935, 2qam:B, 971-975, 2qao:B, 971-975, 2qba:B, 971-975, 2qbc:B, 971-975, 2qbe:B, 971-975, 2qbg:B, 971-975, 2qbi:B, 971-975, 2qbk:B, 971-975, 2qov:B, 971-975, 2qox:B, 971-975, 2qoz:B, 971-975, 2qp1:B, 971-975, 2z4l:B, 971-975, 2z4n:B, 971-975, 2zjp:X, 910-914, 2zjq:X, 910-914, 2zjr:X, 907-911, 3bbx:B, 1049-1053, 3cf5:X, 910-914, 3d5b:A, 1007-1011, 3d5d:A, 1007-1011, 3df2:B, 971-975, 3df4:B, 971-975, 3dll:X, 910-914
AGU
1vor:B, 2579-2583, 1voy:B, 2579-2583
CAG
2hgj:A, 722-726
CGA
1c2w:B, 1108-1112, 1xbp:0, 2241-2245
CGC
2cky:A, 64-68, 2cky:B, 64-68, 3d2g:A, 64-68, 3d2g:B, 64-68, 3d2v:A, 64-68, 3d2v:B, 64-68, 3d2x:A, 64-68, 3d2x:B, 64-68
CGU
2gdi:X, 67-71, 2gdi:Y, 67-71, 2hoj:A, 67-71, 2hok:A, 69-73, 2hol:A, 67-71, 2hom:A, 68-72, 2hoo:A, 68-72
CUG
3bbx:B, 3018-3022
GAA
1c2w:B, 2731-2735, 2j01:A, 356-360, 2j03:A, 356-360, 2jl6:A, 356-360, 2jl8:A, 356-360, 3d2g:A, 47-51, 3d5b:A, 363-367, 3d5d:A, 363-367
GAC
1ffk:0, 1453-1457, 1s1i:3, 1611-1615, 2d6f:F, 44-48
GAU
1vs6:B, 1504-1508, 1vs8:B, 1504-1508, 1vsp:w, 1226-1230, 2aw4:B, 1504-1508, 2awb:B, 1504-1508, 2hok:A, 52-56, 2hom:A, 51-55, 2hoo:A, 51-55, 2i2t:B, 1504-1508, 2i2v:B, 1504-1508, 2j01:A, 1151-1155, 2j03:A, 1151-1155, 2j28:B, 1504-1508, 2jl6:A, 1230-1234, 2jl8:A, 1230-1234, 2qam:B, 1504-1508, 2qao:B, 1504-1508, 2qba:B, 1504-1508, 2qbc:B, 1504-1508, 2qbe:B, 1504-1508, 2qbg:B, 1504-1508, 2qbi:B, 1504-1508, 2qbk:B, 1504-1508, 2qov:B, 1504-1508, 2qox:B, 1504-1508, 2qoz:B, 1504-1508, 2qp1:B, 1504-1508, 2v47:A, 1151-1155, 2v49:A, 1151-1155, 2vhm:B, 1504-1508, 2vhn:B, 1504-1508, 2z4l:B, 1504-1508, 2z4n:B, 1504-1508, 3bbx:B, 1585-1589, 3d5b:A, 1221-1225, 3d5d:A, 1221-1225, 3df2:B, 1504-1508, 3df4:B, 1504-1508
GCA
2qnh:y, 341-345
GCG
1njm:0, 1595-1599, 1njn:0, 1595-1599, 1njo:0, 1595-1599, 1njp:0, 1595-1599, 1pnu:0, 1611-1615, 1pny:0, 1611-1615, 1vor:B, 1611-1615, 2o45:A, 1592-1596, 3d5b:A, 1664-1668, 3d5d:A, 1664-1668
GGA
1fjg:A, 753-757, 1hnw:A, 753-757, 1hnx:A, 753-757, 1hnz:A, 753-757, 1i95:A, 756-760, 1i96:A, 756-760, 1ibk:A, 753-757, 1ibl:A, 753-757, 1ibm:A, 753-757, 1n32:A, 753-757, 1n33:A, 753-757, 1n34:A, 753-757, 1n36:A, 753-757, 1pnx:A, 767-771, 1vqn:0, 68-72, 1vs5:A, 770-774, 1vs7:A, 770-774, 1xmo:A, 753-757, 1xmq:A, 753-757, 1xnq:A, 753-757, 1xnr:A, 753-757, 1yl4:A, 753-757, 2gy9:A, 740-744, 2gyb:A, 740-744, 2hgi:A, 753-757, 2hgp:A, 753-757, 2hgr:A, 753-757, 2hhh:A, 753-757, 2i2p:A, 770-774, 2i2u:A, 770-774, 2j00:A, 753-757, 2j02:A, 753-757, 2jl5:A, 753-757, 2jl7:A, 753-757, 2qal:A, 770-774, 2qan:A, 770-774, 2qbd:A, 770-774, 2qbf:A, 770-774, 2uua:A, 753-757, 2uub:A, 753-757, 2uuc:A, 753-757, 2uxb:A, 753-757, 2uxc:A, 753-757, 2uxd:A, 731-735, 2vqe:A, 753-757, 2vqf:A, 753-757, 3bbn:A, 717-721, 3bbo:A, 960-964, 3df1:A, 770-774, 3df3:A, 770-774
GGC
1ooa:C, 21-25, 1ooa:D, 21-25, 2v47:A, 1822-1826
GUG
1vs5:A, 1019-1023, 1vs7:A, 1019-1023, 2avy:A, 1019-1023, 2aw7:A, 1019-1023, 2e5l:A, 998-1002, 2i2p:A, 1019-1023, 2i2u:A, 1019-1023, 2qal:A, 1019-1023, 2qan:A, 1019-1023, 2qb9:A, 1019-1023, 2qbb:A, 1019-1023, 2qbh:A, 1019-1023, 2qbj:A, 1019-1023, 2qou:A, 1019-1023, 2qow:A, 1019-1023, 2qoy:A, 1019-1023, 2qp0:A, 1019-1023, 2uu9:A, 997-1001, 2uua:A, 997-1001, 2uub:A, 997-1001, 2uuc:A, 997-1001, 2uxd:A, 976-980, 2z4k:A, 1019-1023, 2z4m:A, 1019-1023, 3d5a:A, 997-1001, 3d5c:A, 997-1001, 3df1:A, 1019-1023, 3df3:A, 1019-1023
UAA
1vs6:B, 1186-1190, 1vs6:B, 81-85, 1vs8:B, 1186-1190, 1y26:X, 9-13, 2aw4:B, 1186-1190, 2awb:B, 1186-1190, 2gya:0, 2166-2170, 2gyc:0, 2166-2170, 2i2t:B, 1186-1190, 2i2v:B, 1186-1190, 2j28:B, 1186-1190, 2qam:B, 1186-1190, 2qao:B, 1186-1190, 2qba:B, 1186-1190, 2qbc:B, 1186-1190, 2qbe:B, 1186-1190, 2qbg:B, 1186-1190, 2qbi:B, 1186-1190, 2qbk:B, 1186-1190, 2qov:B, 1186-1190, 2qox:B, 1186-1190, 2qoz:B, 1186-1190, 2qp1:B, 1186-1190, 2z4l:B, 1186-1190, 2z4n:B, 1186-1190, 3bbx:B, 1267-1271, 3bbx:B, 2519-2523, 3df2:B, 1186-1190, 3df4:B, 1186-1190
UAU
2vhm:B, 2492-2496
UCA
1j5a:A, 2195-2199, 1jzx:A, 2195-2199, 1jzy:A, 2195-2199, 1jzz:A, 2195-2199, 1k01:A, 2195-2199, 1njm:0, 239-243, 1njn:0, 239-243, 1njo:0, 239-243, 1njp:0, 239-243, 1nkw:0, 239-243, 1nwx:0, 239-243, 1nwy:0, 239-243, 1ond:0, 239-243, 1pnu:0, 239-243, 1pny:0, 239-243, 1sm1:0, 239-243, 1xbp:0, 239-243
UGG
2zjp:X, 1969-1973, 3dll:X, 1969-1973
UUA
2hgj:A, 1363-1367, 2hgq:A, 1363-1367, 2hgu:A, 1363-1367
UUC
1vq6:9, 110-114, 1wz2:C, 57-61, 1wz2:D, 57-61, 1yjn:9, 110-114, 3ccr:9, 110-114, 3cd6:9, 110-114, 3cma:9, 110-114, 3cme:9, 110-114