Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 2512 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 114 structure(s)
Representative structure 1vq8:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence HVH
Cluster members
AAA
1c2w:B, 343-347
AAC
3bbo:A, 2650-2654
ACU
2gya:0, 2567-2571, 2gyc:0, 2567-2571
CAU
1j5a:A, 2611-2615, 1jzx:A, 2611-2615, 1jzy:A, 2611-2615, 1jzz:A, 2611-2615, 1k01:A, 2611-2615, 1njm:0, 2603-2607, 1njn:0, 2603-2607, 1njo:0, 2603-2607, 1njp:0, 2603-2607, 1nkw:0, 2603-2607, 1nwx:0, 2603-2607, 1nwy:0, 2603-2607, 1ond:0, 2602-2606, 1p9x:0, 2578-2582, 1pnu:0, 2647-2651, 1pny:0, 2647-2651, 1sm1:0, 2603-2607, 1vor:B, 2647-2651, 1vou:B, 2647-2651, 1vow:B, 2647-2651, 1voy:B, 2647-2651, 1vp0:B, 2647-2651, 1y69:0, 2603-2607, 1z58:2, 2582-2586, 2aar:0, 2603-2607, 2d3o:0, 2624-2628, 2o43:A, 2603-2607, 2o44:A, 2603-2607, 2o45:A, 2591-2595, 2ogm:0, 2603-2607, 2ogn:0, 2603-2607, 2ogo:0, 2602-2606, 2zjp:X, 2514-2518, 2zjq:X, 2514-2518, 2zjr:X, 2511-2515, 3cf5:X, 2514-2518, 3dll:X, 2514-2518
CGU
1ffk:0, 2559-2563, 1jj2:0, 2610-2614, 1k73:A, 2610-2614, 1k8a:A, 2610-2614, 1k9m:A, 2610-2614, 1kc8:A, 2610-2614, 1kd1:A, 2610-2614, 1kqs:0, 2610-2614, 1m1k:A, 2610-2614, 1m90:A, 2610-2614, 1n8r:A, 2610-2614, 1nji:A, 2610-2614, 1q7y:A, 2610-2614, 1q81:A, 2610-2614, 1q82:A, 2610-2614, 1q86:A, 2610-2614, 1qvf:0, 2610-2614, 1qvg:0, 2610-2614, 1s1i:3, 2926-2930, 1s72:0, 2610-2614, 1vq4:0, 2610-2614, 1vq5:0, 2610-2614, 1vq6:0, 2610-2614, 1vq7:0, 2610-2614, 1vq8:0, 2610-2614, 1vq9:0, 2610-2614, 1vqk:0, 2610-2614, 1vql:0, 2610-2614, 1vqm:0, 2610-2614, 1vqn:0, 2610-2614, 1vqo:0, 2610-2614, 1vqp:0, 2610-2614, 1w2b:0, 2610-2614, 1yhq:0, 2610-2614, 1yi2:0, 2610-2614, 1yij:0, 2610-2614, 1yit:0, 2610-2614, 1yj9:0, 2610-2614, 1yjn:0, 2610-2614, 1yjw:0, 2610-2614, 2otj:0, 2610-2614, 2otl:0, 2610-2614, 2qa4:0, 2615-2619, 2qex:0, 2610-2614, 3cc2:0, 2610-2614, 3cc4:0, 2610-2614, 3cc7:0, 2610-2614, 3cce:0, 2610-2614, 3ccj:0, 2610-2614, 3ccl:0, 2610-2614, 3ccm:0, 2610-2614, 3ccq:0, 2610-2614, 3ccr:0, 2610-2614, 3ccs:0, 2610-2614, 3ccu:0, 2610-2614, 3ccv:0, 2610-2614, 3cd6:0, 2610-2614, 3cma:0, 2610-2614, 3cme:0, 2610-2614, 3cpw:0, 2610-2614
UAA
1vsa:w, 2701-2705, 1vsp:w, 2701-2705, 1yl3:A, 2687-2691, 2hgj:A, 2701-2705, 2hgq:A, 2701-2705, 2hgu:A, 2701-2705, 2j01:A, 2589-2593, 2j03:A, 2589-2593, 2jl6:A, 2668-2672, 2jl8:A, 2668-2672, 2v49:A, 2584-2588, 3d5b:A, 2696-2700, 3d5d:A, 2696-2700