Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 7104 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 58 structure(s)
Representative structure 3bbn:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NND
Cluster members
AAA
2a64:A, 173-177
ACA
2j01:A, 1524-1528, 2j03:A, 1524-1528, 2jl6:A, 1603-1607, 2jl8:A, 1603-1607, 2v47:A, 1524-1528, 2v49:A, 1524-1528, 3d5b:A, 1602-1606, 3d5d:A, 1602-1606
AGU
2b64:A, 240-244, 3bbn:A, 215-219
AUU
1c2w:B, 844-848
CAA
1c2w:B, 875-879
CGA
3d0u:A, 75-79, 3d0x:A, 75-79, 3dig:X, 78-82, 3dil:A, 78-82, 3dim:A, 78-82, 3dio:X, 78-82, 3diq:A, 78-82, 3dir:A, 78-82, 3dis:A, 78-82, 3dix:A, 78-82, 3diy:A, 78-82, 3diz:A, 78-82, 3dj0:A, 78-82, 3dj2:A, 78-82
GAA
3bbx:B, 2509-2513
GAG
1z58:2, 590-594, 2aar:0, 596-600, 2d3o:0, 596-600, 2o43:A, 596-600, 2ogm:0, 596-600, 2v46:A, 524-528, 2v48:A, 524-528, 2vhn:B, 635-639, 2zjr:X, 574-578, 3dll:X, 574-578
GAU
1c2w:B, 1376-1380
GCA
1voq:A, 1046-1050, 1vos:A, 1046-1050, 1vov:A, 1046-1050, 1vox:A, 1046-1050, 1voz:A, 1046-1050
GUA
1c2w:B, 1370-1374, 1ebs:A, 22-26, 1etg:A, 25-29
UGA
1c2w:B, 359-363, 2v47:A, 2736-2740, 2v49:A, 2736-2740, 2z4l:B, 2812-2816, 2z4n:B, 2812-2816
UUA
1c2w:B, 930-934
UUU
1foq:A, 65-69, 1foq:B, 65-69, 1foq:C, 65-69, 1foq:D, 65-69, 1foq:E, 65-69