Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 5248 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 420 structure(s)
Representative structure 2ogo:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
ACA
1ffk:0, 2718-2722, 1k73:A, 2769-2773, 1k8a:A, 2769-2773, 1k9m:A, 2769-2773, 1kc8:A, 2769-2773, 1kd1:A, 2769-2773, 1kqs:0, 2769-2773, 1m1k:A, 2769-2773, 1n8r:A, 2769-2773, 1q7y:A, 2769-2773, 1q81:A, 2769-2773, 1q82:A, 2769-2773, 1q86:A, 2769-2773, 1qvf:0, 2769-2773, 1qvg:0, 2769-2773, 1s1i:3, 3085-3089, 1vq4:0, 2769-2773, 1vq5:0, 2769-2773, 1vq6:0, 2769-2773, 1vq7:0, 2769-2773, 1vq8:0, 2769-2773, 1vq9:0, 2769-2773, 1vqk:0, 2769-2773, 1vql:0, 2769-2773, 1vqm:0, 2769-2773, 1vqn:0, 2769-2773, 1vqo:0, 2769-2773, 1vqp:0, 2769-2773, 1yhq:0, 2769-2773, 1yit:0, 2769-2773, 1yj9:0, 2769-2773, 2go5:9, 81-85, 2otj:0, 2769-2773, 2otl:0, 2769-2773, 2qa4:0, 2774-2778, 2qex:0, 2769-2773, 3cc2:0, 2769-2773, 3cc4:0, 2769-2773, 3cc7:0, 2769-2773, 3ccj:0, 2769-2773, 3ccm:0, 2769-2773, 3ccu:0, 2769-2773, 3ccv:0, 2769-2773, 3cma:0, 2769-2773
AGG
2o43:A, 998-1002
AUC
1j5a:A, 2778-2782, 1jzx:A, 2778-2782, 1jzy:A, 2778-2782, 1jzz:A, 2778-2782, 1k01:A, 2778-2782, 1nkw:0, 2770-2774, 1nwx:0, 2770-2774, 1nwy:0, 2770-2774, 1p9x:0, 2745-2749, 1sm1:0, 2770-2774, 1y69:0, 2770-2774, 2aar:0, 2770-2774, 2d3o:0, 2791-2795, 2j01:A, 2758-2762, 2j03:A, 2758-2762, 2jl6:A, 2837-2841, 2jl8:A, 2837-2841, 2o45:A, 2755-2759, 2ogm:0, 2770-2774, 2ogn:0, 2770-2774, 2ogo:0, 2769-2773, 2v47:A, 2753-2757, 2v49:A, 2753-2757, 2zjp:X, 2681-2685, 2zjq:X, 2681-2685, 2zjr:X, 2678-2682, 3cf5:X, 2681-2685, 3d5b:A, 2865-2869, 3d5d:A, 2865-2869, 3dll:X, 2681-2685
CAG
1fjg:A, 1176-1180, 1hnw:A, 1176-1180, 1hnx:A, 1176-1180, 1hnz:A, 1176-1180, 1hr0:A, 1176-1180, 1i94:A, 1179-1183, 1i95:A, 1179-1183, 1i96:A, 1179-1183, 1ibk:A, 1176-1180, 1ibl:A, 1176-1180, 1ibm:A, 1176-1180, 1j5e:A, 1176-1180, 1n32:A, 1176-1180, 1pns:A, 1192-1196, 1pnx:A, 1192-1196, 1s1h:A, 1177-1181, 1xmo:A, 1171-1175, 1xmq:A, 1171-1175, 1xnq:A, 1171-1175, 1xnr:A, 1171-1175, 1yl4:A, 1176-1180, 2b64:A, 1176-1180, 2b9m:A, 1176-1180, 2b9o:A, 1176-1180, 2e5l:A, 1177-1181, 2f4v:A, 1176-1180, 2hgi:A, 1176-1180, 2hgp:A, 1176-1180, 2hgr:A, 1176-1180, 2hhh:A, 1176-1180, 2j00:A, 1176-1180, 2j02:A, 1176-1180, 2jl5:A, 1176-1180, 2jl7:A, 1176-1180, 2qnh:y, 1176-1180, 2uu9:A, 1176-1180, 2uua:A, 1176-1180, 2uub:A, 1176-1180, 2uuc:A, 1176-1180, 2uxc:A, 1176-1180, 2v46:A, 1176-1180, 2v48:A, 1176-1180, 2vqe:A, 1176-1180, 2vqf:A, 1176-1180, 3d5a:A, 1176-1180, 3d5c:A, 1176-1180
CAU
1vs5:A, 1195-1199, 1vs7:A, 1195-1199, 2avy:A, 1195-1199, 2aw7:A, 1195-1199, 2gy9:A, 1158-1162, 2gyb:A, 1158-1162, 2i2p:A, 1195-1199, 2i2u:A, 1195-1199, 2qal:A, 1195-1199, 2qan:A, 1195-1199, 2qb9:A, 1195-1199, 2qbb:A, 1195-1199, 2qbd:A, 1195-1199, 2qbf:A, 1195-1199, 2qbh:A, 1195-1199, 2qbj:A, 1195-1199, 2qou:A, 1195-1199, 2qow:A, 1195-1199, 2qoy:A, 1195-1199, 2qp0:A, 1195-1199, 2z4k:A, 1195-1199, 2z4m:A, 1195-1199, 3bbn:A, 1142-1146, 3df1:A, 1195-1199, 3df3:A, 1195-1199
CUG
1c2w:B, 1557-1561
GAA
1vsp:w, 2722-2726, 2gya:0, 2156-2160, 2gyc:0, 2156-2160, 2hgj:A, 2722-2726, 2hgu:A, 2722-2726, 2j01:A, 2610-2614, 2j03:A, 2610-2614, 2jl6:A, 2689-2693, 2jl8:A, 2689-2693, 2v49:A, 2605-2609, 3d5b:A, 2717-2721, 3d5d:A, 2717-2721
GAC
1ffk:0, 1453-1457, 1jj2:0, 1500-1504, 1k73:A, 1500-1504, 1k8a:A, 1500-1504, 1k9m:A, 1500-1504, 1kc8:A, 1500-1504, 1kd1:A, 1500-1504, 1kqs:0, 1500-1504, 1m1k:A, 1500-1504, 1m90:A, 1500-1504, 1n8r:A, 1500-1504, 1nji:A, 1500-1504, 1q7y:A, 1500-1504, 1q81:A, 1500-1504, 1q82:A, 1500-1504, 1q86:A, 1500-1504, 1qvf:0, 1500-1504, 1qvg:0, 1500-1504, 1s1i:3, 1611-1615, 1s72:0, 1500-1504, 1vq4:0, 1500-1504, 1vq5:0, 1500-1504, 1vq6:0, 1500-1504, 1vq7:0, 1500-1504, 1vq8:0, 1500-1504, 1vq9:0, 1500-1504, 1vqk:0, 1500-1504, 1vql:0, 1500-1504, 1vqm:0, 1500-1504, 1vqn:0, 1500-1504, 1vqo:0, 1500-1504, 1vqp:0, 1500-1504, 1w2b:0, 1500-1504, 1yhq:0, 1500-1504, 1yi2:0, 1500-1504, 1yij:0, 1500-1504, 1yit:0, 1500-1504, 1yj9:0, 1500-1504, 1yjn:0, 1500-1504, 1yjw:0, 1500-1504, 2czj:B, 35-39, 2czj:D, 35-39, 2czj:F, 35-39, 2czj:H, 35-39, 2otj:0, 1500-1504, 2otl:0, 1500-1504, 2qa4:0, 1505-1509, 2qex:0, 1500-1504, 3cc2:0, 1500-1504, 3cc4:0, 1500-1504, 3cc7:0, 1500-1504, 3cce:0, 1500-1504, 3ccj:0, 1500-1504, 3ccl:0, 1500-1504, 3ccm:0, 1500-1504, 3ccq:0, 1500-1504, 3ccr:0, 1500-1504, 3ccs:0, 1500-1504, 3ccu:0, 1500-1504, 3ccv:0, 1500-1504, 3cd6:0, 1500-1504, 3cma:0, 1500-1504, 3cme:0, 1500-1504, 3cpw:0, 1500-1504
GAG
1c2w:B, 1513-1517
GAU
1vs6:B, 1504-1508, 1vs8:B, 1504-1508, 2aw4:B, 1504-1508, 2awb:B, 1504-1508, 2i2t:B, 1504-1508, 2i2v:B, 1504-1508, 2j28:B, 1504-1508, 2qam:B, 1504-1508, 2qao:B, 1504-1508, 2qba:B, 1504-1508, 2qbc:B, 1504-1508, 2qbe:B, 1504-1508, 2qbg:B, 1504-1508, 2qbi:B, 1504-1508, 2qbk:B, 1504-1508, 2qov:B, 1504-1508, 2qox:B, 1504-1508, 2qoz:B, 1504-1508, 2qp1:B, 1504-1508, 2vhm:B, 1504-1508, 2vhn:B, 1504-1508, 2z4l:B, 1504-1508, 2z4n:B, 1504-1508, 3bbx:B, 1585-1589, 3df2:B, 1504-1508, 3df4:B, 1504-1508
GCA
1i94:A, 1033-1037, 1ibl:A, 1030-1034, 1n33:A, 1030-1034, 1xnq:A, 1025-1029, 1xnr:A, 1025-1029, 2a64:A, 190-194, 2hgp:A, 1030-1034, 2hgr:A, 1030-1034, 2v46:A, 1030-1034, 2v48:A, 1030-1034
GGA
1ffk:0, 733-737, 1jj2:0, 737-741, 1k73:A, 737-741, 1k8a:A, 737-741, 1k9m:A, 737-741, 1kc8:A, 737-741, 1kd1:A, 737-741, 1kqs:0, 737-741, 1m1k:A, 737-741, 1m90:A, 737-741, 1n8r:A, 737-741, 1nji:A, 737-741, 1q7y:A, 737-741, 1q81:A, 737-741, 1q82:A, 737-741, 1q86:A, 737-741, 1qvf:0, 737-741, 1qvg:0, 737-741, 1s1i:3, 736-740, 1s72:0, 737-741, 1vq4:0, 737-741, 1vq5:0, 737-741, 1vq6:0, 737-741, 1vq7:0, 737-741, 1vq8:0, 737-741, 1vq9:0, 737-741, 1vqk:0, 737-741, 1vql:0, 737-741, 1vqm:0, 737-741, 1vqn:0, 737-741, 1vqo:0, 737-741, 1vqp:0, 737-741, 1w2b:0, 737-741, 1yhq:0, 737-741, 1yi2:0, 737-741, 1yij:0, 737-741, 1yit:0, 737-741, 1yj9:0, 737-741, 1yjn:0, 737-741, 1yjw:0, 737-741, 2b64:A, 916-920, 2b9m:A, 916-920, 2b9o:A, 916-920, 2otj:0, 737-741, 2otl:0, 737-741, 2qa4:0, 736-740, 2qex:0, 737-741, 3cc2:0, 737-741, 3cc4:0, 737-741, 3cc7:0, 737-741, 3cce:0, 737-741, 3ccj:0, 737-741, 3ccl:0, 737-741, 3ccm:0, 737-741, 3ccq:0, 737-741, 3ccr:0, 737-741, 3ccs:0, 737-741, 3ccu:0, 737-741, 3ccv:0, 737-741, 3cd6:0, 737-741, 3cma:0, 737-741, 3cme:0, 737-741, 3cpw:0, 737-741
GUA
2gya:0, 2406-2410
GUU
1fka:A, 1043-1047, 1n33:A, 1061-1065, 1voq:A, 1077-1081, 1vos:A, 1077-1081, 1vov:A, 1077-1081, 1vox:A, 1077-1081, 1voz:A, 1077-1081, 2f4v:A, 1061-1065, 2gyb:A, 1043-1047, 2j00:A, 1061-1065, 2j02:A, 1061-1065, 2ow8:y, 1061-1065, 2v48:A, 1061-1065, 3bbn:A, 1027-1031
UAA
1c2w:B, 1351-1355
UCA
1yl4:A, 1042-1046, 2hgi:A, 1042-1046, 2hgp:A, 1042-1046, 2hgr:A, 1042-1046
UGU
2a9x:2, 6-10
UUA
2i2t:B, 914-918, 2i2v:B, 914-918, 2qam:B, 914-918, 2qao:B, 914-918, 2qbe:B, 914-918, 2qbg:B, 914-918, 2qbi:B, 914-918, 2qov:B, 914-918, 2qox:B, 914-918, 2qoz:B, 914-918, 2qp1:B, 914-918, 2z4l:B, 914-918, 2z4n:B, 914-918, 3df2:B, 914-918, 3df4:B, 914-918
UUC
1ffk:9, 110-114, 1jj2:9, 110-114, 1k73:B, 110-114, 1k8a:B, 110-114, 1k9m:B, 110-114, 1kc8:B, 110-114, 1kd1:B, 110-114, 1kqs:9, 110-114, 1m1k:B, 110-114, 1m90:B, 110-114, 1n8r:B, 110-114, 1nji:B, 110-114, 1q7y:B, 110-114, 1q81:B, 110-114, 1q82:B, 110-114, 1q86:B, 110-114, 1qvf:9, 110-114, 1qvg:9, 110-114, 1s1i:4, 110-114, 1s72:9, 110-114, 1voy:B, 2032-2036, 1vp0:B, 2032-2036, 1vq4:9, 110-114, 1vq5:9, 110-114, 1vq6:9, 110-114, 1vq7:9, 110-114, 1vq8:9, 110-114, 1vq9:9, 110-114, 1vqk:9, 110-114, 1vql:9, 110-114, 1vqm:9, 110-114, 1vqn:9, 110-114, 1vqo:9, 110-114, 1vqp:9, 110-114, 1w2b:9, 110-114, 1yhq:9, 110-114, 1yi2:9, 110-114, 1yij:9, 110-114, 1yit:9, 110-114, 1yj9:9, 110-114, 1yjn:9, 110-114, 1yjw:9, 110-114, 2otj:9, 110-114, 2otl:9, 110-114, 2qa4:9, 110-114, 2qex:9, 110-114, 3cc2:9, 110-114, 3cc4:9, 110-114, 3cc7:9, 110-114, 3cce:9, 110-114, 3ccj:9, 110-114, 3ccl:9, 110-114, 3ccm:9, 110-114, 3ccq:9, 110-114, 3ccs:9, 110-114, 3ccu:9, 110-114, 3ccv:9, 110-114, 3cd6:9, 110-114, 3cma:9, 110-114, 3cme:9, 110-114, 3cpw:9, 110-114