Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 800 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 148 structure(s)
Representative structure 1kd1:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NRR
Cluster members
AGA
1a9l:A, 10-14
AGG
1ffk:0, 856-860, 1j5a:A, 741-745, 1jj2:0, 860-864, 1jzx:A, 741-745, 1jzy:A, 741-745, 1jzz:A, 741-745, 1k01:A, 741-745, 1k73:A, 860-864, 1k8a:A, 860-864, 1k9m:A, 860-864, 1kc8:A, 860-864, 1kd1:A, 860-864, 1kqs:0, 860-864, 1m1k:A, 860-864, 1m90:A, 860-864, 1n8r:A, 860-864, 1nji:A, 860-864, 1njm:0, 736-740, 1njn:0, 736-740, 1njo:0, 736-740, 1njp:0, 736-740, 1nkw:0, 736-740, 1ond:0, 736-740, 1p9x:0, 713-717, 1pnu:0, 736-740, 1pny:0, 736-740, 1q7y:A, 860-864, 1q81:A, 860-864, 1q82:A, 860-864, 1q86:A, 860-864, 1qvf:0, 860-864, 1qvg:0, 860-864, 1s1i:3, 859-863, 1s72:0, 860-864, 1sm1:0, 736-740, 1vq4:0, 860-864, 1vq5:0, 860-864, 1vq6:0, 860-864, 1vq7:0, 860-864, 1vq8:0, 860-864, 1vq9:0, 860-864, 1vqk:0, 860-864, 1vql:0, 860-864, 1vqm:0, 860-864, 1vqn:0, 860-864, 1vqo:0, 860-864, 1vqp:0, 860-864, 1vsa:w, 799-803, 1vsp:w, 799-803, 1w2b:0, 860-864, 1xbp:0, 736-740, 1y69:0, 736-740, 1yhq:0, 860-864, 1yi2:0, 860-864, 1yij:0, 860-864, 1yit:0, 860-864, 1yj9:0, 860-864, 1yjn:0, 860-864, 1yjw:0, 860-864, 2aar:0, 736-740, 2b66:A, 798-802, 2b9n:A, 798-802, 2b9p:A, 798-802, 2d3o:0, 736-740, 2j01:A, 782-786, 2j03:A, 782-786, 2jl6:A, 809-813, 2jl8:A, 809-813, 2o43:A, 736-740, 2o44:A, 736-740, 2ogm:0, 736-740, 2ogo:0, 735-739, 2otj:0, 860-864, 2otl:0, 860-864, 2qa4:0, 859-863, 2qex:0, 860-864, 2zjp:X, 714-718, 2zjq:X, 714-718, 2zjr:X, 714-718, 3cc2:0, 860-864, 3cc4:0, 860-864, 3cc7:0, 860-864, 3cce:0, 860-864, 3ccj:0, 860-864, 3ccl:0, 860-864, 3ccm:0, 860-864, 3ccq:0, 860-864, 3ccr:0, 860-864, 3ccs:0, 860-864, 3ccu:0, 860-864, 3ccv:0, 860-864, 3cd6:0, 860-864, 3cf5:X, 714-718, 3cma:0, 860-864, 3cme:0, 860-864, 3cpw:0, 860-864, 3d5b:A, 794-798, 3d5d:A, 794-798, 3dll:X, 714-718
CGA
2vho:A, 58-62, 2vhp:A, 58-62
GAG
1yl3:A, 708-712, 2hgj:A, 708-712, 2hgq:A, 708-712, 2hgu:A, 708-712
GGA
3cd6:0, 671-675
GGG
1vs6:B, 773-777, 1vs8:B, 773-777, 2aw4:B, 773-777, 2awb:B, 773-777, 2gya:0, 710-714, 2i2t:B, 773-777, 2i2v:B, 773-777, 2j28:B, 773-777, 2qam:B, 773-777, 2qao:B, 773-777, 2qba:B, 773-777, 2qbc:B, 773-777, 2qbe:B, 773-777, 2qbg:B, 773-777, 2qbi:B, 773-777, 2qbk:B, 773-777, 2qov:B, 773-777, 2qox:B, 773-777, 2qoz:B, 773-777, 2qp1:B, 773-777, 2vhm:B, 773-777, 2vhn:B, 773-777, 2z4l:B, 773-777, 2z4n:B, 773-777, 3bbx:B, 773-777, 3df2:B, 773-777, 3df4:B, 773-777
UAA
2a64:A, 156-160
UAG
1i95:A, 242-246, 2vho:A, 244-248, 2vhp:A, 244-248
UGA
1njm:0, 1814-1818, 1njn:0, 1814-1818, 1njo:0, 1814-1818, 1njp:0, 1814-1818, 2d3o:0, 1814-1818, 2o43:A, 1814-1818, 2o45:A, 1811-1815, 2ogm:0, 1814-1818, 3bbo:A, 1833-1837, 3dll:X, 1792-1796