Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 3058 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 187 structure(s)
Representative structure 1vsp:w (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DND
Cluster members
ACA
1ffk:0, 676-680, 1jj2:0, 677-681, 1k73:A, 677-681, 1k8a:A, 677-681, 1k9m:A, 677-681, 1kc8:A, 677-681, 1kd1:A, 677-681, 1kqs:0, 677-681, 1m1k:A, 677-681, 1m90:A, 677-681, 1n8r:A, 677-681, 1nji:A, 677-681, 1q7y:A, 677-681, 1q81:A, 677-681, 1q82:A, 677-681, 1q86:A, 677-681, 1qvf:0, 677-681, 1qvg:0, 677-681, 1s1i:3, 679-683, 1s72:0, 677-681, 1vq4:0, 677-681, 1vq5:0, 677-681, 1vq6:0, 677-681, 1vq7:0, 677-681, 1vq8:0, 677-681, 1vq9:0, 677-681, 1vqk:0, 677-681, 1vql:0, 677-681, 1vqm:0, 677-681, 1vqn:0, 677-681, 1vqo:0, 677-681, 1vqp:0, 677-681, 1w2b:0, 677-681, 1yhq:0, 677-681, 1yi2:0, 677-681, 1yij:0, 677-681, 1yit:0, 677-681, 1yj9:0, 677-681, 1yjn:0, 677-681, 1yjw:0, 677-681, 2otj:0, 677-681, 2otl:0, 677-681, 2qa4:0, 676-680, 2qex:0, 677-681, 3cc2:0, 677-681, 3cc4:0, 677-681, 3cc7:0, 677-681, 3cce:0, 677-681, 3ccj:0, 677-681, 3ccl:0, 677-681, 3ccm:0, 677-681, 3ccq:0, 677-681, 3ccr:0, 677-681, 3ccs:0, 677-681, 3ccu:0, 677-681, 3ccv:0, 677-681, 3cd6:0, 677-681, 3cma:0, 677-681, 3cme:0, 677-681, 3cpw:0, 677-681
GAA
1vs6:B, 624-628, 1vs8:B, 624-628, 2aw4:B, 624-628, 2awb:B, 624-628, 2gya:0, 562-566, 2i2t:B, 624-628, 2i2v:B, 624-628, 2j28:B, 624-628, 2qam:B, 624-628, 2qao:B, 624-628, 2qba:B, 624-628, 2qbc:B, 624-628, 2qbe:B, 624-628, 2qbg:B, 624-628, 2qbi:B, 624-628, 2qbk:B, 624-628, 2qov:B, 624-628, 2qox:B, 624-628, 2qoz:B, 624-628, 2qp1:B, 624-628, 2z4l:B, 624-628, 2z4n:B, 624-628, 3bbx:B, 624-628, 3df2:B, 624-628, 3df4:B, 624-628
GCG
1fjg:A, 1198-1202, 1hnw:A, 1198-1202, 1hnx:A, 1198-1202, 1hnz:A, 1198-1202, 1hr0:A, 1198-1202, 1i95:A, 1201-1205, 1i96:A, 1201-1205, 1ibk:A, 1198-1202, 1ibl:A, 1198-1202, 1ibm:A, 1198-1202, 1j5e:A, 1198-1202, 1n32:A, 1198-1202, 1n33:A, 1198-1202, 1pns:A, 1214-1218, 1pnx:A, 1214-1218, 1s1h:A, 1199-1203, 1voq:A, 1214-1218, 1vos:A, 1214-1218, 1vov:A, 1214-1218, 1vox:A, 1214-1218, 1voz:A, 1214-1218, 1xmo:A, 1193-1197, 1xmq:A, 1193-1197, 1xnq:A, 1193-1197, 1xnr:A, 1193-1197, 1yl4:A, 1198-1202, 2b64:A, 1198-1202, 2b9m:A, 1198-1202, 2b9o:A, 1198-1202, 2e5l:A, 1199-1203, 2f4v:A, 1198-1202, 2hgi:A, 1198-1202, 2hgp:A, 1198-1202, 2hgr:A, 1198-1202, 2j00:A, 1198-1202, 2j02:A, 1198-1202, 2jl5:A, 1198-1202, 2jl7:A, 1198-1202, 2qnh:y, 1198-1202, 2uu9:A, 1198-1202, 2uua:A, 1198-1202, 2uub:A, 1198-1202, 2uuc:A, 1198-1202, 2uxc:A, 1198-1202, 2uxd:A, 1176-1180, 2vqe:A, 1198-1202, 2vqf:A, 1198-1202, 3bbn:A, 1164-1168, 3d5a:A, 1198-1202, 3d5c:A, 1198-1202
GCU
1vs5:A, 1217-1221, 2avy:A, 1217-1221, 2aw7:A, 1217-1221, 2i2p:A, 1217-1221, 2i2u:A, 1217-1221, 2qal:A, 1217-1221, 2qan:A, 1217-1221, 2qb9:A, 1217-1221, 2qbb:A, 1217-1221, 2qbd:A, 1217-1221, 2qbf:A, 1217-1221, 2qbh:A, 1217-1221, 2qbj:A, 1217-1221, 2qou:A, 1217-1221, 2qow:A, 1217-1221, 2qoy:A, 1217-1221, 2qp0:A, 1217-1221, 2z4k:A, 1217-1221, 2z4m:A, 1217-1221, 3df1:A, 1217-1221, 3df3:A, 1217-1221
GGA
1njm:0, 585-589, 1njn:0, 585-589, 1njo:0, 585-589, 1njp:0, 585-589, 1pnu:0, 585-589, 1pny:0, 585-589, 2zjp:X, 563-567, 2zjq:X, 563-567, 2zjr:X, 563-567, 3cf5:X, 563-567, 3dll:X, 563-567
GUA
1vsa:w, 650-654, 1vsp:w, 650-654, 2hgq:A, 649-653, 2j01:A, 636-640, 2j03:A, 636-640, 2jl6:A, 638-642, 2jl8:A, 638-642, 2v47:A, 636-640, 2v49:A, 636-640, 3d5b:A, 645-649, 3d5d:A, 645-649
UCA
1nkw:9, 106-110, 1nwx:9, 106-110, 1nwy:9, 106-110, 1pnu:9, 106-110, 1pny:9, 106-110, 1sm1:9, 106-110, 1xbp:9, 106-110, 1y69:9, 106-110
UUG
2qnh:y, 394-398