Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 276 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 162 structure(s)
Representative structure 1i96:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BHR
Cluster members
CUG
1fjg:A, 855-859, 1hnw:A, 855-859, 1hnx:A, 855-859, 1hnz:A, 855-859, 1hr0:A, 855-859, 1i94:A, 858-862, 1i95:A, 858-862, 1i96:A, 858-862, 1ibk:A, 855-859, 1ibl:A, 855-859, 1ibm:A, 855-859, 1j5e:A, 855-859, 1n32:A, 855-859, 1n33:A, 855-859, 1n34:A, 855-859, 1n36:A, 855-859, 1pns:A, 875-879, 1pnx:A, 875-879, 1s1h:A, 860-864, 1vs5:A, 878-882, 1vs7:A, 878-882, 1xmo:A, 855-859, 1xmq:A, 855-859, 1xnq:A, 855-859, 1xnr:A, 855-859, 1yl4:A, 855-859, 2avy:A, 878-882, 2aw7:A, 878-882, 2e5l:A, 856-860, 2f4v:A, 855-859, 2gy9:A, 842-846, 2hgi:A, 855-859, 2hgp:A, 855-859, 2hgr:A, 855-859, 2hhh:A, 855-859, 2i2p:A, 878-882, 2i2u:A, 878-882, 2j00:A, 855-859, 2j02:A, 855-859, 2jl5:A, 855-859, 2jl7:A, 855-859, 2ow8:y, 855-859, 2qal:A, 878-882, 2qan:A, 878-882, 2qb9:A, 878-882, 2qbb:A, 878-882, 2qbd:A, 878-882, 2qbf:A, 878-882, 2qbh:A, 878-882, 2qbj:A, 878-882, 2qnh:y, 855-859, 2qou:A, 878-882, 2qow:A, 878-882, 2qoy:A, 878-882, 2qp0:A, 878-882, 2uu9:A, 855-859, 2uua:A, 855-859, 2uub:A, 855-859, 2uuc:A, 855-859, 2uxb:A, 855-859, 2uxc:A, 855-859, 2uxd:A, 833-837, 2vqe:A, 855-859, 2vqf:A, 855-859, 2z4k:A, 878-882, 2z4m:A, 878-882, 3d5a:A, 855-859, 3d5c:A, 855-859, 3df1:A, 878-882, 3df3:A, 878-882
GAA
1vs6:A, 105-109, 1vs8:A, 105-109, 2aw4:A, 105-109, 2awb:A, 105-109, 2i2t:A, 105-109, 2i2v:A, 105-109, 2j28:A, 105-109, 2qam:A, 105-109, 2qao:A, 105-109, 2qba:A, 105-109, 2qbc:A, 105-109, 2qbe:A, 105-109, 2qbg:A, 105-109, 2qbi:A, 105-109, 2qbk:A, 105-109, 2qov:A, 105-109, 2qox:A, 105-109, 2qoz:A, 105-109, 2qp1:A, 105-109, 2z4l:A, 105-109, 2z4n:A, 105-109, 3bbx:A, 105-109, 3df2:A, 105-109, 3df4:A, 105-109
UCA
2zjp:Z, 108-112, 2zjq:Y, 108-112, 2zjr:Y, 108-112, 3cf5:Z, 108-112, 3dll:Z, 108-112
UUG
1ffk:0, 2091-2095, 1j5a:A, 2143-2147, 1jj2:0, 2141-2145, 1jzx:A, 2143-2147, 1jzy:A, 2143-2147, 1jzz:A, 2143-2147, 1k01:A, 2143-2147, 1k73:A, 2141-2145, 1k8a:A, 2141-2145, 1k9m:A, 2141-2145, 1kc8:A, 2141-2145, 1kd1:A, 2141-2145, 1kqs:0, 2141-2145, 1m1k:A, 2141-2145, 1m90:A, 2141-2145, 1n8r:A, 2141-2145, 1nji:A, 2141-2145, 1q7y:A, 2141-2145, 1q81:A, 2141-2145, 1q82:A, 2141-2145, 1q86:A, 2141-2145, 1qvf:0, 2141-2145, 1qvg:0, 2141-2145, 1s1i:3, 2441-2445, 1s72:0, 2141-2145, 1vq4:0, 2141-2145, 1vq5:0, 2141-2145, 1vq6:0, 2141-2145, 1vq7:0, 2141-2145, 1vq8:0, 2141-2145, 1vq9:0, 2141-2145, 1vqk:0, 2141-2145, 1vql:0, 2141-2145, 1vqm:0, 2141-2145, 1vqn:0, 2141-2145, 1vqo:0, 2141-2145, 1vqp:0, 2141-2145, 1w2b:0, 2141-2145, 1yhq:0, 2141-2145, 1yi2:0, 2141-2145, 1yij:0, 2141-2145, 1yit:0, 2141-2145, 1yj9:0, 2141-2145, 1yjn:0, 2141-2145, 1yjw:0, 2141-2145, 2otj:0, 2141-2145, 2otl:0, 2141-2145, 2qa4:0, 2146-2150, 2qex:0, 2141-2145, 3cc2:0, 2141-2145, 3cc4:0, 2141-2145, 3cc7:0, 2141-2145, 3ccj:0, 2141-2145, 3ccl:0, 2141-2145, 3ccm:0, 2141-2145, 3ccq:0, 2141-2145, 3ccr:0, 2141-2145, 3ccu:0, 2141-2145, 3ccv:0, 2141-2145, 3cd6:0, 2141-2145, 3cma:0, 2141-2145, 3cme:0, 2141-2145, 3cpw:0, 2141-2145