Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 7438 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 288 structure(s)
Representative structure 3ccj:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence RHH
Cluster members
AAU
3bbn:A, 947-951
ACU
1ffk:0, 1749-1753, 1jj2:0, 1799-1803, 1k73:A, 1799-1803, 1k8a:A, 1799-1803, 1k9m:A, 1799-1803, 1kc8:A, 1799-1803, 1kd1:A, 1799-1803, 1kqs:0, 1799-1803, 1m1k:A, 1799-1803, 1m90:A, 1799-1803, 1n8r:A, 1799-1803, 1nji:A, 1799-1803, 1q7y:A, 1799-1803, 1q81:A, 1799-1803, 1q82:A, 1799-1803, 1q86:A, 1799-1803, 1qvf:0, 1799-1803, 1qvg:0, 1799-1803, 1s1i:3, 1907-1911, 1s72:0, 1799-1803, 1vq4:0, 1799-1803, 1vq5:0, 1799-1803, 1vq6:0, 1799-1803, 1vq7:0, 1799-1803, 1vq8:0, 1799-1803, 1vq9:0, 1799-1803, 1vqk:0, 1799-1803, 1vql:0, 1799-1803, 1vqm:0, 1799-1803, 1vqn:0, 1799-1803, 1vqo:0, 1799-1803, 1vqp:0, 1799-1803, 1vs6:B, 1756-1760, 1vs8:B, 1756-1760, 1vsa:w, 1781-1785, 1vsp:w, 1781-1785, 1w2b:0, 1799-1803, 1yhq:0, 1799-1803, 1yi2:0, 1799-1803, 1yij:0, 1799-1803, 1yit:0, 1799-1803, 1yj9:0, 1799-1803, 1yjn:0, 1799-1803, 1yjw:0, 1799-1803, 2aw4:B, 1756-1760, 2awb:B, 1756-1760, 2b66:A, 1781-1785, 2b9n:A, 1781-1785, 2b9p:A, 1781-1785, 2gya:0, 1670-1674, 2gyc:0, 1670-1674, 2hgu:A, 1781-1785, 2i2t:B, 1756-1760, 2i2v:B, 1756-1760, 2j01:A, 1698-1702, 2j03:A, 1698-1702, 2j28:B, 1756-1760, 2jl6:A, 1777-1781, 2jl8:A, 1777-1781, 2otj:0, 1799-1803, 2otl:0, 1799-1803, 2qa4:0, 1804-1808, 2qam:B, 1756-1760, 2qao:B, 1756-1760, 2qba:B, 1756-1760, 2qbc:B, 1756-1760, 2qbe:B, 1756-1760, 2qbg:B, 1756-1760, 2qbi:B, 1756-1760, 2qbk:B, 1756-1760, 2qex:0, 1799-1803, 2qov:B, 1756-1760, 2qox:B, 1756-1760, 2qoz:B, 1756-1760, 2qp1:B, 1756-1760, 2v47:A, 1698-1702, 2v49:A, 1698-1702, 2z4l:B, 1756-1760, 2z4n:B, 1756-1760, 3bbx:B, 1846-1850, 3cc2:0, 1799-1803, 3cc4:0, 1799-1803, 3cc7:0, 1799-1803, 3cce:0, 1799-1803, 3ccj:0, 1799-1803, 3ccl:0, 1799-1803, 3ccm:0, 1799-1803, 3ccq:0, 1799-1803, 3ccr:0, 1799-1803, 3ccs:0, 1799-1803, 3ccu:0, 1799-1803, 3ccv:0, 1799-1803, 3cd6:0, 1799-1803, 3cma:0, 1799-1803, 3cme:0, 1799-1803, 3cpw:0, 1799-1803, 3d5b:A, 1776-1780, 3d5d:A, 1776-1780, 3df2:B, 1756-1760, 3df4:B, 1756-1760
GAA
1s9s:A, 48-52, 1u6p:B, 48-52, 2qa4:0, 1859-1863, 3ccj:0, 1854-1858
GAC
1vsa:w, 221-225, 1vsp:w, 221-225, 2gya:0, 1725-1729, 2gyc:0, 1725-1729, 2hgj:A, 220-224, 2hgq:A, 220-224, 2hgu:A, 220-224, 2j01:A, 213-217, 2j03:A, 213-217, 2jl6:A, 213-217, 2jl8:A, 213-217, 3d5b:A, 216-220, 3d5d:A, 216-220
GAU
1ffk:0, 193-197, 1j5a:A, 208-212, 1jj2:0, 194-198, 1jzx:A, 208-212, 1jzy:A, 208-212, 1jzz:A, 208-212, 1k01:A, 208-212, 1k73:A, 194-198, 1k8a:A, 194-198, 1k9m:A, 194-198, 1kc8:A, 194-198, 1kd1:A, 194-198, 1kqs:0, 194-198, 1m1k:A, 194-198, 1m90:A, 194-198, 1n8r:A, 194-198, 1nji:A, 194-198, 1njm:0, 208-212, 1njn:0, 208-212, 1njo:0, 208-212, 1njp:0, 208-212, 1nwx:0, 208-212, 1nwy:0, 208-212, 1ond:0, 208-212, 1p9x:0, 208-212, 1pnu:0, 208-212, 1pny:0, 208-212, 1q7y:A, 194-198, 1q81:A, 194-198, 1q82:A, 194-198, 1q86:A, 194-198, 1qvf:0, 194-198, 1qvg:0, 194-198, 1s1i:3, 193-197, 1s72:0, 194-198, 1sm1:0, 208-212, 1vq4:0, 194-198, 1vq5:0, 194-198, 1vq6:0, 194-198, 1vq7:0, 194-198, 1vq8:0, 194-198, 1vq9:0, 194-198, 1vqk:0, 194-198, 1vql:0, 194-198, 1vqm:0, 194-198, 1vqn:0, 194-198, 1vqo:0, 194-198, 1vqp:0, 194-198, 1vs6:B, 231-235, 1vs8:B, 231-235, 1w2b:0, 194-198, 1y69:0, 208-212, 1yhq:0, 194-198, 1yi2:0, 194-198, 1yij:0, 194-198, 1yit:0, 194-198, 1yj9:0, 194-198, 1yjn:0, 194-198, 1yjw:0, 194-198, 2aar:0, 208-212, 2aw4:B, 231-235, 2awb:B, 231-235, 2i2t:B, 231-235, 2i2v:B, 231-235, 2j28:B, 231-235, 2ogm:0, 208-212, 2ogo:0, 207-211, 2otj:0, 194-198, 2otl:0, 194-198, 2qa4:0, 194-198, 2qam:B, 231-235, 2qao:B, 231-235, 2qba:B, 231-235, 2qbc:B, 231-235, 2qbe:B, 231-235, 2qbg:B, 231-235, 2qbi:B, 231-235, 2qbk:B, 231-235, 2qex:0, 194-198, 2qov:B, 231-235, 2qox:B, 231-235, 2qoz:B, 231-235, 2qp1:B, 231-235, 2z4l:B, 231-235, 2z4n:B, 231-235, 2zjp:X, 208-212, 2zjq:X, 208-212, 2zjr:X, 208-212, 3bbo:A, 216-220, 3bbx:B, 231-235, 3cc2:0, 194-198, 3cc4:0, 194-198, 3cc7:0, 194-198, 3cce:0, 194-198, 3ccj:0, 194-198, 3ccl:0, 194-198, 3ccm:0, 194-198, 3ccq:0, 194-198, 3ccr:0, 194-198, 3ccs:0, 194-198, 3ccu:0, 194-198, 3ccv:0, 194-198, 3cd6:0, 194-198, 3cf5:X, 208-212, 3cma:0, 194-198, 3cme:0, 194-198, 3cpw:0, 194-198, 3df2:B, 231-235, 3df4:B, 231-235, 3dll:X, 208-212
GUA
1ffk:0, 608-612, 1jj2:0, 609-613, 1k73:A, 609-613, 1k8a:A, 609-613, 1k9m:A, 609-613, 1kc8:A, 609-613, 1kd1:A, 609-613, 1kqs:0, 609-613, 1m1k:A, 609-613, 1m90:A, 609-613, 1n8r:A, 609-613, 1nji:A, 609-613, 1q7y:A, 609-613, 1q81:A, 609-613, 1q82:A, 609-613, 1q86:A, 609-613, 1qvf:0, 609-613, 1qvg:0, 609-613, 1s1i:3, 611-615, 1s72:0, 609-613, 1vq4:0, 609-613, 1vq5:0, 609-613, 1vq6:0, 609-613, 1vq7:0, 609-613, 1vq8:0, 609-613, 1vq9:0, 609-613, 1vqk:0, 609-613, 1vql:0, 609-613, 1vqm:0, 609-613, 1vqn:0, 609-613, 1vqo:0, 609-613, 1vqp:0, 609-613, 1w2b:0, 609-613, 1yhq:0, 609-613, 1yi2:0, 609-613, 1yij:0, 609-613, 1yit:0, 609-613, 1yj9:0, 609-613, 1yjn:0, 609-613, 1yjw:0, 609-613, 2otj:0, 609-613, 2otl:0, 609-613, 2qa4:0, 609-613, 2qex:0, 609-613, 3cc2:0, 609-613, 3cc4:0, 609-613, 3cc7:0, 609-613, 3cce:0, 609-613, 3ccj:0, 609-613, 3ccl:0, 609-613, 3ccm:0, 609-613, 3ccq:0, 609-613, 3ccr:0, 609-613, 3ccs:0, 609-613, 3ccu:0, 609-613, 3ccv:0, 609-613, 3cd6:0, 609-613, 3cma:0, 609-613, 3cme:0, 609-613, 3cpw:0, 609-613