Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 2793 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 146 structure(s)
Representative structure 1vqo:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence BDN
Cluster members
CGA
2vho:A, 58-62, 2vhp:A, 58-62
CUC
1njm:0, 2579-2583, 1njn:0, 2579-2583, 1njo:0, 2579-2583, 1njp:0, 2579-2583, 1nkw:0, 2579-2583, 1nwx:0, 2579-2583, 1nwy:0, 2579-2583, 1ond:0, 2578-2582, 1p9x:0, 2554-2558, 1pnu:0, 2623-2627, 1pny:0, 2623-2627, 1sm1:0, 2579-2583, 1vor:B, 2623-2627, 1vou:B, 2623-2627, 1vow:B, 2623-2627, 1voy:B, 2623-2627, 1vp0:B, 2623-2627, 1xbp:0, 2579-2583, 2d3o:0, 2600-2604, 2o43:A, 2579-2583, 2o44:A, 2579-2583, 2o45:A, 2567-2571, 2ogo:0, 2578-2582, 2zjp:X, 2490-2494, 2zjq:X, 2490-2494, 2zjr:X, 2487-2491, 3cf5:X, 2490-2494, 3dll:X, 2490-2494
GGG
1j5a:A, 2136-2140, 1jzx:A, 2136-2140, 1jzy:A, 2136-2140, 1jzz:A, 2136-2140, 1k01:A, 2136-2140, 1nkw:0, 2128-2132, 1nwx:0, 2128-2132, 1nwy:0, 2128-2132, 2d3o:0, 2149-2153, 2o43:A, 2128-2132
GUA
1ffk:0, 2537-2541, 1jj2:0, 2588-2592, 1k73:A, 2588-2592, 1k8a:A, 2588-2592, 1k9m:A, 2588-2592, 1kc8:A, 2588-2592, 1kd1:A, 2588-2592, 1kqs:0, 2588-2592, 1m1k:A, 2588-2592, 1m90:A, 2588-2592, 1n8r:A, 2588-2592, 1nji:A, 2588-2592, 1q7y:A, 2588-2592, 1q81:A, 2588-2592, 1q82:A, 2588-2592, 1q86:A, 2588-2592, 1qvf:0, 2588-2592, 1qvg:0, 2588-2592, 1s1i:3, 2904-2908, 1s72:0, 2588-2592, 1vq4:0, 2588-2592, 1vq5:0, 2588-2592, 1vq6:0, 2588-2592, 1vq7:0, 2588-2592, 1vq8:0, 2588-2592, 1vq9:0, 2588-2592, 1vqk:0, 2588-2592, 1vql:0, 2588-2592, 1vqm:0, 2588-2592, 1vqn:0, 2588-2592, 1vqo:0, 2588-2592, 1vqp:0, 2588-2592, 1w2b:0, 2588-2592, 1yhq:0, 2588-2592, 1yi2:0, 2588-2592, 1yij:0, 2588-2592, 1yit:0, 2588-2592, 1yj9:0, 2588-2592, 1yjn:0, 2588-2592, 1yjw:0, 2588-2592, 2otj:0, 2588-2592, 2otl:0, 2588-2592, 2qa4:0, 2593-2597, 2qex:0, 2588-2592, 3bbo:A, 2626-2630, 3cc2:0, 2588-2592, 3cc4:0, 2588-2592, 3cc7:0, 2588-2592, 3cce:0, 2588-2592, 3ccj:0, 2588-2592, 3ccl:0, 2588-2592, 3ccm:0, 2588-2592, 3ccq:0, 2588-2592, 3ccr:0, 2588-2592, 3ccs:0, 2588-2592, 3ccu:0, 2588-2592, 3ccv:0, 2588-2592, 3cd6:0, 2588-2592, 3cma:0, 2588-2592, 3cme:0, 2588-2592, 3cpw:0, 2588-2592
GUU
1vs6:B, 2634-2638, 1vs8:B, 2634-2638, 2aw4:B, 2634-2638, 2awb:B, 2634-2638, 2gya:0, 2546-2550, 2gyc:0, 2546-2550, 2i2t:B, 2634-2638, 2i2v:B, 2634-2638, 2j28:B, 2634-2638, 2qam:B, 2634-2638, 2qao:B, 2634-2638, 2qba:B, 2634-2638, 2qbc:B, 2634-2638, 2qbe:B, 2634-2638, 2qbg:B, 2634-2638, 2qbi:B, 2634-2638, 2qbk:B, 2634-2638, 2qov:B, 2634-2638, 2qox:B, 2634-2638, 2qoz:B, 2634-2638, 2qp1:B, 2634-2638, 2vhn:B, 2634-2638, 2z4l:B, 2634-2638, 2z4n:B, 2634-2638, 3bbx:B, 2917-2921, 3df2:B, 2634-2638, 3df4:B, 2634-2638
UAC
2ow8:y, 122-126
UGA
1n33:A, 377-381, 1xmo:A, 377-381, 2e5l:A, 378-382, 2hhh:A, 377-381, 2uxb:A, 377-381, 2uxd:A, 361-365
UUC
1vsa:w, 2677-2681, 1vsp:w, 2677-2681, 1yl3:A, 2663-2667, 2j01:A, 2565-2569, 2j03:A, 2565-2569, 2jl6:A, 2644-2648, 2jl8:A, 2644-2648, 2v47:A, 2560-2564, 2v49:A, 2560-2564, 3d5b:A, 2672-2676, 3d5d:A, 2672-2676