Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 3301 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 98 structure(s)
Representative structure 1y69:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNN
Cluster members
AAC
1njm:0, 1501-1505, 1njn:0, 1501-1505, 1njo:0, 1501-1505, 1njp:0, 1501-1505, 1nkw:0, 1501-1505, 1nwx:0, 1501-1505, 1nwy:0, 1501-1505, 1ond:0, 1500-1504, 1pnu:0, 1517-1521, 1pny:0, 1517-1521, 1sm1:0, 1501-1505
ACA
2qux:C, 3-7
AGA
1dk1:B, 26-30, 1i95:A, 644-648, 1i96:A, 644-648, 1kuq:B, 26-30, 1vs5:A, 658-662, 1vs7:A, 658-662, 2avy:A, 658-662, 2aw7:A, 658-662, 2j00:A, 641-645, 2j02:A, 641-645, 2ow8:y, 641-645, 2qal:A, 658-662, 2qan:A, 658-662
AGG
2d1b:A, 30-34, 2d1b:B, 30-34, 3bbn:A, 605-609
AUC
1sm1:0, 937-941, 1z58:2, 928-932
CAG
2oiu:P, 41-45
GAA
1j5a:A, 1106-1110, 1jzx:A, 1106-1110, 1jzy:A, 1106-1110, 1jzz:A, 1106-1110, 1k01:A, 1106-1110, 1kc8:A, 1459-1463, 1kd1:A, 1459-1463, 1n8r:A, 1459-1463, 1nji:A, 1459-1463, 1njm:0, 1098-1102, 1njn:0, 1098-1102, 1njo:0, 1098-1102, 1njp:0, 1098-1102, 1nkw:0, 1098-1102, 1nwx:0, 1098-1102, 1nwy:0, 1098-1102, 1ond:0, 1098-1102, 1pnu:0, 1114-1118, 1pny:0, 1114-1118, 1q82:A, 1459-1463, 1vou:B, 1114-1118, 1voy:B, 1114-1118, 1vq8:0, 1459-1463, 1vq9:0, 1459-1463, 1vqk:0, 1459-1463, 1vql:0, 1459-1463, 1vqm:0, 1459-1463, 1vqn:0, 1459-1463, 1vqo:0, 1459-1463, 1vqp:0, 1459-1463, 1vsa:w, 1178-1182, 1vsa:w, 1401-1405, 1vsp:w, 1401-1405, 1y69:0, 1098-1102, 1yhq:0, 1459-1463, 1yj9:0, 1459-1463, 1yl3:A, 1178-1182, 1z58:2, 1089-1093, 2b66:A, 1178-1182, 2b9n:A, 1178-1182, 2b9p:A, 1178-1182, 2hgj:A, 1178-1182, 2hgq:A, 1178-1182, 2o43:A, 1098-1102, 2otl:0, 1459-1463, 2zjp:X, 1076-1080, 2zjq:X, 1076-1080, 2zjr:X, 1073-1077, 3cc7:0, 1459-1463, 3cce:0, 1459-1463, 3ccm:0, 1459-1463, 3ccu:0, 1459-1463, 3ccv:0, 1459-1463, 3cd6:0, 1459-1463, 3cma:0, 1459-1463, 3cme:0, 1459-1463, 3cpw:0, 1459-1463
GAU
1vsa:w, 1442-1446
GCA
1x8w:B, 157-161, 1x8w:C, 157-161, 1x8w:D, 157-161
UAC
3bbx:B, 2123-2127
UUG
3d0u:A, 104-108, 3d0x:A, 104-108
UUU
1nwx:0, 1990-1994, 3bbo:A, 2009-2013, 3dll:X, 1951-1955