Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 6372 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 412 structure(s)
Representative structure 2qp1:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDK
Cluster members
AGA
2qnh:y, 641-645
CGA
1ffk:0, 1134-1138, 1j5a:A, 80-84, 1jj2:0, 1181-1185, 1jj2:0, 930-934, 1jzx:A, 80-84, 1jzy:A, 80-84, 1jzz:A, 80-84, 1k01:A, 80-84, 1k73:A, 1181-1185, 1k73:A, 930-934, 1k8a:A, 1181-1185, 1k8a:A, 930-934, 1k9m:A, 1181-1185, 1k9m:A, 930-934, 1kc8:A, 1181-1185, 1kc8:A, 930-934, 1kd1:A, 1181-1185, 1kqs:0, 1181-1185, 1kqs:0, 930-934, 1m1k:A, 1181-1185, 1m1k:A, 930-934, 1m90:A, 1181-1185, 1m90:A, 930-934, 1n8r:A, 1181-1185, 1n8r:A, 930-934, 1nji:A, 1181-1185, 1nji:A, 930-934, 1njm:0, 80-84, 1njo:0, 80-84, 1nkw:0, 80-84, 1nwx:0, 80-84, 1nwy:0, 80-84, 1ond:0, 80-84, 1p9x:0, 80-84, 1pnu:0, 80-84, 1pny:0, 80-84, 1q7y:A, 1181-1185, 1q81:A, 1181-1185, 1q82:A, 1181-1185, 1q82:A, 930-934, 1q86:A, 1181-1185, 1q86:A, 930-934, 1qvf:0, 1181-1185, 1qvf:0, 930-934, 1qvg:0, 1181-1185, 1qvg:0, 930-934, 1s1i:3, 1283-1287, 1s72:0, 1181-1185, 1s72:0, 930-934, 1vq4:0, 1181-1185, 1vq4:0, 930-934, 1vq5:0, 1181-1185, 1vq5:0, 930-934, 1vq6:0, 1181-1185, 1vq6:0, 930-934, 1vq7:0, 1181-1185, 1vq7:0, 930-934, 1vq8:0, 1181-1185, 1vq9:0, 1181-1185, 1vqk:0, 1181-1185, 1vql:0, 1181-1185, 1vqm:0, 1181-1185, 1vqm:0, 930-934, 1vqn:0, 1181-1185, 1vqn:0, 930-934, 1vqo:0, 1181-1185, 1vqp:0, 1181-1185, 1vs6:B, 1092-1096, 1vs8:B, 1092-1096, 1vsp:w, 1133-1137, 1w2b:0, 930-934, 1xbp:0, 80-84, 1y69:0, 80-84, 1yhq:0, 1181-1185, 1yhq:0, 930-934, 1yi2:0, 1181-1185, 1yi2:0, 930-934, 1yij:0, 1181-1185, 1yij:0, 930-934, 1yit:0, 1181-1185, 1yit:0, 930-934, 1yj9:0, 1181-1185, 1yj9:0, 930-934, 1yjn:0, 1181-1185, 1yjn:0, 930-934, 1yjw:0, 1181-1185, 1yjw:0, 930-934, 1yl3:A, 1132-1136, 2aar:0, 80-84, 2aw4:B, 1092-1096, 2awb:B, 1092-1096, 2d3o:0, 80-84, 2i2t:B, 1092-1096, 2i2v:B, 1092-1096, 2j28:B, 1092-1096, 2o43:A, 80-84, 2o45:A, 80-84, 2ogm:0, 80-84, 2ogn:0, 80-84, 2ogo:0, 79-83, 2otj:0, 1181-1185, 2otl:0, 1181-1185, 2otl:0, 930-934, 2qa4:0, 1186-1190, 2qa4:0, 929-933, 2qam:B, 1092-1096, 2qao:B, 1092-1096, 2qba:B, 1092-1096, 2qbc:B, 1092-1096, 2qbe:B, 1092-1096, 2qbg:B, 1092-1096, 2qbi:B, 1092-1096, 2qbk:B, 1092-1096, 2qex:0, 1181-1185, 2qov:B, 1092-1096, 2qox:B, 1092-1096, 2qoz:B, 1092-1096, 2qp1:B, 1092-1096, 2z4l:B, 1092-1096, 2z4n:B, 1092-1096, 2zjp:X, 1031-1035, 2zjp:X, 80-84, 2zjq:X, 1031-1035, 2zjq:X, 80-84, 2zjr:X, 80-84, 3bbx:B, 1170-1174, 3cc2:0, 1181-1185, 3cc2:0, 930-934, 3cc4:0, 1181-1185, 3cc7:0, 1181-1185, 3cce:0, 1181-1185, 3cce:0, 930-934, 3ccj:0, 1181-1185, 3ccj:0, 930-934, 3ccl:0, 1181-1185, 3ccm:0, 1181-1185, 3ccq:0, 1181-1185, 3ccr:0, 1181-1185, 3ccr:0, 930-934, 3ccs:0, 1181-1185, 3ccs:0, 930-934, 3ccu:0, 1181-1185, 3ccv:0, 1181-1185, 3cd6:0, 1181-1185, 3cd6:0, 930-934, 3cf5:X, 1031-1035, 3cf5:X, 80-84, 3cma:0, 1181-1185, 3cma:0, 930-934, 3cme:0, 1181-1185, 3cpw:0, 1181-1185, 3cpw:0, 930-934, 3d5b:A, 1128-1132, 3d5d:A, 1128-1132, 3df2:B, 1092-1096, 3df4:B, 1092-1096, 3dll:X, 80-84
GAA
1p9x:0, 1075-1079, 1vsp:w, 1178-1182, 1yl3:A, 1400-1404, 2hgj:A, 1400-1404
GGA
1ffk:0, 1260-1264, 1ffk:0, 670-674, 1ffk:0, 68-72, 1i97:A, 756-760, 1j5a:A, 1368-1372, 1jj2:0, 671-675, 1jj2:0, 68-72, 1jzx:A, 1368-1372, 1jzy:A, 1368-1372, 1jzz:A, 1368-1372, 1k01:A, 1368-1372, 1k73:A, 671-675, 1k73:A, 68-72, 1k8a:A, 671-675, 1k8a:A, 68-72, 1k9m:A, 671-675, 1k9m:A, 68-72, 1kc8:A, 671-675, 1kc8:A, 68-72, 1kd1:A, 671-675, 1kd1:A, 68-72, 1kqs:0, 671-675, 1kqs:0, 68-72, 1m1k:A, 671-675, 1m1k:A, 68-72, 1m5l:A, 25-29, 1m90:A, 671-675, 1m90:A, 68-72, 1n8r:A, 671-675, 1n8r:A, 68-72, 1nji:A, 671-675, 1nji:A, 68-72, 1njm:0, 1360-1364, 1njn:0, 1360-1364, 1njo:0, 1360-1364, 1njp:0, 1360-1364, 1nkw:0, 1360-1364, 1nwx:0, 1360-1364, 1nwy:0, 1360-1364, 1ond:0, 1360-1364, 1pns:A, 767-771, 1pnu:0, 1376-1380, 1pnu:0, 2095-2099, 1pny:0, 1376-1380, 1pny:0, 2095-2099, 1q7y:A, 68-72, 1q81:A, 68-72, 1q82:A, 671-675, 1q82:A, 68-72, 1q86:A, 671-675, 1q86:A, 68-72, 1qvf:0, 671-675, 1qvf:0, 68-72, 1qvg:0, 671-675, 1qvg:0, 68-72, 1s1i:3, 1415-1419, 1s1i:3, 673-677, 1s1i:3, 68-72, 1s72:0, 671-675, 1s72:0, 68-72, 1sm1:0, 1360-1364, 1vq4:0, 671-675, 1vq4:0, 68-72, 1vq5:0, 671-675, 1vq5:0, 68-72, 1vq6:0, 671-675, 1vq6:0, 68-72, 1vq7:0, 671-675, 1vq7:0, 68-72, 1vq8:0, 671-675, 1vq8:0, 68-72, 1vq9:0, 671-675, 1vq9:0, 68-72, 1vqk:0, 671-675, 1vqk:0, 68-72, 1vql:0, 671-675, 1vql:0, 68-72, 1vqm:0, 671-675, 1vqm:0, 68-72, 1vqn:0, 671-675, 1vqn:0, 68-72, 1vqo:0, 671-675, 1vqo:0, 68-72, 1vqp:0, 671-675, 1vqp:0, 68-72, 1vs6:B, 618-622, 1vs8:B, 618-622, 1vsa:w, 2155-2159, 1vsa:w, 80-84, 1vsp:w, 1259-1263, 1vsp:w, 2155-2159, 1vsp:w, 80-84, 1w2b:0, 671-675, 1w2b:0, 68-72, 1xbp:0, 1360-1364, 1y69:0, 1360-1364, 1yhq:0, 671-675, 1yhq:0, 68-72, 1yi2:0, 671-675, 1yi2:0, 68-72, 1yij:0, 671-675, 1yij:0, 68-72, 1yit:0, 671-675, 1yit:0, 68-72, 1yj9:0, 671-675, 1yj9:0, 68-72, 1yjn:0, 671-675, 1yjn:0, 68-72, 1yjw:0, 671-675, 1yjw:0, 68-72, 1yl3:A, 80-84, 1z2j:A, 34-38, 2aar:0, 1360-1364, 2aw4:B, 618-622, 2awb:B, 618-622, 2b66:A, 80-84, 2b9n:A, 80-84, 2b9p:A, 80-84, 2d3o:0, 1360-1364, 2gis:A, 17-21, 2gyc:0, 1158-1162, 2hgj:A, 80-84, 2hgq:A, 80-84, 2hgu:A, 1258-1262, 2hgu:A, 80-84, 2i2t:B, 618-622, 2i2v:B, 618-622, 2j01:A, 1184-1188, 2j01:A, 75-79, 2j03:A, 1184-1188, 2j03:A, 75-79, 2j28:B, 618-622, 2jl6:A, 1263-1267, 2jl6:A, 75-79, 2jl8:A, 1263-1267, 2jl8:A, 75-79, 2o43:A, 1360-1364, 2ogm:0, 1360-1364, 2ogn:0, 1360-1364, 2ogo:0, 1359-1363, 2otj:0, 671-675, 2otj:0, 68-72, 2otl:0, 671-675, 2otl:0, 68-72, 2qa4:0, 68-72, 2qam:B, 618-622, 2qao:B, 618-622, 2qba:B, 618-622, 2qbc:B, 618-622, 2qbe:B, 618-622, 2qbg:B, 618-622, 2qbi:B, 1218-1222, 2qbi:B, 618-622, 2qbk:B, 618-622, 2qex:0, 671-675, 2qex:0, 68-72, 2qnh:y, 753-757, 2qov:B, 618-622, 2qox:B, 618-622, 2qoz:B, 1218-1222, 2qoz:B, 618-622, 2qp1:B, 1218-1222, 2qp1:B, 618-622, 2v47:A, 630-634, 2v47:A, 75-79, 2v49:A, 75-79, 2vhm:B, 1218-1222, 2vhn:B, 1218-1222, 2z4l:B, 618-622, 2z4n:B, 618-622, 2zjp:X, 1338-1342, 2zjp:X, 557-561, 2zjq:X, 1338-1342, 2zjr:X, 1335-1339, 2zjr:X, 557-561, 3bbx:B, 618-622, 3cc2:0, 671-675, 3cc2:0, 68-72, 3cc4:0, 671-675, 3cc4:0, 68-72, 3cc7:0, 671-675, 3cc7:0, 68-72, 3cce:0, 671-675, 3cce:0, 68-72, 3ccj:0, 671-675, 3ccj:0, 68-72, 3ccl:0, 671-675, 3ccl:0, 68-72, 3ccm:0, 671-675, 3ccm:0, 68-72, 3ccq:0, 671-675, 3ccq:0, 68-72, 3ccr:0, 671-675, 3ccr:0, 68-72, 3ccs:0, 671-675, 3ccs:0, 68-72, 3ccu:0, 671-675, 3ccu:0, 68-72, 3ccv:0, 671-675, 3ccv:0, 68-72, 3cd6:0, 68-72, 3cf5:X, 1338-1342, 3cf5:X, 557-561, 3cma:0, 671-675, 3cma:0, 68-72, 3cme:0, 671-675, 3cme:0, 68-72, 3cpw:0, 671-675, 3cpw:0, 68-72, 3d5b:A, 1254-1258, 3d5b:A, 75-79, 3d5d:A, 1254-1258, 3d5d:A, 75-79
GUA
1vs5:A, 680-684, 1vs7:A, 680-684, 2avy:A, 680-684, 2aw7:A, 680-684, 2i2p:A, 680-684, 2i2u:A, 680-684, 2qal:A, 680-684, 2qan:A, 680-684, 2qb9:A, 680-684, 2qbb:A, 680-684, 2qbd:A, 680-684, 2qbf:A, 680-684, 2qbh:A, 680-684, 2qbj:A, 680-684, 2qou:A, 680-684, 2qow:A, 680-684, 2qoy:A, 680-684, 2qp0:A, 680-684, 2z4k:A, 680-684, 2z4m:A, 680-684, 3df1:A, 680-684, 3df3:A, 680-684
UAA
1vs6:B, 81-85, 2aw4:B, 81-85, 2awb:B, 81-85, 2gya:0, 65-69, 2gyc:0, 65-69, 2j28:B, 81-85, 2qbe:B, 81-85, 2vhm:B, 81-85, 3bbx:B, 81-85, 3df4:B, 81-85
UGC
1vor:B, 2809-2813, 1vou:B, 2809-2813, 1vow:B, 2809-2813, 1voy:B, 2809-2813, 1vp0:B, 2809-2813