Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 6166 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 100 structure(s)
Representative structure 2qov:B (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNV
Cluster members
AAA
1vs6:B, 343-347, 1vs8:B, 343-347, 2aw4:B, 343-347, 2awb:B, 343-347, 2i2t:B, 343-347, 2i2v:B, 343-347, 2j28:B, 343-347, 2qam:B, 343-347, 2qao:B, 343-347, 2qba:B, 343-347, 2qbc:B, 343-347, 2qbe:B, 343-347, 2qbg:B, 343-347, 2qbi:B, 343-347, 2qbk:B, 343-347, 2qov:B, 343-347, 2qox:B, 343-347, 2qoz:B, 343-347, 2qp1:B, 343-347, 2z4l:B, 343-347, 2z4n:B, 343-347, 3bbx:B, 343-347, 3df2:B, 343-347, 3df4:B, 343-347
AAC
1j5a:A, 1509-1513, 1jzx:A, 1509-1513, 1jzy:A, 1509-1513, 1jzz:A, 1509-1513, 1k01:A, 1509-1513, 2o45:A, 1498-1502
AAG
1yl3:A, 2516-2520, 2o43:A, 2432-2436
CCA
1yl3:A, 1686-1690
CGA
1xbp:0, 2241-2245, 2zjp:X, 2152-2156
GAA
1vsp:w, 1576-1580, 2d3o:0, 1799-1803, 2j01:A, 1493-1497, 2j01:A, 356-360, 2j03:A, 1493-1497, 2j03:A, 356-360, 2jl6:A, 1572-1576, 2jl6:A, 356-360, 2jl8:A, 1572-1576, 2jl8:A, 356-360, 2qov:B, 1726-1730, 2qox:B, 1726-1730, 3d5b:A, 1571-1575, 3d5b:A, 363-367, 3d5d:A, 1571-1575, 3d5d:A, 363-367
GAC
2vho:A, 1255-1259, 2vhp:A, 1255-1259
GCA
2gyc:0, 1088-1092
GGA
1hnw:A, 753-757, 1hnz:A, 753-757, 1ibm:A, 753-757, 1j5e:A, 753-757, 1n32:A, 753-757, 1pnx:A, 767-771, 1s1h:A, 758-762, 1yl4:A, 753-757, 2avy:A, 770-774, 2b64:A, 753-757, 2b9m:A, 753-757, 2b9o:A, 753-757, 2f4v:A, 753-757, 2gy9:A, 740-744, 2gyb:A, 740-744, 2hgi:A, 753-757, 2hgp:A, 753-757, 2hgr:A, 753-757, 2i2p:A, 770-774, 2qal:A, 770-774, 2qan:A, 770-774, 2qb9:A, 770-774, 2qbb:A, 770-774, 2qbd:A, 770-774, 2qbf:A, 770-774, 2qoy:A, 770-774, 2qp0:A, 770-774, 2uxc:A, 753-757, 3bbn:A, 717-721, 3df1:A, 770-774, 3df3:A, 770-774
GGC
1nkw:0, 2372-2376
UAA
1vsa:w, 630-634, 1vsp:w, 630-634, 2jyh:A, 35-39, 2jyh:B, 35-39, 2jyj:A, 35-39, 2jyj:B, 35-39, 3bo3:B, 58-62, 3bo4:B, 58-62
UGA
2gyb:A, 1434-1438, 2qbc:B, 359-363, 2v49:A, 374-378
UGG
2hgq:A, 373-377, 2ogo:0, 2048-2052
UUA
2o45:A, 1376-1380