Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 3214 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 263 structure(s)
Representative structure 1xmo:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NDN
Cluster members
AAG
1grz:B, 43-47
AGG
1vs5:A, 138-142, 1vs7:A, 138-142, 2avy:A, 138-142, 2aw7:A, 138-142, 2gy9:A, 131-135, 2gyb:A, 131-135, 2i2p:A, 138-142, 2i2u:A, 138-142, 2qal:A, 138-142, 2qan:A, 138-142, 2qb9:A, 138-142, 2qbb:A, 138-142, 2qbd:A, 138-142, 2qbf:A, 138-142, 2qbh:A, 138-142, 2qbj:A, 138-142, 2qou:A, 138-142, 2qow:A, 138-142, 2qoy:A, 138-142, 2qp0:A, 138-142, 2vho:A, 138-142, 2vhp:A, 138-142, 2z4k:A, 138-142, 2z4m:A, 138-142, 3df1:A, 138-142, 3df3:A, 138-142
AUA
2jl7:W, 6-10
AUC
1vor:B, 2814-2818, 1vou:B, 2814-2818, 1vow:B, 2814-2818, 1voy:B, 2814-2818, 1vp0:B, 2814-2818
CAA
1vsa:w, 1344-1348
CAC
1kog:K, 28-32
CUA
1gax:C, 6-10, 1gax:D, 6-10
GAA
2hgj:A, 1576-1580, 2hgj:A, 728-732, 2hgq:A, 728-732, 2hgu:A, 1576-1580, 2hgu:A, 728-732, 3bwp:A, 333-337, 3d5b:A, 300-304, 3d5d:A, 300-304, 3eog:A, 351-355
GAC
1vs5:A, 1255-1259, 1vs5:A, 300-304, 1vs7:A, 1255-1259, 1vs7:A, 300-304, 2avy:A, 1255-1259, 2avy:A, 300-304, 2aw7:A, 1255-1259, 2aw7:A, 300-304, 2gy9:A, 282-286, 2gyb:A, 282-286, 2i2p:A, 1255-1259, 2i2p:A, 300-304, 2i2u:A, 1255-1259, 2i2u:A, 300-304, 2qal:A, 1255-1259, 2qal:A, 300-304, 2qan:A, 1255-1259, 2qan:A, 300-304, 2qb9:A, 1255-1259, 2qb9:A, 300-304, 2qbb:A, 1255-1259, 2qbb:A, 300-304, 2qbd:A, 1255-1259, 2qbd:A, 300-304, 2qbf:A, 1255-1259, 2qbf:A, 300-304, 2qbh:A, 1255-1259, 2qbh:A, 300-304, 2qbj:A, 1255-1259, 2qbj:A, 300-304, 2qou:A, 1255-1259, 2qou:A, 300-304, 2qow:A, 1255-1259, 2qow:A, 300-304, 2qoy:A, 1255-1259, 2qoy:A, 300-304, 2qp0:A, 1255-1259, 2qp0:A, 300-304, 2vhp:A, 300-304, 2z4k:A, 1255-1259, 2z4k:A, 300-304, 2z4m:A, 1255-1259, 2z4m:A, 300-304, 3df1:A, 1255-1259, 3df1:A, 300-304, 3df3:A, 1255-1259, 3df3:A, 300-304
GAU
3bbn:A, 1202-1206, 3bbn:A, 270-274
GGC
1fjg:A, 295-299, 1hnw:A, 295-299, 1hnx:A, 295-299, 1hnz:A, 295-299, 1hr0:A, 295-299, 1i94:A, 298-302, 1i95:A, 298-302, 1i96:A, 298-302, 1ibk:A, 295-299, 1ibl:A, 295-299, 1ibm:A, 295-299, 1j5e:A, 295-299, 1n32:A, 295-299, 1n33:A, 295-299, 1pns:A, 299-303, 1s1h:A, 300-304, 1voq:A, 299-303, 1vos:A, 299-303, 1vov:A, 299-303, 1vox:A, 299-303, 1voz:A, 299-303, 1xmo:A, 295-299, 1xmq:A, 295-299, 1xnq:A, 295-299, 1xnr:A, 295-299, 2e5l:A, 296-300, 2f4v:A, 295-299, 2hgi:A, 295-299, 2hgj:A, 2470-2474, 2hgp:A, 295-299, 2hgq:A, 2470-2474, 2hgr:A, 295-299, 2hgu:A, 2470-2474, 2hhh:A, 295-299, 2j00:A, 295-299, 2j02:A, 295-299, 2jl5:A, 295-299, 2jl7:A, 295-299, 2ow8:y, 295-299, 2qnh:y, 295-299, 2uu9:A, 295-299, 2uua:A, 295-299, 2uub:A, 295-299, 2uuc:A, 295-299, 2uxb:A, 295-299, 2uxc:A, 295-299, 2uxd:A, 279-283, 2v46:A, 295-299, 2v48:A, 295-299, 2vqe:A, 295-299, 2vqf:A, 295-299, 3d5a:A, 295-299, 3d5c:A, 295-299
GUA
1vs6:B, 1458-1462, 1vs8:B, 1458-1462, 1y0q:A, 118-122, 2aw4:B, 1458-1462, 2awb:B, 1458-1462, 2i2t:B, 1458-1462, 2i2v:B, 1458-1462, 2j28:B, 1458-1462, 2qam:B, 1458-1462, 2qao:B, 1458-1462, 2qba:B, 1458-1462, 2qbc:B, 1458-1462, 2qbe:B, 1458-1462, 2qbg:B, 1458-1462, 2qbi:B, 1458-1462, 2qbk:B, 1458-1462, 2qov:B, 1458-1462, 2qox:B, 1458-1462, 2qoz:B, 1458-1462, 2qp1:B, 1458-1462, 2z4l:B, 1458-1462, 2z4n:B, 1458-1462, 3bbx:B, 1539-1543, 3df2:B, 1458-1462, 3df4:B, 1458-1462
GUU
2gya:0, 2351-2355
UAA
1ffk:0, 654-658, 1jj2:0, 655-659, 1k73:A, 655-659, 1k8a:A, 655-659, 1k9m:A, 655-659, 1kc8:A, 655-659, 1kd1:A, 655-659, 1kqs:0, 655-659, 1m1k:A, 655-659, 1m90:A, 655-659, 1n8r:A, 655-659, 1nji:A, 655-659, 1q7y:A, 655-659, 1q81:A, 655-659, 1q82:A, 655-659, 1q86:A, 655-659, 1qvf:0, 655-659, 1qvg:0, 655-659, 1s1i:3, 657-661, 1s72:0, 655-659, 1vq4:0, 655-659, 1vq5:0, 655-659, 1vq6:0, 655-659, 1vq7:0, 655-659, 1vq8:0, 655-659, 1vq9:0, 655-659, 1vqk:0, 655-659, 1vql:0, 655-659, 1vqm:0, 655-659, 1vqn:0, 655-659, 1vqo:0, 655-659, 1vqp:0, 655-659, 1vs6:B, 606-610, 1vs8:B, 606-610, 1w2b:0, 655-659, 1yhq:0, 655-659, 1yi2:0, 655-659, 1yij:0, 655-659, 1yit:0, 655-659, 1yj9:0, 655-659, 1yjn:0, 655-659, 1yjw:0, 655-659, 2aw4:B, 606-610, 2awb:B, 606-610, 2i2t:B, 606-610, 2i2v:B, 606-610, 2j01:A, 616-620, 2j03:A, 616-620, 2j28:B, 606-610, 2otj:0, 655-659, 2otl:0, 655-659, 2qa4:0, 654-658, 2qam:B, 606-610, 2qao:B, 606-610, 2qba:B, 606-610, 2qbc:B, 606-610, 2qbe:B, 606-610, 2qbg:B, 606-610, 2qbi:B, 606-610, 2qbk:B, 606-610, 2qex:0, 655-659, 2qov:B, 606-610, 2qox:B, 606-610, 2qoz:B, 606-610, 2qp1:B, 606-610, 2z4l:B, 606-610, 2z4n:B, 606-610, 3bbx:B, 606-610, 3cc2:0, 655-659, 3cc4:0, 655-659, 3cc7:0, 655-659, 3cce:0, 655-659, 3ccj:0, 655-659, 3ccl:0, 655-659, 3ccm:0, 655-659, 3ccq:0, 655-659, 3ccr:0, 655-659, 3ccs:0, 655-659, 3ccu:0, 655-659, 3ccv:0, 655-659, 3cd6:0, 655-659, 3cma:0, 655-659, 3cme:0, 655-659, 3cpw:0, 655-659, 3df2:B, 606-610, 3df4:B, 606-610, 3dll:X, 544-548
UAG
1fka:A, 622-626, 2d3o:0, 876-880