Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(003)-Segment cluster 7604 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 228 structure(s)
Representative structure 3ccr:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NNH
Cluster members
AAA
1gid:A, 10-14, 1grz:B, 17-21, 2qus:B, 50-54, 3d5b:A, 918-922, 3d5d:A, 918-922
AGU
2d3o:0, 1175-1179
CAC
1vs5:A, 1462-1466, 2qbd:A, 1462-1466, 2qbf:A, 1462-1466, 2qoy:A, 1462-1466, 2qp0:A, 1462-1466
GAA
1nwx:0, 2564-2568, 1nwy:0, 2564-2568, 2o43:A, 2564-2568, 2ogm:0, 2564-2568, 2ogn:0, 2564-2568, 3d5b:A, 1877-1881, 3d5d:A, 1877-1881
GAC
1i94:A, 1457-1461, 1i95:A, 1457-1461
GCA
1ffk:0, 696-700, 1jj2:0, 697-701, 1k73:A, 697-701, 1k8a:A, 697-701, 1k9m:A, 697-701, 1kc8:A, 697-701, 1kd1:A, 697-701, 1kqs:0, 697-701, 1m1k:A, 697-701, 1m90:A, 697-701, 1n8r:A, 697-701, 1nji:A, 697-701, 1p9x:0, 1293-1297, 1q7y:A, 697-701, 1q81:A, 697-701, 1q82:A, 697-701, 1q86:A, 697-701, 1qvf:0, 697-701, 1qvg:0, 697-701, 1s1i:3, 699-703, 1s72:0, 697-701, 1vq4:0, 697-701, 1vq5:0, 697-701, 1vq6:0, 697-701, 1vq7:0, 697-701, 1vq8:0, 697-701, 1vq9:0, 697-701, 1vqk:0, 697-701, 1vql:0, 697-701, 1vqm:0, 697-701, 1vqn:0, 697-701, 1vqo:0, 697-701, 1vqp:0, 697-701, 1w2b:0, 697-701, 1yhq:0, 697-701, 1yi2:0, 697-701, 1yij:0, 697-701, 1yj9:0, 697-701, 1yjn:0, 697-701, 1yjw:0, 697-701, 2avy:A, 576-580, 2aw7:A, 576-580, 2gy9:A, 546-550, 2o43:A, 1317-1321, 2ogm:0, 1317-1321, 2ogn:0, 1317-1321, 2otj:0, 697-701, 2otl:0, 697-701, 2qa4:0, 696-700, 2qbb:A, 576-580, 2qex:0, 697-701, 3cc2:0, 697-701, 3cc4:0, 697-701, 3cc7:0, 697-701, 3cce:0, 697-701, 3ccj:0, 697-701, 3ccl:0, 697-701, 3ccm:0, 697-701, 3ccq:0, 697-701, 3ccr:0, 697-701, 3ccs:0, 697-701, 3ccu:0, 697-701, 3ccv:0, 697-701, 3cd6:0, 697-701, 3cma:0, 697-701, 3cme:0, 697-701, 3cpw:0, 697-701
GUA
1hr0:A, 559-563, 1i95:A, 562-566, 1ibk:A, 559-563, 1ibl:A, 559-563, 1ibm:A, 559-563, 1n32:A, 559-563, 1n36:A, 559-563, 1njm:0, 2611-2615, 1njn:0, 2611-2615, 1njo:0, 2611-2615, 1njp:0, 2611-2615, 1pnu:0, 2655-2659, 1pny:0, 2655-2659, 1vq8:0, 2618-2622, 1vq9:0, 2618-2622, 1vqk:0, 2618-2622, 1vql:0, 2618-2622, 1vqm:0, 2618-2622, 1vqn:0, 2618-2622, 1vqo:0, 2618-2622, 1vqp:0, 2618-2622, 1vs6:B, 2665-2669, 1vs8:B, 2665-2669, 1xmo:A, 559-563, 1xmq:A, 559-563, 2aw4:B, 2665-2669, 2awb:B, 2665-2669, 2d3o:0, 2632-2636, 2gy9:A, 765-769, 2gyb:A, 765-769, 2hgj:A, 1394-1398, 2hgq:A, 1394-1398, 2hgu:A, 1394-1398, 2i2t:B, 2665-2669, 2i2v:B, 2665-2669, 2j00:A, 559-563, 2j01:A, 1320-1324, 2j02:A, 559-563, 2j03:A, 1320-1324, 2j28:B, 2665-2669, 2o44:A, 2611-2615, 2ogo:0, 2610-2614, 2qam:B, 2665-2669, 2qao:B, 2665-2669, 2qba:B, 2665-2669, 2qbc:B, 2665-2669, 2qbe:B, 2665-2669, 2qbg:B, 2665-2669, 2qbi:B, 2665-2669, 2qbk:B, 2665-2669, 2qnh:y, 559-563, 2qov:B, 2665-2669, 2qox:B, 2665-2669, 2qoz:B, 2665-2669, 2qp1:B, 2665-2669, 2v46:A, 559-563, 2v48:A, 559-563, 2vqe:A, 559-563, 2vqf:A, 559-563, 2z4l:B, 2665-2669, 2z4n:B, 2665-2669, 2zjp:X, 2522-2526, 2zjr:X, 2519-2523, 3bbn:A, 523-527, 3bbo:A, 2658-2662, 3bbx:B, 2948-2952, 3ccm:0, 2618-2622, 3cma:0, 2618-2622, 3cme:0, 2618-2622, 3cpw:0, 2618-2622, 3d5a:A, 778-782, 3d5b:A, 1390-1394, 3d5c:A, 778-782, 3d5d:A, 1390-1394, 3df2:B, 2665-2669, 3df4:B, 2665-2669, 3dll:X, 2522-2526
GUC
2qa4:0, 1516-1520, 3ccj:0, 1511-1515
UAA
1ffk:0, 1928-1932, 1jj2:0, 1978-1982, 1k73:A, 1978-1982, 1k8a:A, 1978-1982, 1k9m:A, 1978-1982, 1kc8:A, 1978-1982, 1kd1:A, 1978-1982, 1kqs:0, 1978-1982, 1m1k:A, 1978-1982, 1m90:A, 1978-1982, 1n8r:A, 1978-1982, 1nji:A, 1978-1982, 1njm:0, 1298-1302, 1njn:0, 1298-1302, 1njo:0, 1298-1302, 1njp:0, 1298-1302, 1pnu:0, 1314-1318, 1pny:0, 1314-1318, 1q7y:A, 1978-1982, 1q81:A, 1978-1982, 1q82:A, 1978-1982, 1q86:A, 1978-1982, 1qvf:0, 1978-1982, 1qvg:0, 1978-1982, 1s1i:3, 2164-2168, 1s72:0, 1978-1982, 1vor:B, 1314-1318, 1vou:B, 1314-1318, 1vow:B, 1314-1318, 1voy:B, 1314-1318, 1vp0:B, 1314-1318, 1vq4:0, 1978-1982, 1vq5:0, 1978-1982, 1vq6:0, 1978-1982, 1vq7:0, 1978-1982, 1vq8:0, 1978-1982, 1vqp:0, 1978-1982, 1w2b:0, 1978-1982, 1yhq:0, 1978-1982, 1yi2:0, 1978-1982, 1yij:0, 1978-1982, 1yit:0, 1978-1982, 1yjn:0, 1978-1982, 1yjw:0, 1978-1982, 2d3o:0, 1892-1896, 2otj:0, 1978-1982, 2otl:0, 1978-1982, 3bwp:A, 68-72, 3cc2:0, 1978-1982, 3cc4:0, 1978-1982, 3cc7:0, 1978-1982, 3cce:0, 1978-1982, 3ccl:0, 1978-1982, 3ccq:0, 1978-1982, 3ccs:0, 1978-1982, 3ccu:0, 1978-1982, 3ccv:0, 1978-1982, 3cd6:0, 1978-1982, 3cma:0, 1978-1982, 3cme:0, 1978-1982, 3cpw:0, 1978-1982, 3eoh:A, 68-72