Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 3303 (cutoff=2.5 Å)
Cluster size 343 structure(s)
Representative structure 1w2b:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1c2w:B, 1382-1385, 1c2w:B, 1432-1435, 1c2w:B, 2296-2299, 1ffk:0, 2492-2495, 1ffz:A, 414-417, 1j5a:A, 2440-2443, 1jj2:0, 2543-2546, 1jzx:A, 2440-2443, 1jzy:A, 2440-2443, 1k01:A, 2440-2443, 1k73:A, 2543-2546, 1k8a:A, 2543-2546, 1k9m:A, 2543-2546, 1kc8:A, 2543-2546, 1kd1:A, 2543-2546, 1kqs:0, 2543-2546, 1m1k:A, 2543-2546, 1m90:A, 2543-2546, 1n8r:A, 2543-2546, 1nji:A, 2543-2546, 1nkw:0, 2432-2435, 1nwx:0, 2432-2435, 1nwy:0, 2432-2435, 1ond:0, 2431-2434, 1q7y:A, 2543-2546, 1q81:A, 2543-2546, 1q82:A, 2543-2546, 1q86:A, 2543-2546, 1qvf:0, 2543-2546, 1qvg:0, 2543-2546, 1s1i:3, 2859-2862, 1s72:0, 2543-2546, 1sm1:0, 384-387, 1vq4:0, 2543-2546, 1vq5:0, 2543-2546, 1vq6:0, 2543-2546, 1vq7:0, 2543-2546, 1vq8:0, 2543-2546, 1vq9:0, 2543-2546, 1vqk:0, 2543-2546, 1vql:0, 2543-2546, 1vqm:0, 2543-2546, 1vqn:0, 2543-2546, 1vqo:0, 2543-2546, 1vqp:0, 2543-2546, 1vs6:B, 2487-2490, 1vs8:B, 2487-2490, 1vsa:w, 2530-2533, 1w2b:0, 2438-2441, 1w2b:0, 2543-2546, 1xbp:0, 2432-2435, 1xbp:0, 384-387, 1y69:0, 2432-2435, 1yhq:0, 2543-2546, 1yi2:0, 2543-2546, 1yij:0, 2543-2546, 1yit:0, 2543-2546, 1yj9:0, 2543-2546, 1yjn:0, 2543-2546, 1yjw:0, 2543-2546, 2aar:0, 2432-2435, 2aw4:B, 2487-2490, 2awb:B, 2487-2490, 2d3o:0, 2453-2456, 2hgp:A, 977-980, 2hgr:A, 977-980, 2i2t:B, 2487-2490, 2i2v:B, 2487-2490, 2j01:A, 2418-2421, 2j03:A, 2418-2421, 2j28:B, 2487-2490, 2jl6:A, 2497-2500, 2jl8:A, 2497-2500, 2o44:A, 2432-2435, 2o45:A, 2420-2423, 2ogm:0, 2432-2435, 2ogn:0, 2432-2435, 2ogo:0, 2431-2434, 2otj:0, 2543-2546, 2otl:0, 2543-2546, 2ow8:y, 977-980, 2qa4:0, 2548-2551, 2qam:B, 2487-2490, 2qao:B, 2487-2490, 2qbe:B, 2487-2490, 2qbg:B, 2487-2490, 2qbh:A, 999-1002, 2qbi:B, 2487-2490, 2qbj:A, 999-1002, 2qbk:B, 2487-2490, 2qex:0, 2438-2441, 2qex:0, 2543-2546, 2qnh:y, 977-980, 2qow:A, 999-1002, 2v47:A, 2413-2416, 2v49:A, 2413-2416, 2z4l:B, 2487-2490, 2z4n:B, 2487-2490, 2zjp:X, 2343-2346, 2zjq:X, 2343-2346, 2zjr:X, 2340-2343, 3bbx:B, 2770-2773, 3cc2:0, 2543-2546, 3cc4:0, 2543-2546, 3cc7:0, 2543-2546, 3cce:0, 2543-2546, 3ccj:0, 2543-2546, 3ccl:0, 2543-2546, 3ccm:0, 2543-2546, 3ccq:0, 2543-2546, 3ccr:0, 2543-2546, 3ccs:0, 2543-2546, 3ccu:0, 2543-2546, 3ccv:0, 2543-2546, 3cd6:0, 2543-2546, 3cf5:X, 2343-2346, 3cma:0, 2543-2546, 3cme:0, 2543-2546, 3cpw:0, 2543-2546, 3d5b:A, 2525-2528, 3d5d:A, 2525-2528, 3df2:B, 2487-2490, 3df4:B, 2487-2490, 3dll:X, 2343-2346
AC
1c2w:B, 1772-1775, 1k9m:A, 1149-1152, 1kd1:A, 1149-1152, 1m1k:A, 1149-1152, 1q7y:A, 1149-1152, 1q86:A, 1149-1152, 1qvg:0, 1149-1152, 1xbp:0, 1507-1510, 2zjp:X, 999-1002, 2zjq:X, 999-1002, 2zjr:X, 996-999, 3ccs:0, 1149-1152, 3cd6:0, 1149-1152, 3cf5:X, 999-1002, 3dll:X, 999-1002
AG
1c2w:B, 1508-1511
AU
1c04:E, 26-29, 1c2w:B, 1076-1079, 1hc8:C, 26-29, 1hc8:D, 26-29, 1qa6:C, 26-29, 1qa6:D, 26-29, 1vsp:w, 1101-1104, 1y39:C, 26-29, 1y39:D, 26-29, 2gya:0, 1003-1006, 2vhm:B, 1060-1063
CA
1c2w:B, 1789-1792, 1c2w:B, 268-271, 1vor:B, 1937-1940, 1vou:B, 1937-1940, 1vow:B, 1937-1940, 1voy:B, 1937-1940, 1vp0:B, 1937-1940, 2ow8:y, 1236-1239, 2qnh:y, 1236-1239
CU
1c2w:B, 1645-1648, 1z58:2, 1749-1752
GA
1c2w:B, 2124-2127, 1c2w:B, 2344-2347, 1c2w:B, 2350-2353, 1c2w:B, 554-557, 1ffk:0, 749-752, 1j5a:A, 1761-1764, 1jj2:0, 753-756, 1jzx:A, 1761-1764, 1jzy:A, 1761-1764, 1jzz:A, 1761-1764, 1k01:A, 1761-1764, 1k73:A, 753-756, 1k8a:A, 753-756, 1k9m:A, 753-756, 1kc8:A, 753-756, 1kd1:A, 753-756, 1kqs:0, 753-756, 1m1k:A, 753-756, 1m90:A, 753-756, 1n8r:A, 753-756, 1nji:A, 753-756, 1njm:0, 2242-2245, 1njn:0, 2242-2245, 1njo:0, 2242-2245, 1njp:0, 2242-2245, 1pnu:0, 2286-2289, 1pny:0, 2286-2289, 1q7y:A, 753-756, 1q81:A, 753-756, 1q82:A, 753-756, 1q86:A, 753-756, 1qvf:0, 753-756, 1qvg:0, 753-756, 1s1i:3, 752-755, 1s72:0, 753-756, 1sm1:0, 1753-1756, 1vq4:0, 753-756, 1vq5:0, 753-756, 1vq6:0, 753-756, 1vq7:0, 753-756, 1vq8:0, 753-756, 1vq9:0, 753-756, 1vqk:0, 753-756, 1vql:0, 753-756, 1vqm:0, 753-756, 1vqn:0, 753-756, 1vqo:0, 753-756, 1vqp:0, 753-756, 1vs6:B, 668-671, 1vs8:B, 668-671, 1vsa:w, 2340-2343, 1vsa:w, 694-697, 1vsp:w, 2340-2343, 1vsp:w, 694-697, 1w2b:0, 753-756, 1y69:0, 631-634, 1yhq:0, 753-756, 1yi2:0, 753-756, 1yij:0, 753-756, 1yit:0, 753-756, 1yj9:0, 753-756, 1yjn:0, 753-756, 1yjw:0, 753-756, 2aar:0, 631-634, 2aw4:B, 668-671, 2awb:B, 668-671, 2hgj:A, 693-696, 2hgq:A, 693-696, 2hgu:A, 693-696, 2i2t:B, 1811-1814, 2i2t:B, 668-671, 2i2v:B, 1811-1814, 2i2v:B, 668-671, 2j01:A, 1753-1756, 2j01:A, 677-680, 2j03:A, 1753-1756, 2j03:A, 677-680, 2j28:B, 668-671, 2jl6:A, 704-707, 2jl8:A, 704-707, 2o43:A, 631-634, 2o44:A, 1753-1756, 2o45:A, 1750-1753, 2o45:A, 631-634, 2ogm:0, 1753-1756, 2ogm:0, 631-634, 2ogo:0, 1752-1755, 2otj:0, 753-756, 2otl:0, 753-756, 2qa4:0, 752-755, 2qam:B, 668-671, 2qao:B, 668-671, 2qba:B, 1811-1814, 2qba:B, 668-671, 2qbc:B, 1811-1814, 2qbc:B, 668-671, 2qbe:B, 668-671, 2qbg:B, 668-671, 2qbi:B, 668-671, 2qbk:B, 668-671, 2qex:0, 753-756, 2qov:B, 668-671, 2qox:B, 668-671, 2qoz:B, 1811-1814, 2qoz:B, 668-671, 2qp1:B, 1811-1814, 2qp1:B, 668-671, 2v47:A, 677-680, 2v49:A, 677-680, 2vhm:B, 1811-1814, 2vhn:B, 1811-1814, 2z4l:B, 1811-1814, 2z4l:B, 668-671, 2z4n:B, 1811-1814, 2z4n:B, 668-671, 2zjp:X, 609-612, 2zjq:X, 609-612, 2zjr:X, 609-612, 3bbx:B, 668-671, 3cc2:0, 753-756, 3cc4:0, 753-756, 3cc7:0, 753-756, 3cce:0, 753-756, 3ccj:0, 753-756, 3ccl:0, 753-756, 3ccm:0, 753-756, 3ccq:0, 753-756, 3ccr:0, 753-756, 3ccs:0, 753-756, 3ccu:0, 753-756, 3ccv:0, 753-756, 3cd6:0, 753-756, 3cf5:X, 609-612, 3cma:0, 753-756, 3cme:0, 753-756, 3cpw:0, 753-756, 3d5b:A, 2119-2122, 3d5b:A, 689-692, 3d5d:A, 2119-2122, 3d5d:A, 689-692, 3df2:B, 1811-1814, 3df2:B, 668-671, 3df4:B, 1811-1814, 3df4:B, 668-671, 3dll:X, 609-612
GC
1c2w:B, 2281-2284
GG
1c2w:B, 2643-2646, 1sm1:0, 2128-2131, 1vs8:B, 2183-2186, 1vsa:w, 1905-1908, 1vsa:w, 2226-2229, 1vsp:w, 2226-2229, 1xbp:0, 1822-1825, 1yl3:A, 2212-2215, 1z58:2, 2107-2110, 2awb:B, 2183-2186, 2gya:0, 2107-2110, 2hgq:A, 1905-1908, 2j28:B, 2183-2186, 2jl6:A, 1511-1514, 2jl6:A, 363-366, 2jl8:A, 1511-1514, 2jl8:A, 363-366, 2qov:B, 2183-2186, 2qox:B, 2183-2186, 2qoz:B, 2183-2186, 2qp1:B, 2183-2186, 2v49:A, 1822-1825, 3d5b:A, 370-373, 3d5d:A, 370-373
GU
2oiu:Q, 17-20
UC
1vsp:x, 107-110, 2hgu:B, 109-112
UG
2jse:A, 4-7
UU
1vsa:w, 1084-1087, 1vsa:w, 835-838, 2nr0:E, 59-62, 2nr0:G, 48-51, 2qbd:A, 432-435, 2qbf:A, 432-435, 2qou:A, 432-435