Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 8210 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 371 structure(s)
Representative structure 3d5d:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence ND
Cluster members
AA
1ffk:0, 649-652, 1j5a:A, 389-392, 1jj2:0, 650-653, 1jzx:A, 389-392, 1jzy:A, 389-392, 1jzz:A, 389-392, 1k01:A, 389-392, 1k73:A, 650-653, 1k8a:A, 650-653, 1k9m:A, 650-653, 1kc8:A, 650-653, 1kd1:A, 650-653, 1kqs:0, 650-653, 1m1k:A, 650-653, 1m90:A, 650-653, 1mji:C, 26-29, 1n8r:A, 650-653, 1nji:A, 650-653, 1njm:0, 384-387, 1njn:0, 384-387, 1njo:0, 384-387, 1njp:0, 384-387, 1nkw:0, 384-387, 1nwx:0, 384-387, 1nwy:0, 384-387, 1ond:0, 384-387, 1pnu:0, 384-387, 1pny:0, 384-387, 1q7y:A, 650-653, 1q81:A, 650-653, 1q82:A, 650-653, 1q86:A, 650-653, 1qvf:0, 650-653, 1qvg:0, 650-653, 1s1i:3, 652-655, 1s72:0, 650-653, 1u9s:A, 148-151, 1vq4:0, 650-653, 1vq5:0, 650-653, 1vq6:0, 650-653, 1vq7:0, 650-653, 1vq8:0, 650-653, 1vq9:0, 650-653, 1vqk:0, 650-653, 1vql:0, 650-653, 1vqm:0, 650-653, 1vqn:0, 650-653, 1vqo:0, 650-653, 1vqp:0, 650-653, 1vs5:A, 541-544, 1vs6:B, 601-604, 1vs7:A, 541-544, 1vs8:B, 601-604, 1vsa:w, 934-937, 1vsp:w, 449-452, 1vsp:w, 934-937, 1w2b:0, 650-653, 1xbp:0, 384-387, 1y69:0, 384-387, 1yhq:0, 650-653, 1yi2:0, 650-653, 1yij:0, 650-653, 1yit:0, 650-653, 1yj9:0, 650-653, 1yjn:0, 650-653, 1yjw:0, 650-653, 2a2e:A, 212-215, 2avy:A, 541-544, 2aw4:B, 601-604, 2aw7:A, 541-544, 2awb:B, 601-604, 2b66:A, 448-451, 2b9n:A, 448-451, 2b9p:A, 448-451, 2d3o:0, 384-387, 2gy9:A, 511-514, 2gya:0, 544-547, 2hgj:A, 448-451, 2hgq:A, 448-451, 2hgu:A, 448-451, 2i2p:A, 541-544, 2i2t:B, 601-604, 2i2t:B, 82-85, 2i2u:A, 541-544, 2i2v:B, 601-604, 2i2v:B, 82-85, 2j28:B, 601-604, 2o43:A, 384-387, 2o44:A, 384-387, 2ogm:0, 384-387, 2ogn:0, 384-387, 2ogo:0, 383-386, 2otj:0, 650-653, 2otl:0, 650-653, 2qa4:0, 649-652, 2qal:A, 541-544, 2qam:B, 601-604, 2qam:B, 82-85, 2qan:A, 541-544, 2qao:B, 601-604, 2qao:B, 82-85, 2qb9:A, 541-544, 2qba:B, 601-604, 2qba:B, 82-85, 2qbb:A, 541-544, 2qbc:B, 601-604, 2qbc:B, 82-85, 2qbd:A, 541-544, 2qbe:B, 601-604, 2qbf:A, 541-544, 2qbg:B, 601-604, 2qbg:B, 82-85, 2qbh:A, 541-544, 2qbi:B, 601-604, 2qbj:A, 541-544, 2qbk:B, 601-604, 2qex:0, 650-653, 2qou:A, 541-544, 2qov:B, 601-604, 2qow:A, 541-544, 2qox:B, 601-604, 2qoy:A, 541-544, 2qoz:B, 601-604, 2qp0:A, 541-544, 2qp1:B, 601-604, 2z4k:A, 541-544, 2z4l:B, 601-604, 2z4m:A, 541-544, 2z4n:B, 601-604, 3bbn:A, 488-491, 3bbx:B, 601-604, 3bo0:D, 4-7, 3bo1:D, 4-7, 3cc2:0, 650-653, 3cc4:0, 650-653, 3cc7:0, 650-653, 3cce:0, 650-653, 3ccj:0, 650-653, 3ccl:0, 650-653, 3ccm:0, 650-653, 3ccq:0, 650-653, 3ccr:0, 650-653, 3ccs:0, 650-653, 3ccu:0, 650-653, 3ccv:0, 650-653, 3cd6:0, 650-653, 3cma:0, 650-653, 3cme:0, 650-653, 3cpw:0, 650-653, 3df1:A, 541-544, 3df2:B, 601-604, 3df2:B, 82-85, 3df3:A, 541-544, 3df4:B, 601-604, 3dll:X, 362-365
AG
1vsa:w, 1582-1585
AU
1syz:A, 17-20, 1yl4:1, 9-12
CA
1fjg:A, 1077-1080, 1hnx:A, 1077-1080, 1hr0:A, 1077-1080, 1i95:A, 1080-1083, 1i96:A, 1080-1083, 1ibl:A, 1077-1080, 1j5e:A, 1077-1080, 1nwx:0, 2492-2495, 1pns:A, 1093-1096, 1pnx:A, 1093-1096, 1s1h:A, 1078-1081, 1vs5:A, 1095-1098, 1vs7:A, 1095-1098, 1xmo:A, 1072-1075, 1xmq:A, 1072-1075, 1xnr:A, 1072-1075, 2aw7:A, 1095-1098, 2hgi:A, 1077-1080, 2hgp:A, 1077-1080, 2hgr:A, 1077-1080, 2i2p:A, 1095-1098, 2i2u:A, 1095-1098, 2qal:A, 1095-1098, 2qan:A, 1095-1098, 2qb9:A, 1095-1098, 2qbb:A, 1095-1098, 2qbd:A, 1095-1098, 2qbf:A, 1095-1098, 2qbh:A, 1095-1098, 2qbj:A, 1095-1098, 2qou:A, 1095-1098, 2qow:A, 1095-1098, 2qoy:A, 1095-1098, 2qp0:A, 1095-1098, 2uu9:A, 1077-1080, 2uub:A, 1077-1080, 2uuc:A, 1077-1080, 2uxd:A, 1056-1059, 2vqe:A, 1077-1080, 2vqf:A, 1077-1080, 2z4k:A, 1095-1098, 2z4m:A, 1095-1098, 3d5a:A, 1077-1080, 3d5c:A, 1077-1080, 3df1:A, 1095-1098, 3df3:A, 1095-1098
GA
1fjg:A, 524-527, 1hnw:A, 524-527, 1hnx:A, 524-527, 1hnz:A, 524-527, 1hr0:A, 524-527, 1i94:A, 527-530, 1i95:A, 527-530, 1i96:A, 527-530, 1ibk:A, 524-527, 1ibl:A, 524-527, 1ibm:A, 524-527, 1j5a:A, 1823-1826, 1j5e:A, 524-527, 1jzx:A, 1823-1826, 1jzy:A, 1823-1826, 1jzz:A, 1823-1826, 1k01:A, 1823-1826, 1n32:A, 524-527, 1n33:A, 524-527, 1n34:A, 524-527, 1n36:A, 524-527, 1pnx:A, 538-541, 1u63:B, 10-13, 1u63:D, 10-13, 1voq:A, 538-541, 1vos:A, 538-541, 1vov:A, 538-541, 1vox:A, 538-541, 1voz:A, 538-541, 1vs6:B, 635-638, 1vs8:B, 635-638, 1vsa:w, 625-628, 1vsa:w, 661-664, 1vsp:w, 625-628, 1vsp:w, 661-664, 1xmo:A, 524-527, 1xmq:A, 524-527, 1xnq:A, 524-527, 1xnr:A, 524-527, 1yl3:A, 1898-1901, 1yl4:A, 524-527, 1zho:B, 10-13, 1zho:D, 10-13, 1zho:F, 10-13, 1zho:H, 10-13, 2aw4:B, 635-638, 2awb:B, 635-638, 2b64:A, 524-527, 2b9m:A, 524-527, 2b9o:A, 524-527, 2e5l:A, 525-528, 2f4v:A, 524-527, 2gya:0, 573-576, 2gyb:A, 365-368, 2hgi:A, 524-527, 2hgp:A, 524-527, 2hgr:A, 524-527, 2hhh:A, 524-527, 2hw8:B, 9-12, 2i2t:B, 635-638, 2i2v:B, 635-638, 2j00:A, 524-527, 2j01:A, 611-614, 2j01:A, 647-650, 2j02:A, 524-527, 2j03:A, 611-614, 2j03:A, 647-650, 2j28:B, 635-638, 2jl5:A, 524-527, 2jl6:A, 613-616, 2jl6:A, 649-652, 2jl7:A, 524-527, 2jl8:A, 613-616, 2jl8:A, 649-652, 2ow8:y, 524-527, 2qam:B, 635-638, 2qao:B, 635-638, 2qba:B, 635-638, 2qbc:B, 635-638, 2qbe:B, 635-638, 2qbg:B, 635-638, 2qbi:B, 635-638, 2qbk:B, 635-638, 2qnh:y, 524-527, 2qov:B, 635-638, 2qox:B, 635-638, 2qoz:B, 635-638, 2qp1:B, 635-638, 2uu9:A, 524-527, 2uua:A, 524-527, 2uub:A, 524-527, 2uuc:A, 524-527, 2uxb:A, 524-527, 2uxc:A, 524-527, 2uxd:A, 502-505, 2v47:A, 611-614, 2v49:A, 611-614, 2vhm:B, 635-638, 2vpl:B, 9-12, 2vpl:D, 9-12, 2vqe:A, 524-527, 2vqf:A, 524-527, 2z4l:B, 635-638, 2z4n:B, 635-638, 2zjp:X, 539-542, 2zjq:X, 539-542, 2zjr:X, 539-542, 3bbx:B, 635-638, 3cf5:X, 539-542, 3d5a:A, 524-527, 3d5b:A, 620-623, 3d5b:A, 656-659, 3d5c:A, 524-527, 3d5d:A, 620-623, 3d5d:A, 656-659, 3df2:B, 635-638, 3df4:B, 635-638, 3dll:X, 539-542, 5msf:R, 3-6, 5msf:S, 2-5
GG
1sm1:0, 2128-2131, 1u1y:R, 3-6, 1u1y:S, 2-5, 1vs8:B, 2183-2186, 1vsa:w, 2226-2229, 1yl4:A, 897-900, 1z58:2, 2107-2110, 2awb:B, 2183-2186, 2i2t:B, 2183-2186, 2i2v:B, 2183-2186, 2j28:B, 2183-2186, 2jl6:A, 363-366, 2jl8:A, 363-366, 2qbe:B, 2183-2186, 2qbg:B, 2183-2186, 2qbi:B, 2183-2186, 2qbk:B, 2183-2186, 2qov:B, 2183-2186, 2qox:B, 2183-2186, 2qoz:B, 2183-2186, 2qp1:B, 2183-2186
UG
484d:B, 7-10
UU
1nkw:0, 1991-1994, 1ond:0, 1990-1993, 1p9x:0, 1966-1969, 1pnu:0, 2016-2019, 1pnx:A, 398-401, 1pny:0, 2016-2019, 1vsp:w, 2074-2077, 1xbp:0, 1991-1994, 1yl3:A, 2074-2077, 2b66:A, 2074-2077, 2b9n:A, 2074-2077, 2b9p:A, 2074-2077, 2hgp:A, 394-397, 2hgr:A, 394-397, 2hgu:A, 2074-2077, 2ogo:0, 1990-1993, 2ow8:y, 1102-1105, 2qba:B, 2058-2061, 2qbi:B, 2058-2061, 2qbk:B, 2058-2061, 2qnh:y, 1102-1105, 2qov:B, 2058-2061, 2qox:B, 2058-2061, 2z4l:B, 2058-2061, 2z4n:B, 2058-2061