Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 379 (cutoff=2.0 Å)
Cluster size 52 structure(s)
Representative structure 1i96:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DH
Cluster members
AA
1sm1:0, 384-387, 2qba:B, 1491-1494, 2qbc:B, 1491-1494, 2qbi:B, 1491-1494, 2qbk:B, 1491-1494, 2qov:B, 1491-1494, 2qox:B, 1491-1494, 2qoz:B, 1491-1494
GA
1c2w:B, 2124-2127, 1c2w:B, 2285-2288
GU
2gy9:A, 381-384, 2i2p:A, 399-402, 2i2u:A, 399-402, 2qal:A, 399-402, 2qan:A, 399-402, 2qb9:A, 399-402, 2qbb:A, 399-402, 2qbh:A, 399-402, 2qbj:A, 399-402, 2qou:A, 399-402, 2qow:A, 399-402, 2qoy:A, 399-402, 2qp0:A, 399-402, 2z4k:A, 399-402, 2z4m:A, 399-402, 3df1:A, 399-402, 3df3:A, 399-402
UA
2hgp:B, 7-10
UC
1vsp:x, 107-110, 2hgj:B, 109-112, 2hgq:B, 109-112
UU
1c2w:B, 809-812, 1hnw:A, 394-397, 1i94:A, 397-400, 1i95:A, 397-400, 1i96:A, 397-400, 1i97:A, 397-400, 1ibk:A, 394-397, 1ibl:A, 394-397, 1n32:A, 394-397, 1n33:A, 394-397, 1s1h:A, 399-402, 2e5l:A, 395-398, 2hgi:A, 394-397, 2hhh:A, 394-397, 2jl5:A, 394-397, 2jl7:A, 394-397, 2nr0:H, 51-54, 2v46:A, 394-397, 2v48:A, 394-397, 3d5a:A, 394-397, 3d5c:A, 394-397