Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 5117 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 282 structure(s)
Representative structure 2jl7:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1nbs:B, 142-145, 1vs6:B, 1882-1885, 1vs8:B, 1882-1885, 2aw4:B, 1882-1885, 2awb:B, 1882-1885, 2i2t:B, 1882-1885, 2i2v:B, 1882-1885, 2j28:B, 1882-1885, 2qam:B, 1882-1885, 2qao:B, 1882-1885, 2qba:B, 1882-1885, 2qbc:B, 1882-1885, 2qbe:B, 1882-1885, 2qbg:B, 1882-1885, 2qbi:B, 1882-1885, 2qbk:B, 1882-1885, 2qov:B, 1882-1885, 2qox:B, 1882-1885, 2qoz:B, 1882-1885, 2qp1:B, 1882-1885, 2z4l:B, 1882-1885, 2z4n:B, 1882-1885, 3bbx:B, 1975-1978, 3df2:B, 1882-1885, 3df4:B, 1882-1885
AG
2gyc:0, 1546-1549
AU
1ffk:0, 1621-1624, 1jj2:0, 1671-1674, 1k73:A, 1671-1674, 1k8a:A, 1671-1674, 1k9m:A, 1671-1674, 1kc8:A, 1671-1674, 1kd1:A, 1671-1674, 1kqs:0, 1671-1674, 1m1k:A, 1671-1674, 1m90:A, 1671-1674, 1n8r:A, 1671-1674, 1nji:A, 1671-1674, 1q7y:A, 1671-1674, 1q81:A, 1671-1674, 1q82:A, 1671-1674, 1q86:A, 1671-1674, 1qvf:0, 1671-1674, 1qvg:0, 1671-1674, 1s1i:3, 1779-1782, 1s72:0, 1671-1674, 1vq4:0, 1671-1674, 1vq5:0, 1671-1674, 1vq6:0, 1671-1674, 1vq7:0, 1671-1674, 1yi2:0, 1671-1674, 1yij:0, 1671-1674, 1yit:0, 1671-1674, 1yjn:0, 1671-1674, 1yjw:0, 1671-1674, 2otl:0, 1671-1674, 2qa4:0, 1676-1679, 3ccj:0, 1671-1674, 3ccr:0, 1671-1674, 3ccs:0, 1671-1674
CA
1ffk:0, 1860-1863, 1jj2:0, 1910-1913, 1k73:A, 1910-1913, 1k8a:A, 1910-1913, 1k9m:A, 1910-1913, 1kc8:A, 1910-1913, 1kd1:A, 1910-1913, 1kqs:0, 1910-1913, 1m1k:A, 1910-1913, 1m90:A, 1910-1913, 1n8r:A, 1910-1913, 1nji:A, 1910-1913, 1q7y:A, 1910-1913, 1q81:A, 1910-1913, 1q82:A, 1910-1913, 1q86:A, 1910-1913, 1qvf:0, 1910-1913, 1qvg:0, 1910-1913, 1s1i:3, 2018-2021, 1s72:0, 1910-1913, 1vq4:0, 1910-1913, 1vq5:0, 1910-1913, 1vq6:0, 1910-1913, 1vq7:0, 1910-1913, 1vq8:0, 1910-1913, 1vq9:0, 1910-1913, 1vqk:0, 1910-1913, 1vql:0, 1910-1913, 1vqm:0, 1910-1913, 1vqn:0, 1910-1913, 1vqo:0, 1910-1913, 1vqp:0, 1910-1913, 1w2b:0, 1910-1913, 1yhq:0, 1910-1913, 1yi2:0, 1910-1913, 1yij:0, 1910-1913, 1yit:0, 1910-1913, 1yj9:0, 1910-1913, 1yjn:0, 1910-1913, 1yjw:0, 1910-1913, 2otj:0, 1910-1913, 2otl:0, 1910-1913, 2qa4:0, 1915-1918, 2qex:0, 1910-1913, 3cc2:0, 1910-1913, 3cc4:0, 1910-1913, 3cc7:0, 1910-1913, 3cce:0, 1910-1913, 3ccj:0, 1910-1913, 3ccl:0, 1910-1913, 3ccm:0, 1910-1913, 3ccq:0, 1910-1913, 3ccr:0, 1910-1913, 3ccs:0, 1910-1913, 3ccu:0, 1910-1913, 3ccv:0, 1910-1913, 3cd6:0, 1910-1913, 3cma:0, 1910-1913, 3cme:0, 1910-1913, 3cpw:0, 1910-1913
GA
1sm1:0, 1815-1818, 1vs5:A, 59-62, 1vs7:A, 59-62, 1vsp:w, 1898-1901, 1vsp:w, 967-970, 1xbp:0, 1815-1818, 1y69:0, 1815-1818, 1yl3:A, 1898-1901, 2aar:0, 1815-1818, 2avy:A, 59-62, 2aw7:A, 59-62, 2gy9:A, 59-62, 2gyb:A, 59-62, 2hgj:A, 1898-1901, 2hgq:A, 1898-1901, 2hgu:A, 1898-1901, 2i2p:A, 59-62, 2i2u:A, 59-62, 2j01:A, 1815-1818, 2j03:A, 1815-1818, 2jl6:A, 1894-1897, 2jl8:A, 1894-1897, 2ogo:0, 1814-1817, 2om7:G, 50-53, 2qal:A, 59-62, 2qan:A, 59-62, 2qb9:A, 59-62, 2qbb:A, 59-62, 2qbd:A, 59-62, 2qbf:A, 59-62, 2qbh:A, 59-62, 2qbj:A, 59-62, 2qou:A, 59-62, 2qow:A, 59-62, 2qoy:A, 59-62, 2qp0:A, 59-62, 2v47:A, 1815-1818, 2v49:A, 1815-1818, 2z4k:A, 59-62, 2z4m:A, 59-62, 2zjp:X, 1793-1796, 2zjq:X, 1793-1796, 2zjr:X, 1790-1793, 3cf5:X, 1793-1796, 3d5b:A, 1893-1896, 3d5d:A, 1893-1896, 3df1:A, 59-62, 3df3:A, 59-62
GC
1fjg:A, 1030-1033, 1hnw:A, 1030-1033, 1hnx:A, 1030-1033, 1hnz:A, 1030-1033, 1hr0:A, 1030-1033, 1i95:A, 1033-1036, 1i96:A, 1033-1036, 1ibk:A, 1030-1033, 1ibm:A, 1030-1033, 1j5e:A, 1030-1033, 1n32:A, 1030-1033, 1pns:A, 1046-1049, 1pnx:A, 1046-1049, 1s1h:A, 1031-1034, 1vs5:A, 1048-1051, 1vs7:A, 1048-1051, 1xmo:A, 1025-1028, 1xmq:A, 1025-1028, 2avy:A, 1048-1051, 2aw7:A, 1048-1051, 2e5l:A, 1031-1034, 2f4v:A, 1030-1033, 2gy9:A, 1012-1015, 2gyb:A, 1012-1015, 2hhh:A, 1030-1033, 2i2p:A, 1048-1051, 2i2u:A, 1048-1051, 2j00:A, 1030-1033, 2j02:A, 1030-1033, 2jl5:A, 1030-1033, 2jl7:A, 1030-1033, 2qal:A, 1048-1051, 2qan:A, 1048-1051, 2qb9:A, 1048-1051, 2qbb:A, 1048-1051, 2qbd:A, 1048-1051, 2qbf:A, 1048-1051, 2qbh:A, 1048-1051, 2qbj:A, 1048-1051, 2qou:A, 1048-1051, 2qow:A, 1048-1051, 2qoy:A, 1048-1051, 2qp0:A, 1048-1051, 2uu9:A, 1030-1033, 2uua:A, 1030-1033, 2uub:A, 1030-1033, 2uuc:A, 1030-1033, 2uxc:A, 1030-1033, 2vqe:A, 1030-1033, 2vqf:A, 1030-1033, 2z4k:A, 1048-1051, 2z4m:A, 1048-1051, 3bbn:A, 996-999, 3df1:A, 1048-1051, 3df3:A, 1048-1051
GG
3bbn:A, 59-62
GU
1fjg:A, 59-62, 1hnw:A, 59-62, 1hnx:A, 59-62, 1hnz:A, 59-62, 1hr0:A, 59-62, 1i94:A, 62-65, 1i95:A, 62-65, 1i96:A, 62-65, 1ibk:A, 59-62, 1ibl:A, 59-62, 1ibm:A, 59-62, 1j5e:A, 59-62, 1n32:A, 59-62, 1n33:A, 59-62, 1n34:A, 59-62, 1pns:A, 59-62, 1pnx:A, 59-62, 1s1h:A, 59-62, 1voq:A, 59-62, 1vos:A, 59-62, 1vov:A, 59-62, 1vox:A, 59-62, 1voz:A, 59-62, 1xmo:A, 59-62, 1xmq:A, 59-62, 1xnq:A, 59-62, 1xnr:A, 59-62, 1yl4:A, 59-62, 2b64:A, 59-62, 2b9m:A, 59-62, 2b9o:A, 59-62, 2e5l:A, 60-63, 2f4v:A, 59-62, 2hgi:A, 59-62, 2hgp:A, 59-62, 2hgr:A, 59-62, 2hhh:A, 59-62, 2j00:A, 59-62, 2j02:A, 59-62, 2jl5:A, 59-62, 2jl7:A, 59-62, 2ow8:y, 59-62, 2qnh:y, 59-62, 2uu9:A, 59-62, 2uua:A, 59-62, 2uub:A, 59-62, 2uuc:A, 59-62, 2uxb:A, 59-62, 2uxc:A, 59-62, 2uxd:A, 59-62, 2v46:A, 59-62, 2v48:A, 59-62, 2vqe:A, 59-62, 2vqf:A, 59-62, 3d5a:A, 59-62, 3d5c:A, 59-62
UC
1nbk:A, 22-25
UU
1nbk:A, 6-9