Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 1446 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 517 structure(s)
Representative structure 1nkw:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1ffk:0, 2388-2391, 1ffz:A, 414-417, 1fg0:A, 414-417, 1jj2:0, 2438-2441, 1k73:A, 2438-2441, 1k8a:A, 2438-2441, 1k9m:A, 2438-2441, 1kc8:A, 2438-2441, 1kd1:A, 2438-2441, 1kqs:0, 2438-2441, 1m1k:A, 2438-2441, 1m90:A, 2438-2441, 1n8r:A, 2438-2441, 1nji:A, 2438-2441, 1nkw:0, 2432-2435, 1nwx:0, 2432-2435, 1nwy:0, 2432-2435, 1ond:0, 2431-2434, 1q7y:A, 2438-2441, 1q81:A, 2438-2441, 1q82:A, 2438-2441, 1q86:A, 2438-2441, 1qvf:0, 2438-2441, 1qvg:0, 2438-2441, 1s1i:3, 2755-2758, 1s72:0, 2438-2441, 1vq4:0, 2438-2441, 1vq5:0, 2438-2441, 1vq6:0, 2438-2441, 1vq7:0, 2438-2441, 1vq8:0, 2438-2441, 1vq9:0, 2438-2441, 1vqk:0, 2438-2441, 1vql:0, 2438-2441, 1vqm:0, 2438-2441, 1vqn:0, 2438-2441, 1vqo:0, 2438-2441, 1vqp:0, 2438-2441, 1vsa:w, 2530-2533, 1w2b:0, 2438-2441, 1yhq:0, 2438-2441, 1yi2:0, 2438-2441, 1yij:0, 2438-2441, 1yit:0, 2438-2441, 1yj9:0, 2438-2441, 1yjn:0, 2438-2441, 1yjw:0, 2438-2441, 2aar:0, 2432-2435, 2gya:0, 2402-2405, 2j01:A, 2418-2421, 2j03:A, 2418-2421, 2jl6:A, 2497-2500, 2jl8:A, 2497-2500, 2o44:A, 2432-2435, 2ogn:0, 2432-2435, 2otj:0, 2438-2441, 2otl:0, 2438-2441, 2qa4:0, 2443-2446, 2qex:0, 2438-2441, 2v47:A, 2413-2416, 2v49:A, 2413-2416, 2zjp:X, 2343-2346, 3cc2:0, 2438-2441, 3cc4:0, 2438-2441, 3cc7:0, 2438-2441, 3cce:0, 2438-2441, 3ccj:0, 2438-2441, 3ccl:0, 2438-2441, 3ccm:0, 2438-2441, 3ccq:0, 2438-2441, 3ccr:0, 2438-2441, 3ccs:0, 2438-2441, 3ccu:0, 2438-2441, 3ccv:0, 2438-2441, 3cd6:0, 2438-2441, 3cma:0, 2438-2441, 3cme:0, 2438-2441, 3cpw:0, 2438-2441
AC
2zjp:X, 999-1002, 2zjr:X, 996-999, 3cf5:X, 999-1002, 3dll:X, 999-1002
AG
1ffk:0, 625-628, 1jj2:0, 626-629, 1k73:A, 626-629, 1k8a:A, 626-629, 1k9m:A, 626-629, 1kc8:A, 626-629, 1kd1:A, 626-629, 1kqs:0, 626-629, 1m1k:A, 626-629, 1m90:A, 626-629, 1n8r:A, 626-629, 1nji:A, 626-629, 1q7y:A, 626-629, 1q81:A, 626-629, 1q82:A, 626-629, 1q86:A, 626-629, 1qvf:0, 626-629, 1qvg:0, 626-629, 1s1i:3, 628-631, 1s72:0, 626-629, 1vq4:0, 626-629, 1vq5:0, 626-629, 1vq6:0, 626-629, 1vq7:0, 626-629, 1vq8:0, 626-629, 1vq9:0, 626-629, 1vqk:0, 626-629, 1vql:0, 626-629, 1vqm:0, 626-629, 1vqn:0, 626-629, 1vqo:0, 626-629, 1vqp:0, 626-629, 1w2b:0, 626-629, 1yhq:0, 626-629, 1yi2:0, 626-629, 1yij:0, 626-629, 1yit:0, 626-629, 1yj9:0, 626-629, 1yjn:0, 626-629, 1yjw:0, 626-629, 2otj:0, 626-629, 2otl:0, 626-629, 2qa4:0, 625-628, 2qex:0, 626-629, 3cc2:0, 626-629, 3cc4:0, 626-629, 3cc7:0, 626-629, 3cce:0, 626-629, 3ccj:0, 626-629, 3ccl:0, 626-629, 3ccm:0, 626-629, 3ccq:0, 626-629, 3ccr:0, 626-629, 3ccs:0, 626-629, 3ccu:0, 626-629, 3ccv:0, 626-629, 3cd6:0, 626-629, 3cma:0, 626-629, 3cme:0, 626-629, 3cpw:0, 626-629
AU
1nkw:0, 976-979, 1nwx:0, 976-979, 1nwy:0, 976-979, 1ond:0, 976-979, 1sm1:0, 976-979, 1syz:A, 17-20, 1xbp:0, 976-979, 1yl3:A, 1055-1058, 2aar:0, 976-979, 2d3o:0, 976-979, 2j01:A, 1033-1036, 2j03:A, 1033-1036, 2jl6:A, 1060-1063, 2jl8:A, 1060-1063, 2o43:A, 976-979, 2o45:A, 973-976, 2ogm:0, 976-979, 2ogn:0, 976-979, 2ogo:0, 975-978, 3d5b:A, 1051-1054, 3d5d:A, 1051-1054
CA
1jj2:0, 2764-2767, 1k73:A, 2764-2767, 1kc8:A, 2764-2767, 1kqs:0, 2764-2767, 1m1k:A, 2764-2767, 1m90:A, 2764-2767, 1n8r:A, 2764-2767, 1nji:A, 2764-2767, 1nwx:0, 2492-2495, 1q7y:A, 2764-2767, 1q81:A, 2764-2767, 1q82:A, 2764-2767, 1q86:A, 2764-2767, 1qvg:0, 2764-2767, 1s72:0, 2764-2767, 1vq4:0, 2764-2767, 1vq5:0, 2764-2767, 1vq6:0, 2764-2767, 1vq7:0, 2764-2767, 1vqk:0, 2764-2767, 1vqm:0, 2764-2767, 1vqo:0, 2764-2767, 1w2b:0, 2764-2767, 1yhq:0, 2764-2767, 1yi2:0, 2764-2767, 1yj9:0, 2764-2767, 1yjn:0, 2764-2767, 1yjw:0, 2764-2767, 2otj:0, 2764-2767, 2qa4:0, 2769-2772, 3cc2:0, 2764-2767, 3cc7:0, 2764-2767, 3ccj:0, 2764-2767, 3ccq:0, 2764-2767, 3ccr:0, 2764-2767, 3ccs:0, 2764-2767, 3ccv:0, 2764-2767, 3cd6:0, 2764-2767, 3cma:0, 2764-2767, 3cme:0, 2764-2767, 3cpw:0, 2764-2767
GA
1e7k:C, 15-18, 1ffk:0, 1804-1807, 1jj2:0, 1854-1857, 1k73:A, 1854-1857, 1k8a:A, 1854-1857, 1k9m:A, 1854-1857, 1kc8:A, 1854-1857, 1kd1:A, 1854-1857, 1kqs:0, 1854-1857, 1m1k:A, 1854-1857, 1m90:A, 1854-1857, 1n8r:A, 1854-1857, 1nji:A, 1854-1857, 1q7y:A, 1854-1857, 1q81:A, 1854-1857, 1q82:A, 1854-1857, 1q86:A, 1854-1857, 1qvf:0, 1854-1857, 1qvg:0, 1854-1857, 1s1i:3, 1962-1965, 1s72:0, 1854-1857, 1vq4:0, 1854-1857, 1vq5:0, 1854-1857, 1vq6:0, 1854-1857, 1vq7:0, 1854-1857, 1vq8:0, 1854-1857, 1vq9:0, 1854-1857, 1vqk:0, 1854-1857, 1vql:0, 1854-1857, 1vqm:0, 1854-1857, 1vqn:0, 1854-1857, 1vqo:0, 1854-1857, 1vqp:0, 1854-1857, 1w2b:0, 1854-1857, 1yhq:0, 1854-1857, 1yi2:0, 1854-1857, 1yij:0, 1854-1857, 1yit:0, 1854-1857, 1yj9:0, 1854-1857, 1yjn:0, 1854-1857, 1yjw:0, 1854-1857, 2otj:0, 1854-1857, 2otl:0, 1854-1857, 2qex:0, 1854-1857, 2zjq:X, 1731-1734, 2zjr:X, 1728-1731, 3cc2:0, 1854-1857, 3cc4:0, 1854-1857, 3cc7:0, 1854-1857, 3cce:0, 1854-1857, 3ccl:0, 1854-1857, 3ccm:0, 1854-1857, 3ccq:0, 1854-1857, 3ccr:0, 1854-1857, 3ccs:0, 1854-1857, 3ccu:0, 1854-1857, 3ccv:0, 1854-1857, 3cd6:0, 1854-1857, 3cf5:X, 1731-1734, 3cma:0, 1854-1857, 3cme:0, 1854-1857, 3cpw:0, 1854-1857, 3dll:X, 1731-1734
GC
2ogn:0, 1429-1432
GG
1ffk:0, 2084-2087, 1ffz:A, 110-113, 1fg0:A, 110-113, 1jj2:0, 2134-2137, 1k73:A, 2134-2137, 1k8a:A, 2134-2137, 1k9m:A, 2134-2137, 1kc8:A, 2134-2137, 1kd1:A, 2134-2137, 1kqs:0, 2134-2137, 1m1k:A, 2134-2137, 1m90:A, 2134-2137, 1n8r:A, 2134-2137, 1nji:A, 2134-2137, 1q7y:A, 2134-2137, 1q81:A, 2134-2137, 1q82:A, 2134-2137, 1q86:A, 2134-2137, 1qvf:0, 2134-2137, 1qvg:0, 2134-2137, 1s1i:3, 2434-2437, 1s72:0, 2134-2137, 1sm1:0, 2128-2131, 1vq4:0, 2134-2137, 1vq5:0, 2134-2137, 1vq6:0, 2134-2137, 1vq7:0, 2134-2137, 1vq8:0, 2134-2137, 1vq9:0, 2134-2137, 1vqk:0, 2134-2137, 1vql:0, 2134-2137, 1vqm:0, 2134-2137, 1vqn:0, 2134-2137, 1vqo:0, 2134-2137, 1vqp:0, 2134-2137, 1vs6:B, 2183-2186, 1w2b:0, 2134-2137, 1y69:0, 2128-2131, 1yhq:0, 2134-2137, 1yi2:0, 2134-2137, 1yij:0, 2134-2137, 1yit:0, 2134-2137, 1yj9:0, 2134-2137, 1yjn:0, 2134-2137, 1yjw:0, 2134-2137, 1yl3:A, 2212-2215, 1z58:2, 2107-2110, 2aw4:B, 2183-2186, 2b66:A, 2154-2157, 2b9n:A, 2154-2157, 2b9p:A, 2154-2157, 2hgu:A, 2226-2229, 2i2t:B, 2183-2186, 2i2v:B, 2183-2186, 2j01:A, 2114-2117, 2j03:A, 2114-2117, 2jl6:A, 2193-2196, 2jl6:A, 363-366, 2jl8:A, 2193-2196, 2jl8:A, 363-366, 2o44:A, 2128-2131, 2ogo:0, 2127-2130, 2otj:0, 2134-2137, 2otl:0, 2134-2137, 2qa4:0, 2139-2142, 2qam:B, 2183-2186, 2qao:B, 2183-2186, 2qba:B, 2183-2186, 2qbc:B, 2183-2186, 2qbe:B, 2183-2186, 2qbg:B, 2183-2186, 2qbi:B, 2183-2186, 2qbk:B, 2183-2186, 2qex:0, 2134-2137, 2qov:B, 2183-2186, 2qox:B, 2183-2186, 2qoz:B, 2183-2186, 2qp1:B, 2183-2186, 2v47:A, 2109-2112, 2v47:A, 363-366, 2v49:A, 2109-2112, 2v49:A, 363-366, 2vhm:B, 2183-2186, 2vhn:B, 2183-2186, 2z4l:B, 2183-2186, 2z4n:B, 2183-2186, 2zjp:X, 2039-2042, 2zjq:X, 2039-2042, 2zjr:X, 2036-2039, 3bbx:B, 2457-2460, 3cc2:0, 2134-2137, 3cc4:0, 2134-2137, 3cc7:0, 2134-2137, 3cce:0, 2134-2137, 3ccj:0, 2134-2137, 3ccl:0, 2134-2137, 3ccm:0, 2134-2137, 3ccq:0, 2134-2137, 3ccr:0, 2134-2137, 3ccs:0, 2134-2137, 3ccu:0, 2134-2137, 3ccv:0, 2134-2137, 3cd6:0, 2134-2137, 3cma:0, 2134-2137, 3cme:0, 2134-2137, 3cpw:0, 2134-2137, 3d5b:A, 2221-2224, 3d5b:A, 370-373, 3d5d:A, 2221-2224, 3d5d:A, 370-373, 3df2:B, 2183-2186, 3df4:B, 2183-2186
UA
1sm1:0, 2292-2295, 1vq8:0, 2510-2513, 1vq9:0, 2510-2513, 1vql:0, 2510-2513, 1vqm:0, 2510-2513, 1vqn:0, 2510-2513, 1vsa:w, 2602-2605, 2gya:0, 2715-2718, 2gyc:0, 2715-2718, 2hgu:A, 2602-2605, 3cma:0, 2510-2513, 3cme:0, 2510-2513
UC
1nkw:0, 938-941, 1nwx:0, 938-941, 1nwy:0, 938-941, 1ond:0, 938-941, 1vow:B, 954-957, 1vp0:B, 954-957
UU
1ffk:0, 2027-2030, 1ffz:A, 53-56, 1fg0:A, 53-56, 1jj2:0, 2077-2080, 1k73:A, 2077-2080, 1k8a:A, 2077-2080, 1k9m:A, 2077-2080, 1kc8:A, 2077-2080, 1kd1:A, 2077-2080, 1kqs:0, 2077-2080, 1m1k:A, 2077-2080, 1m90:A, 2077-2080, 1n8r:A, 2077-2080, 1nji:A, 2077-2080, 1njm:0, 1991-1994, 1njn:0, 1991-1994, 1njo:0, 1991-1994, 1njp:0, 1991-1994, 1nkw:0, 1991-1994, 1ond:0, 1990-1993, 1p9x:0, 1966-1969, 1pnu:0, 2016-2019, 1pny:0, 2016-2019, 1q7y:A, 2077-2080, 1q81:A, 2077-2080, 1q82:A, 2077-2080, 1q86:A, 2077-2080, 1qvf:0, 2077-2080, 1qvg:0, 2077-2080, 1s1i:3, 2263-2266, 1s72:0, 2077-2080, 1sm1:0, 1991-1994, 1vor:B, 2016-2019, 1vou:B, 2016-2019, 1vow:B, 2016-2019, 1voy:B, 2016-2019, 1vp0:B, 2016-2019, 1vq4:0, 2077-2080, 1vq5:0, 2077-2080, 1vq6:0, 2077-2080, 1vq7:0, 2077-2080, 1vq8:0, 2077-2080, 1vq9:0, 2077-2080, 1vqk:0, 2077-2080, 1vql:0, 2077-2080, 1vqm:0, 2077-2080, 1vqn:0, 2077-2080, 1vqo:0, 2077-2080, 1vqp:0, 2077-2080, 1vs8:B, 2058-2061, 1vsa:w, 2074-2077, 1vsp:w, 2074-2077, 1w2b:0, 2077-2080, 1xbp:0, 1991-1994, 1yhq:0, 2077-2080, 1yi2:0, 2077-2080, 1yij:0, 2077-2080, 1yit:0, 2077-2080, 1yj9:0, 2077-2080, 1yjn:0, 2077-2080, 1yjw:0, 2077-2080, 2aar:0, 1991-1994, 2d3o:0, 1991-1994, 2i2t:B, 2058-2061, 2i2v:B, 2058-2061, 2j01:A, 1991-1994, 2j03:A, 1991-1994, 2jl6:A, 2070-2073, 2jl8:A, 2070-2073, 2o43:A, 1991-1994, 2o44:A, 1991-1994, 2o45:A, 1988-1991, 2ogo:0, 1990-1993, 2otj:0, 2077-2080, 2otl:0, 2077-2080, 2qa4:0, 2082-2085, 2qam:B, 2058-2061, 2qao:B, 2058-2061, 2qba:B, 2058-2061, 2qbc:B, 2058-2061, 2qbe:B, 2058-2061, 2qbg:B, 2058-2061, 2qbi:B, 2058-2061, 2qbk:B, 2058-2061, 2qex:0, 2077-2080, 2qou:A, 432-435, 2qov:B, 2058-2061, 2qox:B, 2058-2061, 2qoz:B, 2058-2061, 2qp1:B, 2058-2061, 2v47:A, 1991-1994, 2v49:A, 1991-1994, 2vhn:B, 2058-2061, 2z4l:B, 2058-2061, 2z4n:B, 2058-2061, 2zjp:X, 1952-1955, 2zjq:X, 1952-1955, 2zjr:X, 1949-1952, 3cc2:0, 2077-2080, 3cc4:0, 2077-2080, 3cc7:0, 2077-2080, 3cce:0, 2077-2080, 3ccj:0, 2077-2080, 3ccl:0, 2077-2080, 3ccm:0, 2077-2080, 3ccq:0, 2077-2080, 3ccr:0, 2077-2080, 3ccs:0, 2077-2080, 3ccu:0, 2077-2080, 3ccv:0, 2077-2080, 3cd6:0, 2077-2080, 3cf5:X, 1952-1955, 3cma:0, 2077-2080, 3cme:0, 2077-2080, 3cpw:0, 2077-2080, 3d5b:A, 2069-2072, 3d5d:A, 2069-2072, 3df2:B, 2058-2061, 3df4:B, 2058-2061