Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 848 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 275 structure(s)
Representative structure 1k9m:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1fjg:A, 54-57, 1hnw:A, 54-57, 1hnx:A, 54-57, 1hnz:A, 54-57, 1hr0:A, 54-57, 1i94:A, 57-60, 1i95:A, 57-60, 1i96:A, 57-60, 1ibk:A, 54-57, 1ibl:A, 54-57, 1ibm:A, 54-57, 1j5e:A, 54-57, 1n32:A, 54-57, 1n33:A, 54-57, 1n34:A, 54-57, 1pns:A, 54-57, 1pnx:A, 54-57, 1s1h:A, 54-57, 1voq:A, 54-57, 1vos:A, 54-57, 1vov:A, 54-57, 1vox:A, 54-57, 1voz:A, 54-57, 1vs5:A, 54-57, 1vs7:A, 54-57, 1xmo:A, 54-57, 1xmq:A, 54-57, 1xnq:A, 54-57, 1xnr:A, 54-57, 1yl4:A, 54-57, 2avy:A, 54-57, 2aw7:A, 54-57, 2b64:A, 54-57, 2b9m:A, 54-57, 2b9o:A, 54-57, 2e5l:A, 55-58, 2f4v:A, 54-57, 2gy9:A, 54-57, 2gyb:A, 54-57, 2hgi:A, 54-57, 2hgp:A, 54-57, 2hgr:A, 54-57, 2hhh:A, 54-57, 2i2p:A, 54-57, 2i2u:A, 54-57, 2ow8:y, 54-57, 2qal:A, 54-57, 2qan:A, 54-57, 2qb9:A, 54-57, 2qbb:A, 54-57, 2qbd:A, 54-57, 2qbf:A, 54-57, 2qbh:A, 54-57, 2qbj:A, 54-57, 2qnh:y, 54-57, 2qou:A, 54-57, 2qow:A, 54-57, 2qoy:A, 54-57, 2qp0:A, 54-57, 2uu9:A, 54-57, 2uua:A, 54-57, 2uub:A, 54-57, 2uuc:A, 54-57, 2uxb:A, 54-57, 2uxc:A, 54-57, 2uxd:A, 54-57, 2vqe:A, 54-57, 2vqf:A, 54-57, 2z4k:A, 54-57, 2z4m:A, 54-57, 3bbn:A, 54-57, 3d5a:A, 54-57, 3d5c:A, 54-57, 3df1:A, 54-57, 3df3:A, 54-57
CU
1ffk:0, 2043-2046, 1ffz:A, 69-72, 1fg0:A, 69-72, 1jj2:0, 2093-2096, 1k73:A, 2093-2096, 1k8a:A, 2093-2096, 1k9m:A, 2093-2096, 1kc8:A, 2093-2096, 1kd1:A, 2093-2096, 1kqs:0, 2093-2096, 1m1k:A, 2093-2096, 1m90:A, 2093-2096, 1n8r:A, 2093-2096, 1nji:A, 2093-2096, 1q7y:A, 2093-2096, 1q81:A, 2093-2096, 1q82:A, 2093-2096, 1q86:A, 2093-2096, 1qvf:0, 2093-2096, 1qvg:0, 2093-2096, 1s72:0, 2093-2096, 1vq6:0, 2093-2096, 1vq8:0, 2093-2096, 1vq9:0, 2093-2096, 1vqk:0, 2093-2096, 1vql:0, 2093-2096, 1vqm:0, 2093-2096, 1vqn:0, 2093-2096, 1vqo:0, 2093-2096, 1vqp:0, 2093-2096, 1w2b:0, 2093-2096, 1yhq:0, 2093-2096, 1yi2:0, 2093-2096, 1yij:0, 2093-2096, 1yit:0, 2093-2096, 1yj9:0, 2093-2096, 1yjn:0, 2093-2096, 1yjw:0, 2093-2096, 2otj:0, 2093-2096, 2otl:0, 2093-2096, 2qa4:0, 2098-2101, 2qex:0, 2093-2096, 3cc2:0, 2093-2096, 3cc4:0, 2093-2096, 3cc7:0, 2093-2096, 3cce:0, 2093-2096, 3ccj:0, 2093-2096, 3ccl:0, 2093-2096, 3ccm:0, 2093-2096, 3ccr:0, 2093-2096, 3ccu:0, 2093-2096, 3ccv:0, 2093-2096, 3cd6:0, 2093-2096, 3cma:0, 2093-2096, 3cme:0, 2093-2096, 3cpw:0, 2093-2096
GA
1ffk:0, 1583-1586, 1jj2:0, 1633-1636, 1k73:A, 1633-1636, 1k8a:A, 1633-1636, 1k9m:A, 1633-1636, 1kc8:A, 1633-1636, 1kd1:A, 1633-1636, 1kqs:0, 1633-1636, 1m1k:A, 1633-1636, 1m90:A, 1633-1636, 1n8r:A, 1633-1636, 1nji:A, 1633-1636, 1q7y:A, 1633-1636, 1q81:A, 1633-1636, 1q82:A, 1633-1636, 1q86:A, 1633-1636, 1qvf:0, 1633-1636, 1qvg:0, 1633-1636, 1s1i:3, 1741-1744, 1s72:0, 1633-1636, 1vq4:0, 1633-1636, 1vq5:0, 1633-1636, 1vq6:0, 1633-1636, 1vq7:0, 1633-1636, 1vq8:0, 1633-1636, 1vq9:0, 1633-1636, 1vqk:0, 1633-1636, 1vql:0, 1633-1636, 1vqm:0, 1633-1636, 1vqn:0, 1633-1636, 1vqo:0, 1633-1636, 1vqp:0, 1633-1636, 1w2b:0, 1633-1636, 1yhq:0, 1633-1636, 1yi2:0, 1633-1636, 1yij:0, 1633-1636, 1yit:0, 1633-1636, 1yj9:0, 1633-1636, 1yjn:0, 1633-1636, 1yjw:0, 1633-1636, 2otj:0, 1633-1636, 2otl:0, 1633-1636, 2qa4:0, 1638-1641, 2qex:0, 1633-1636, 3cc2:0, 1633-1636, 3cc4:0, 1633-1636, 3cc7:0, 1633-1636, 3cce:0, 1633-1636, 3ccj:0, 1633-1636, 3ccl:0, 1633-1636, 3ccm:0, 1633-1636, 3ccq:0, 1633-1636, 3ccr:0, 1633-1636, 3ccs:0, 1633-1636, 3ccu:0, 1633-1636, 3ccv:0, 1633-1636, 3cd6:0, 1633-1636, 3cma:0, 1633-1636, 3cme:0, 1633-1636, 3cpw:0, 1633-1636
GC
1j5a:A, 2181-2184, 1jzx:A, 2181-2184, 1jzy:A, 2181-2184, 1jzz:A, 2181-2184, 1k01:A, 2181-2184
GG
1yl4:A, 916-919, 2hgi:A, 916-919, 2hgp:A, 916-919
GU
1fjg:A, 1061-1064, 1hnw:A, 1061-1064, 1hnx:A, 1061-1064, 1hnz:A, 1061-1064, 1hr0:A, 1061-1064, 1i94:A, 1064-1067, 1i95:A, 1064-1067, 1i96:A, 1064-1067, 1ibk:A, 1061-1064, 1ibl:A, 1061-1064, 1ibm:A, 1061-1064, 1j5e:A, 1061-1064, 1n32:A, 1061-1064, 1n34:A, 1061-1064, 1pns:A, 1077-1080, 1pnx:A, 1077-1080, 1s1h:A, 1062-1065, 1vs5:A, 1079-1082, 1vs7:A, 1079-1082, 1xmo:A, 1056-1059, 1xmq:A, 1056-1059, 1xnq:A, 1056-1059, 1xnr:A, 1056-1059, 2avy:A, 1079-1082, 2aw7:A, 1079-1082, 2e5l:A, 1062-1065, 2gy9:A, 1043-1046, 2hgi:A, 1061-1064, 2hhh:A, 1061-1064, 2i2p:A, 1079-1082, 2i2u:A, 1079-1082, 2qal:A, 1079-1082, 2qan:A, 1079-1082, 2qb9:A, 1079-1082, 2qbb:A, 1079-1082, 2qbd:A, 1079-1082, 2qbf:A, 1079-1082, 2qbh:A, 1079-1082, 2qbj:A, 1079-1082, 2qou:A, 1079-1082, 2qow:A, 1079-1082, 2qoy:A, 1079-1082, 2qp0:A, 1079-1082, 2uu9:A, 1061-1064, 2uua:A, 1061-1064, 2uub:A, 1061-1064, 2uuc:A, 1061-1064, 2uxb:A, 1061-1064, 2uxc:A, 1061-1064, 2uxd:A, 1040-1043, 2vqe:A, 1061-1064, 2vqf:A, 1061-1064, 2z4k:A, 1079-1082, 2z4m:A, 1079-1082, 3d5a:A, 1061-1064, 3d5c:A, 1061-1064, 3df1:A, 1079-1082, 3df3:A, 1079-1082
UU
1njm:0, 2007-2010, 1njn:0, 2007-2010, 1njo:0, 2007-2010, 1njp:0, 2007-2010, 1nkw:0, 2007-2010, 1nwx:0, 2007-2010, 1nwy:0, 2007-2010, 1ond:0, 2006-2009, 1pnu:0, 2032-2035, 1pny:0, 2032-2035, 1sm1:0, 2007-2010, 1xbp:0, 2007-2010, 1y69:0, 2007-2010, 2hgj:A, 2090-2093, 2hgq:A, 2090-2093, 2hgu:A, 2090-2093, 2o45:A, 2004-2007, 2ogo:0, 2006-2009