Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 186 (cutoff=1.5 Å)
Cluster size 94 structure(s)
Representative structure 1fjg:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
2o45:A, 263-266, 2qbd:A, 66-69, 2qnh:y, 909-912, 2z4k:A, 66-69, 3eoh:A, 351-354
CU
2aar:0, 2074-2077, 2gya:0, 1973-1976, 2ogo:0, 2073-2076
GC
1sm1:0, 320-323, 1xbp:0, 320-323, 2gya:0, 2152-2155, 2gyc:0, 2152-2155
GG
1fjg:A, 916-919, 1hnw:A, 916-919, 1hnx:A, 916-919, 1hnz:A, 916-919, 1hr0:A, 916-919, 1i94:A, 919-922, 1i95:A, 919-922, 1i96:A, 919-922, 1ibk:A, 916-919, 1ibl:A, 916-919, 1ibm:A, 916-919, 1j5e:A, 916-919, 1n32:A, 916-919, 1pns:A, 936-939, 1pnx:A, 936-939, 1s1h:A, 924-927, 1vs5:A, 939-942, 1vs7:A, 939-942, 1xmo:A, 916-919, 1xmq:A, 916-919, 1xnq:A, 916-919, 1xnr:A, 916-919, 2avy:A, 939-942, 2aw7:A, 939-942, 2e5l:A, 917-920, 2gy9:A, 903-906, 2hgr:A, 916-919, 2hhh:A, 916-919, 2ow8:y, 916-919, 2qal:A, 939-942, 2qan:A, 939-942, 2qb9:A, 939-942, 2qbb:A, 939-942, 2qbd:A, 939-942, 2qbf:A, 939-942, 2qbh:A, 939-942, 2qbj:A, 939-942, 2qnh:y, 916-919, 2qou:A, 939-942, 2qow:A, 939-942, 2qoy:A, 939-942, 2qp0:A, 939-942, 2uu9:A, 916-919, 2uua:A, 916-919, 2uub:A, 916-919, 2uuc:A, 916-919, 2uxb:A, 916-919, 2uxc:A, 916-919, 2uxd:A, 894-897, 2vqe:A, 916-919, 2vqf:A, 916-919, 2z4k:A, 939-942, 2z4m:A, 939-942, 3bbn:A, 887-890, 3df1:A, 939-942, 3df3:A, 939-942
GU
1vor:B, 1142-1145, 1vou:B, 1142-1145, 1vow:B, 1142-1145, 1voy:B, 1142-1145, 1vp0:B, 1142-1145
UA
1efw:C, 7-10, 1fcw:A, 7-10, 1fcw:B, 7-10, 1fcw:C, 7-10, 1fcw:D, 7-10, 1fcw:E, 7-10, 1h4q:T, 4-7, 1h4s:T, 4-7, 1mj1:D, 7-10, 1tra:A, 7-10, 2dlc:Y, 7-10, 2hgi:D, 7-10, 2hgp:D, 7-10, 4tra:A, 7-10
UC
1exd:B, 6-9, 2o45:A, 1430-1433
UG
1yfg:A, 7-10, 2fmt:C, 7-10, 2fmt:D, 7-10, 2nr0:H, 4-7
UU
2qnh:y, 1102-1105