Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 8137 (cutoff=1.0 Å with sequence identity)
Cluster size 409 structure(s)
Representative structure 3d5b:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence UA
Cluster members
UA
1b23:R, 23-26, 1ffk:0, 1823-1826, 1ffk:0, 2464-2467, 1ffz:A, 490-493, 1fg0:A, 490-493, 1fjg:A, 277-280, 1fjg:A, 619-622, 1hnw:A, 277-280, 1hnw:A, 619-622, 1hnx:A, 277-280, 1hnx:A, 619-622, 1hnz:A, 277-280, 1hnz:A, 619-622, 1hr0:A, 277-280, 1hr0:A, 619-622, 1i6u:C, 24-27, 1i6u:D, 24-27, 1i94:A, 622-625, 1i95:A, 280-283, 1i95:A, 622-625, 1i96:A, 280-283, 1i96:A, 622-625, 1ibk:A, 277-280, 1ibk:A, 619-622, 1ibl:A, 277-280, 1ibl:A, 619-622, 1ibm:A, 277-280, 1ibm:A, 619-622, 1j5a:A, 1393-1396, 1j5a:A, 1965-1968, 1j5a:A, 2005-2008, 1j5e:A, 277-280, 1j5e:A, 619-622, 1jj2:0, 1873-1876, 1jj2:0, 2514-2517, 1jzx:A, 1393-1396, 1jzx:A, 1965-1968, 1jzx:A, 2005-2008, 1jzy:A, 1393-1396, 1jzy:A, 1965-1968, 1jzy:A, 2005-2008, 1jzz:A, 1393-1396, 1jzz:A, 1965-1968, 1jzz:A, 2005-2008, 1k01:A, 1393-1396, 1k01:A, 1965-1968, 1k01:A, 2005-2008, 1k73:A, 1873-1876, 1k73:A, 2514-2517, 1k8a:A, 1873-1876, 1k8a:A, 2514-2517, 1k9m:A, 1873-1876, 1k9m:A, 2514-2517, 1kc8:A, 1873-1876, 1kc8:A, 2514-2517, 1kd1:A, 1873-1876, 1kd1:A, 2514-2517, 1kqs:0, 1873-1876, 1kqs:0, 2514-2517, 1lng:B, 84-87, 1m1k:A, 1873-1876, 1m1k:A, 2514-2517, 1m90:A, 1873-1876, 1m90:A, 2514-2517, 1n32:A, 277-280, 1n32:A, 619-622, 1n33:A, 277-280, 1n33:A, 619-622, 1n34:A, 619-622, 1n36:A, 619-622, 1n8r:A, 1873-1876, 1n8r:A, 2514-2517, 1nji:A, 1873-1876, 1nji:A, 2514-2517, 1njm:0, 1385-1388, 1njm:0, 1957-1960, 1njn:0, 1380-1383, 1njn:0, 1385-1388, 1njn:0, 1957-1960, 1njo:0, 1385-1388, 1njo:0, 1957-1960, 1njp:0, 1385-1388, 1njp:0, 1957-1960, 1nkw:0, 1385-1388, 1nkw:0, 1957-1960, 1nkw:0, 1997-2000, 1nkw:0, 850-853, 1nwx:0, 1385-1388, 1nwx:0, 1957-1960, 1nwx:0, 1997-2000, 1nwx:0, 850-853, 1nwy:0, 1385-1388, 1nwy:0, 1957-1960, 1nwy:0, 1997-2000, 1nwy:0, 850-853, 1ond:0, 1385-1388, 1ond:0, 1956-1959, 1ond:0, 850-853, 1pns:A, 633-636, 1pns:A, 66-69, 1pnu:0, 1401-1404, 1pnu:0, 1982-1985, 1pnx:A, 633-636, 1pnx:A, 66-69, 1pny:0, 1401-1404, 1pny:0, 1982-1985, 1q7y:A, 1873-1876, 1q7y:A, 2514-2517, 1q81:A, 1873-1876, 1q81:A, 2514-2517, 1q82:A, 1873-1876, 1q82:A, 2514-2517, 1q86:A, 1873-1876, 1q86:A, 2514-2517, 1qvf:0, 1873-1876, 1qvf:0, 2514-2517, 1qvg:0, 1873-1876, 1qvg:0, 2514-2517, 1s1h:A, 282-285, 1s1h:A, 624-627, 1s1i:3, 1981-1984, 1s1i:3, 2831-2834, 1s72:0, 1873-1876, 1s72:0, 2514-2517, 1s9s:A, 5-8, 1sm1:0, 1165-1168, 1sm1:0, 1385-1388, 1sm1:0, 1957-1960, 1u6p:B, 5-8, 1voq:A, 633-636, 1vor:B, 1982-1985, 1vos:A, 633-636, 1vou:B, 1982-1985, 1vov:A, 633-636, 1vow:B, 1982-1985, 1vox:A, 633-636, 1voy:B, 1119-1122, 1voy:B, 1982-1985, 1voz:A, 633-636, 1vp0:B, 1982-1985, 1vq4:0, 1873-1876, 1vq4:0, 2514-2517, 1vq5:0, 1873-1876, 1vq5:0, 2514-2517, 1vq6:0, 1873-1876, 1vq6:0, 2514-2517, 1vq7:0, 1873-1876, 1vq7:0, 2514-2517, 1vq8:0, 1873-1876, 1vq8:0, 2514-2517, 1vq9:0, 1873-1876, 1vq9:0, 2514-2517, 1vqk:0, 1873-1876, 1vqk:0, 2514-2517, 1vql:0, 1873-1876, 1vql:0, 2514-2517, 1vqm:0, 1873-1876, 1vqm:0, 2514-2517, 1vqn:0, 1873-1876, 1vqn:0, 2514-2517, 1vqo:0, 1873-1876, 1vqo:0, 2514-2517, 1vqp:0, 1873-1876, 1vqp:0, 2514-2517, 1vs5:A, 282-285, 1vs5:A, 636-639, 1vs6:B, 1421-1424, 1vs6:B, 1848-1851, 1vs7:A, 282-285, 1vs7:A, 636-639, 1vs8:B, 1421-1424, 1vs8:B, 1848-1851, 1w2b:0, 1873-1876, 1w2b:0, 2514-2517, 1xbp:0, 1385-1388, 1xmo:A, 277-280, 1xmo:A, 619-622, 1xmq:A, 277-280, 1xmq:A, 619-622, 1xnq:A, 277-280, 1xnq:A, 619-622, 1xnr:A, 277-280, 1xnr:A, 619-622, 1y69:0, 1380-1383, 1y69:0, 1385-1388, 1yhq:0, 1873-1876, 1yhq:0, 2514-2517, 1yi2:0, 1873-1876, 1yi2:0, 2514-2517, 1yij:0, 1873-1876, 1yij:0, 2514-2517, 1yit:0, 1873-1876, 1yit:0, 2514-2517, 1yj9:0, 1873-1876, 1yj9:0, 2514-2517, 1yjn:0, 1873-1876, 1yjn:0, 2514-2517, 1yjw:0, 1873-1876, 1yjw:0, 2514-2517, 1z43:A, 86-89, 2aar:0, 1385-1388, 2avy:A, 282-285, 2avy:A, 636-639, 2aw4:B, 1421-1424, 2aw4:B, 1848-1851, 2aw7:A, 282-285, 2aw7:A, 636-639, 2awb:B, 1421-1424, 2awb:B, 1848-1851, 2b64:A, 972-975, 2b9m:A, 972-975, 2b9o:A, 972-975, 2d3o:0, 1997-2000, 2e5l:A, 278-281, 2e5l:A, 620-623, 2f4v:A, 277-280, 2gy9:A, 264-267, 2gy9:A, 606-609, 2gyb:A, 264-267, 2gyb:A, 606-609, 2hgi:A, 277-280, 2hgj:A, 1456-1459, 2hgq:A, 1456-1459, 2hgr:A, 619-622, 2hgu:A, 1456-1459, 2hgu:A, 1461-1464, 2hhh:A, 277-280, 2hhh:A, 619-622, 2i2p:A, 282-285, 2i2p:A, 636-639, 2i2t:B, 1421-1424, 2i2t:B, 1848-1851, 2i2u:A, 282-285, 2i2u:A, 636-639, 2i2v:B, 1421-1424, 2i2v:B, 1848-1851, 2j00:A, 277-280, 2j00:A, 619-622, 2j01:A, 1387-1390, 2j01:A, 1438-1441, 2j02:A, 277-280, 2j02:A, 619-622, 2j03:A, 1387-1390, 2j03:A, 1438-1441, 2j28:B, 1421-1424, 2j28:B, 1848-1851, 2jl5:A, 277-280, 2jl6:A, 1466-1469, 2jl7:A, 277-280, 2jl8:A, 1466-1469, 2jxv:A, 8-11, 2o43:A, 1380-1383, 2o43:A, 1385-1388, 2o43:A, 1997-2000, 2o43:A, 850-853, 2o44:A, 1165-1168, 2o45:A, 1162-1165, 2o45:A, 1382-1385, 2o45:A, 1994-1997, 2ogm:0, 1385-1388, 2ogm:0, 850-853, 2ogn:0, 1385-1388, 2ogo:0, 1379-1382, 2ogo:0, 1384-1387, 2ogo:0, 849-852, 2otj:0, 1873-1876, 2otj:0, 2514-2517, 2otl:0, 1873-1876, 2otl:0, 2514-2517, 2ow8:y, 277-280, 2qa4:0, 1878-1881, 2qa4:0, 2519-2522, 2qal:A, 282-285, 2qal:A, 636-639, 2qam:B, 1421-1424, 2qam:B, 1848-1851, 2qan:A, 282-285, 2qan:A, 636-639, 2qao:B, 1421-1424, 2qao:B, 1848-1851, 2qb9:A, 282-285, 2qb9:A, 636-639, 2qba:B, 1421-1424, 2qba:B, 1848-1851, 2qbb:A, 282-285, 2qbb:A, 636-639, 2qbc:B, 1421-1424, 2qbc:B, 1848-1851, 2qbd:A, 282-285, 2qbd:A, 636-639, 2qbe:B, 1421-1424, 2qbe:B, 1848-1851, 2qbf:A, 282-285, 2qbf:A, 636-639, 2qbg:B, 1421-1424, 2qbg:B, 1848-1851, 2qbh:A, 282-285, 2qbh:A, 636-639, 2qbi:B, 1421-1424, 2qbi:B, 1848-1851, 2qbj:A, 282-285, 2qbj:A, 636-639, 2qbk:B, 1421-1424, 2qbk:B, 1848-1851, 2qex:0, 1873-1876, 2qex:0, 2514-2517, 2qnh:y, 277-280, 2qou:A, 282-285, 2qou:A, 636-639, 2qov:B, 1421-1424, 2qov:B, 1848-1851, 2qow:A, 282-285, 2qow:A, 636-639, 2qox:B, 1421-1424, 2qox:B, 1848-1851, 2qoy:A, 282-285, 2qoy:A, 636-639, 2qoz:B, 1421-1424, 2qoz:B, 1848-1851, 2qp0:A, 282-285, 2qp0:A, 636-639, 2qp1:B, 1421-1424, 2qp1:B, 1848-1851, 2uu9:A, 277-280, 2uu9:A, 619-622, 2uua:A, 277-280, 2uua:A, 619-622, 2uub:A, 277-280, 2uub:A, 619-622, 2uuc:A, 277-280, 2uuc:A, 619-622, 2uxb:A, 277-280, 2uxb:A, 619-622, 2uxc:A, 277-280, 2uxc:A, 619-622, 2uxd:A, 261-264, 2uxd:A, 597-600, 2v3c:N, 82-85, 2vhm:B, 2024-2027, 2vhn:B, 2024-2027, 2vho:A, 282-285, 2vhp:A, 282-285, 2vqe:A, 277-280, 2vqe:A, 619-622, 2vqf:A, 277-280, 2vqf:A, 619-622, 2z4k:A, 282-285, 2z4k:A, 636-639, 2z4l:B, 1421-1424, 2z4l:B, 1848-1851, 2z4m:A, 282-285, 2z4m:A, 636-639, 2z4n:B, 1421-1424, 2z4n:B, 1848-1851, 2zjp:X, 1363-1366, 2zjq:X, 1363-1366, 2zjr:X, 1360-1363, 3bbn:A, 252-255, 3bbo:A, 1597-1600, 3bbx:B, 1502-1505, 3bbx:B, 1941-1944, 3cc2:0, 1873-1876, 3cc2:0, 2514-2517, 3cc4:0, 1873-1876, 3cc4:0, 2514-2517, 3cc7:0, 1873-1876, 3cc7:0, 2514-2517, 3cce:0, 1873-1876, 3cce:0, 2514-2517, 3ccj:0, 1873-1876, 3ccj:0, 2514-2517, 3ccl:0, 1873-1876, 3ccl:0, 2514-2517, 3ccm:0, 1873-1876, 3ccm:0, 2514-2517, 3ccq:0, 1873-1876, 3ccq:0, 2514-2517, 3ccr:0, 1873-1876, 3ccr:0, 2514-2517, 3ccs:0, 1873-1876, 3ccs:0, 2514-2517, 3ccu:0, 1873-1876, 3ccu:0, 2514-2517, 3ccv:0, 1873-1876, 3ccv:0, 2514-2517, 3cd6:0, 1873-1876, 3cd6:0, 2514-2517, 3cf5:X, 1363-1366, 3cma:0, 1873-1876, 3cma:0, 2514-2517, 3cme:0, 1873-1876, 3cme:0, 2514-2517, 3cpw:0, 1873-1876, 3cpw:0, 2514-2517, 3d5a:A, 277-280, 3d5b:A, 1457-1460, 3d5b:A, 377-380, 3d5c:A, 277-280, 3d5d:A, 1457-1460, 3d5d:A, 377-380, 3df1:A, 282-285, 3df1:A, 636-639, 3df2:B, 1421-1424, 3df2:B, 1848-1851, 3df3:A, 282-285, 3df3:A, 636-639, 3df4:B, 1421-1424, 3df4:B, 1848-1851, 3dll:X, 1363-1366