Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 8190 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 162 structure(s)
Representative structure 3d5c:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1njm:0, 263-266, 1njn:0, 263-266, 1njo:0, 263-266, 1njp:0, 263-266, 1pnu:0, 263-266, 1pny:0, 263-266, 1voq:A, 929-932, 1vos:A, 929-932, 1vov:A, 929-932, 1vox:A, 929-932, 1voz:A, 929-932, 1vs5:A, 932-935, 1vs7:A, 1030-1033, 1vs7:A, 932-935, 1xmq:A, 909-912, 1yl4:A, 909-912, 2avy:A, 932-935, 2aw7:A, 932-935, 2b64:A, 909-912, 2b9m:A, 909-912, 2b9o:A, 909-912, 2e5l:A, 910-913, 2f4v:A, 909-912, 2hgi:A, 909-912, 2hgp:A, 909-912, 2hgr:A, 909-912, 2hhh:A, 909-912, 2i2p:A, 932-935, 2i2u:A, 932-935, 2jl5:A, 909-912, 2jl7:A, 909-912, 2o43:A, 263-266, 2o45:A, 2068-2071, 2qal:A, 932-935, 2qan:A, 932-935, 2qbd:A, 932-935, 2qbf:A, 932-935, 2qou:A, 932-935, 2qow:A, 932-935, 2qoy:A, 932-935, 2qp0:A, 932-935, 2v46:A, 909-912, 2v48:A, 909-912, 2vhm:B, 1290-1293, 2vhm:B, 1623-1626, 2vhn:B, 1290-1293, 2vhn:B, 1623-1626, 2z4k:A, 932-935, 2z4m:A, 932-935, 3d5a:A, 909-912, 3d5c:A, 909-912, 3df1:A, 932-935, 3df3:A, 932-935, 3dll:X, 253-256
AC
1yl3:A, 2004-2007
AG
1pns:A, 21-24, 1voq:A, 21-24, 1vos:A, 21-24, 1vov:A, 21-24, 1vox:A, 21-24, 1voz:A, 21-24
AU
2gya:0, 2320-2323
CA
1yl3:A, 1664-1667, 2b66:A, 1664-1667, 2b9p:A, 1664-1667, 2hgu:A, 1664-1667
CC
2hgj:B, 32-35, 2v46:A, 783-786, 2v48:A, 783-786
CG
1ob5:B, 24-27, 1ob5:D, 24-27, 1ob5:F, 24-27, 1ttt:E, 24-27
GC
1vor:B, 798-801, 1vou:B, 798-801, 1vow:B, 798-801, 1voy:B, 798-801, 1vp0:B, 798-801, 2b9p:A, 2688-2691
GG
1fjg:A, 916-919, 1hnw:A, 916-919, 1hnx:A, 916-919, 1hnz:A, 916-919, 1hr0:A, 916-919, 1i94:A, 919-922, 1ibk:A, 916-919, 1ibl:A, 916-919, 1ibm:A, 916-919, 1j5e:A, 916-919, 1jzz:A, 2422-2425, 1n32:A, 916-919, 1pns:A, 936-939, 1pnx:A, 936-939, 1s1h:A, 924-927, 1vs5:A, 939-942, 1xmq:A, 916-919, 1xnq:A, 916-919, 1xnr:A, 916-919, 2avy:A, 939-942, 2gy9:A, 903-906, 2qal:A, 939-942, 2qan:A, 939-942, 2qb9:A, 939-942, 2qbb:A, 939-942, 2qbd:A, 939-942, 2qbf:A, 939-942, 2qou:A, 939-942, 2qoy:A, 939-942, 2qp0:A, 939-942, 2uu9:A, 916-919, 2uua:A, 916-919, 2uub:A, 916-919, 2uuc:A, 916-919, 2uxc:A, 916-919, 2uxd:A, 894-897, 2vqe:A, 916-919, 2vqf:A, 916-919, 2z4k:A, 939-942, 2z4m:A, 939-942, 3df1:A, 939-942, 3df3:A, 939-942
UA
3bbo:A, 278-281
UC
1vs6:B, 2457-2460, 1vs8:B, 2457-2460, 1vsa:w, 2500-2503, 1vsp:w, 2500-2503, 2aar:0, 2402-2405, 2aw4:B, 2457-2460, 2awb:B, 2457-2460, 2d3o:0, 2423-2426, 2hgj:A, 2500-2503, 2hgq:A, 2500-2503, 2hgu:A, 2500-2503, 2i2t:B, 2457-2460, 2i2v:B, 2457-2460, 2j01:A, 2388-2391, 2j03:A, 2388-2391, 2j28:B, 2457-2460, 2jl6:A, 2467-2470, 2jl8:A, 2467-2470, 2o44:A, 2402-2405, 2qam:B, 2457-2460, 2qao:B, 2457-2460, 2qba:B, 2457-2460, 2qbc:B, 2457-2460, 2qbe:B, 2457-2460, 2qbg:B, 2457-2460, 2qbi:B, 2457-2460, 2qbk:B, 2457-2460, 2qov:B, 2457-2460, 2qoz:B, 2457-2460, 2qp1:B, 2457-2460, 2v47:A, 2383-2386, 2v49:A, 2383-2386, 2z4l:B, 2457-2460, 2z4n:B, 2457-2460, 2zjq:X, 2313-2316, 3bbx:B, 2740-2743, 3d5b:A, 2495-2498, 3d5d:A, 2495-2498, 3df2:B, 2457-2460, 3df4:B, 2457-2460