Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 5580 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 105 structure(s)
Representative structure 2qa4:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1voq:A, 267-270, 1vos:A, 267-270, 1vov:A, 267-270, 1vox:A, 267-270, 1voz:A, 267-270, 1yl4:A, 263-266, 2gis:A, 44-47, 2vhm:B, 1416-1419, 2vhn:B, 1416-1419
AC
1u6p:B, 38-41
CA
1j5a:A, 1974-1977, 1jzx:A, 1974-1977, 1jzy:A, 1974-1977, 1jzz:A, 1974-1977, 1k01:A, 1974-1977, 1y69:9, 63-66, 3cf5:Z, 65-68
CC
1z31:A, 9-12, 2hgu:A, 251-254, 3bo3:B, 16-19, 3bo4:B, 16-19
CU
3bbo:B, 63-66
GC
1p9x:0, 1405-1408, 1y69:0, 1429-1432, 2o43:A, 1429-1432, 2ogo:0, 1428-1431
GG
1eor:A, 16-19, 1f9l:A, 16-19, 2i2v:B, 1098-1101
UA
1ffk:0, 2460-2463, 1ffz:A, 486-489, 1fg0:A, 486-489, 1jj2:0, 2510-2513, 1k73:A, 2510-2513, 1k8a:A, 2510-2513, 1k9m:A, 2510-2513, 1kc8:A, 2510-2513, 1kd1:A, 2510-2513, 1kqs:0, 2510-2513, 1m1k:A, 2510-2513, 1m90:A, 2510-2513, 1n8r:A, 2510-2513, 1nji:A, 2510-2513, 1p9x:0, 2267-2270, 1q7y:A, 2510-2513, 1q82:A, 2510-2513, 1q86:A, 2510-2513, 1qvf:0, 2510-2513, 1qvg:0, 2510-2513, 1s1i:3, 2827-2830, 1s72:0, 2510-2513, 1vq4:0, 2510-2513, 1vq5:0, 2510-2513, 1vq6:0, 2510-2513, 1vq7:0, 2510-2513, 1vs6:B, 2559-2562, 1vs8:B, 2559-2562, 1w2b:0, 2510-2513, 1y69:0, 2292-2295, 1yi2:0, 2510-2513, 1yij:0, 2510-2513, 1yj9:0, 2510-2513, 1yjn:0, 2510-2513, 1yjw:0, 2510-2513, 2aw4:B, 2559-2562, 2awb:B, 2559-2562, 2j28:B, 2559-2562, 2jl6:A, 380-383, 2o45:A, 2280-2283, 2ogm:0, 2292-2295, 2otj:0, 2510-2513, 2otl:0, 2510-2513, 2qa4:0, 2515-2518, 2qam:B, 2559-2562, 2qao:B, 2559-2562, 2qba:B, 2559-2562, 2qbc:B, 2559-2562, 2qbi:B, 2559-2562, 2qov:B, 2559-2562, 2qox:B, 2559-2562, 2qoz:B, 2559-2562, 2qp1:B, 2559-2562, 2vhm:B, 2559-2562, 2vhn:B, 2559-2562, 2z4l:B, 2559-2562, 2z4n:B, 2559-2562, 3bbx:B, 2842-2845, 3cc2:0, 2510-2513, 3cc4:0, 2510-2513, 3cc7:0, 2510-2513, 3cce:0, 2510-2513, 3ccj:0, 2510-2513, 3ccl:0, 2510-2513, 3ccq:0, 2510-2513, 3ccr:0, 2510-2513, 3ccs:0, 2510-2513, 3ccu:0, 2510-2513, 3cd6:0, 2510-2513, 3df2:B, 2559-2562, 3df4:B, 2559-2562
UC
2b66:A, 2318-2321, 2b9n:A, 2318-2321, 2b9p:A, 2318-2321, 2v47:A, 2748-2751, 2v49:A, 2748-2751