Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 2483 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 116 structure(s)
Representative structure 1voz:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence VN
Cluster members
AA
1u9s:A, 88-91
AG
1u9s:A, 61-64
AU
1hr2:A, 144-147, 1hr2:B, 145-148, 1kxk:A, 54-57, 1l8v:A, 144-147, 1l8v:B, 144-147, 1nbs:B, 73-76, 1x8w:A, 151-154, 1zzn:B, 77-80, 3eog:A, 330-333, 3eoh:A, 329-332
CA
1ffk:0, 1814-1817, 1k8a:A, 1864-1867, 1k9m:A, 1864-1867, 1kc8:A, 1864-1867, 1m1k:A, 1864-1867, 1n8r:A, 1864-1867, 1q7y:A, 1864-1867, 1q81:A, 1864-1867, 1q82:A, 1864-1867, 1qvf:0, 1864-1867, 1s1i:3, 1972-1975, 1vq9:0, 1864-1867, 1vqm:0, 1864-1867, 1w2b:0, 1864-1867, 1yjn:0, 1864-1867, 1yjw:0, 1864-1867, 2qa4:0, 1869-1872, 3cce:0, 1864-1867, 3ccj:0, 1864-1867, 3ccm:0, 1864-1867, 3ccr:0, 1864-1867, 3cma:0, 1864-1867, 3cpw:0, 1864-1867
CC
2d3o:0, 259-262
CG
1vs6:B, 1821-1824, 1vs8:B, 1821-1824, 1vsp:w, 1846-1849, 2aw4:B, 1821-1824, 2awb:B, 1821-1824, 2d3o:0, 1763-1766, 2j28:B, 1821-1824, 2qam:B, 1821-1824, 2qao:B, 1821-1824, 2qba:B, 1821-1824, 2qbc:B, 1821-1824, 2qbe:B, 1821-1824, 2qbg:B, 1821-1824, 2qbi:B, 1821-1824, 2qbk:B, 1821-1824, 2qov:B, 1821-1824, 2qox:B, 1821-1824, 2qoz:B, 1821-1824, 2qp1:B, 1821-1824, 2z4l:B, 1821-1824, 2z4n:B, 1821-1824, 2zjq:X, 1741-1744, 2zjr:X, 1738-1741, 3bbx:B, 1914-1917, 3cf5:X, 1741-1744, 3df2:B, 1821-1824, 3df4:B, 1821-1824, 3dll:X, 1741-1744
GA
1hnw:A, 378-381, 1hnx:A, 378-381, 1hnz:A, 378-381, 1i94:A, 381-384, 1i95:A, 381-384, 1i96:A, 381-384, 1ibk:A, 378-381, 1ibl:A, 378-381, 1ibm:A, 378-381, 1j5e:A, 378-381, 1n32:A, 378-381, 1pns:A, 382-385, 1s1h:A, 383-386, 1voq:A, 382-385, 1vos:A, 382-385, 1vov:A, 382-385, 1vox:A, 382-385, 1voz:A, 382-385, 1vs5:A, 383-386, 1vs7:A, 383-386, 1xmq:A, 378-381, 1xnq:A, 378-381, 2avy:A, 383-386, 2aw7:A, 383-386, 2hgp:A, 378-381, 2i2p:A, 383-386, 2i2u:A, 383-386, 2jl5:A, 378-381, 2jl7:A, 378-381, 2qal:A, 383-386, 2qan:A, 383-386, 2qb9:A, 383-386, 2qbb:A, 383-386, 2qbd:A, 383-386, 2qbf:A, 383-386, 2qbh:A, 383-386, 2qbj:A, 383-386, 2qnh:y, 378-381, 2qou:A, 383-386, 2qow:A, 383-386, 2qoy:A, 383-386, 2qp0:A, 383-386, 2uu9:A, 378-381, 2uua:A, 378-381, 2uxc:A, 378-381, 2v46:A, 378-381, 2v48:A, 378-381, 2vqf:A, 378-381, 2z4k:A, 383-386, 2z4m:A, 383-386, 3df1:A, 383-386, 3df3:A, 383-386