Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 6739 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 568 structure(s)
Representative structure 2uxc:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
1ffk:9, 50-53, 1gid:A, 103-106, 1jj2:9, 50-53, 1jur:A, 17-20, 1k73:B, 50-53, 1k8a:B, 50-53, 1k9m:B, 50-53, 1kc8:B, 50-53, 1kd1:B, 50-53, 1kqs:9, 50-53, 1m1k:B, 50-53, 1m90:B, 50-53, 1n8r:B, 50-53, 1nji:B, 50-53, 1njm:0, 1772-1775, 1njn:0, 1772-1775, 1njo:0, 1772-1775, 1njp:0, 1772-1775, 1nkw:0, 1772-1775, 1nwx:0, 1772-1775, 1nwy:0, 1772-1775, 1ond:0, 1771-1774, 1pnu:0, 1788-1791, 1pny:0, 1788-1791, 1q7y:B, 50-53, 1q81:B, 50-53, 1q82:B, 50-53, 1q86:B, 50-53, 1qvf:9, 50-53, 1qvg:9, 50-53, 1s03:A, 12-15, 1s03:B, 12-15, 1s1i:4, 50-53, 1s72:9, 50-53, 1sm1:0, 1772-1775, 1vq4:9, 50-53, 1vq5:9, 50-53, 1vq6:9, 50-53, 1vq7:9, 50-53, 1vq8:9, 50-53, 1vq9:9, 50-53, 1vqk:9, 50-53, 1vql:9, 50-53, 1vqm:9, 50-53, 1vqn:9, 50-53, 1vqo:9, 50-53, 1vqp:9, 50-53, 1vs6:A, 50-53, 1vs6:B, 1830-1833, 1vs8:A, 50-53, 1vs8:B, 1830-1833, 1w2b:9, 50-53, 1yhq:9, 50-53, 1yi2:9, 50-53, 1yij:9, 50-53, 1yit:9, 50-53, 1yj9:9, 50-53, 1yjn:9, 50-53, 1yjw:9, 50-53, 1yl3:A, 1855-1858, 1yl3:B, 53-56, 2aar:0, 1772-1775, 2aw4:B, 1830-1833, 2awb:A, 50-53, 2awb:B, 1830-1833, 2b66:A, 1855-1858, 2b66:B, 53-56, 2b9n:A, 1855-1858, 2b9n:B, 53-56, 2b9p:A, 1855-1858, 2b9p:B, 53-56, 2hgj:A, 1855-1858, 2hgq:A, 1855-1858, 2i2t:A, 50-53, 2i2v:A, 50-53, 2j01:B, 51-54, 2j03:B, 51-54, 2j28:A, 50-53, 2j28:B, 1830-1833, 2jl6:B, 51-54, 2jl8:B, 51-54, 2o45:A, 1769-1772, 2ogm:0, 1772-1775, 2ogn:0, 1772-1775, 2ogo:0, 1771-1774, 2otj:9, 50-53, 2otl:9, 50-53, 2qam:A, 50-53, 2qam:B, 1830-1833, 2qao:A, 50-53, 2qao:B, 1830-1833, 2qba:A, 50-53, 2qba:B, 1830-1833, 2qbc:A, 50-53, 2qbc:B, 1830-1833, 2qbe:A, 50-53, 2qbe:B, 1830-1833, 2qbg:A, 50-53, 2qbg:B, 1830-1833, 2qbi:A, 50-53, 2qbi:B, 1830-1833, 2qbk:A, 50-53, 2qbk:B, 1830-1833, 2qex:9, 50-53, 2qov:A, 50-53, 2qov:B, 1830-1833, 2qox:A, 50-53, 2qox:B, 1830-1833, 2qoz:A, 50-53, 2qoz:B, 1830-1833, 2qp1:A, 50-53, 2qp1:B, 1830-1833, 2v47:B, 51-54, 2v49:B, 51-54, 2vhm:B, 1830-1833, 2vhn:B, 1830-1833, 2z4l:A, 50-53, 2z4l:B, 1830-1833, 2z4n:A, 50-53, 2z4n:B, 1830-1833, 2zjp:X, 1750-1753, 2zjq:X, 1750-1753, 2zjr:X, 1747-1750, 3bbn:A, 583-586, 3bbo:A, 1778-1781, 3bbx:B, 1923-1926, 3cc2:9, 50-53, 3cc4:9, 50-53, 3cc7:9, 50-53, 3cce:9, 50-53, 3ccl:9, 50-53, 3ccm:9, 50-53, 3ccq:9, 50-53, 3ccu:9, 50-53, 3ccv:9, 50-53, 3cd6:9, 50-53, 3cf5:X, 1750-1753, 3cma:9, 50-53, 3cme:9, 50-53, 3cpw:9, 50-53, 3d5b:B, 51-54, 3d5d:B, 51-54, 3df2:B, 1830-1833, 3df4:B, 1830-1833, 3dll:X, 1403-1406, 3dll:X, 1750-1753
AC
2gya:0, 675-678, 2gyc:0, 675-678
CA
1jj2:0, 1864-1867, 1k73:A, 1864-1867, 1kd1:A, 1864-1867, 1kqs:0, 1864-1867, 1m90:A, 1864-1867, 1nji:A, 1864-1867, 1q86:A, 1864-1867, 1qvg:0, 1864-1867, 1s72:0, 1864-1867, 1vq4:0, 1864-1867, 1vq5:0, 1864-1867, 1vq6:0, 1864-1867, 1vq7:0, 1864-1867, 1vq8:0, 1864-1867, 1vqk:0, 1864-1867, 1vql:0, 1864-1867, 1vqn:0, 1864-1867, 1vqo:0, 1864-1867, 1vqp:0, 1864-1867, 1yhq:0, 1864-1867, 1yi2:0, 1864-1867, 1yij:0, 1864-1867, 1yit:0, 1864-1867, 1yj9:0, 1864-1867, 2otj:0, 1864-1867, 2otl:0, 1864-1867, 2qex:0, 1864-1867, 3cc2:0, 1864-1867, 3cc4:0, 1864-1867, 3cc7:0, 1864-1867, 3ccl:0, 1864-1867, 3ccq:0, 1864-1867, 3ccs:0, 1864-1867, 3ccu:0, 1864-1867, 3ccv:0, 1864-1867, 3cd6:0, 1864-1867, 3cme:0, 1864-1867
CG
1ffk:0, 2305-2308, 1fg0:A, 331-334, 1jj2:0, 2355-2358, 1k73:A, 2355-2358, 1k8a:A, 2355-2358, 1k9m:A, 2355-2358, 1kc8:A, 2355-2358, 1kd1:A, 2355-2358, 1kqs:0, 2355-2358, 1m1k:A, 2355-2358, 1m90:A, 2355-2358, 1n8r:A, 2355-2358, 1nji:A, 2355-2358, 1q7y:A, 2355-2358, 1q81:A, 2355-2358, 1q82:A, 2355-2358, 1q86:A, 2355-2358, 1qvf:0, 2355-2358, 1qvg:0, 2355-2358, 1s1i:3, 2672-2675, 1s72:0, 2355-2358, 1vq4:0, 2355-2358, 1vq5:0, 2355-2358, 1vq6:0, 2355-2358, 1vq7:0, 2355-2358, 1vq8:0, 2355-2358, 1vq9:0, 2355-2358, 1vqk:0, 2355-2358, 1vql:0, 2355-2358, 1vqm:0, 2355-2358, 1vqn:0, 2355-2358, 1vqo:0, 2355-2358, 1vqp:0, 2355-2358, 1yhq:0, 2355-2358, 1yi2:0, 2355-2358, 1yij:0, 2355-2358, 1yit:0, 2355-2358, 1yj9:0, 2355-2358, 1yjn:0, 2355-2358, 1yjw:0, 2355-2358, 2i2t:B, 1821-1824, 2i2v:B, 1821-1824, 2o43:A, 1763-1766, 2otj:0, 2355-2358, 2otl:0, 2355-2358, 2qa4:0, 2360-2363, 2qex:0, 2355-2358, 3cc2:0, 2355-2358, 3cc4:0, 2355-2358, 3cc7:0, 2355-2358, 3cce:0, 2355-2358, 3ccj:0, 2355-2358, 3ccl:0, 2355-2358, 3ccm:0, 2355-2358, 3ccq:0, 2355-2358, 3ccr:0, 2355-2358, 3ccs:0, 2355-2358, 3ccu:0, 2355-2358, 3ccv:0, 2355-2358, 3cd6:0, 2355-2358, 3cma:0, 2355-2358, 3cme:0, 2355-2358, 3cpw:0, 2355-2358
CU
1vs6:B, 32-35, 1vs8:B, 32-35, 2aw4:B, 32-35, 2awb:B, 32-35, 2i2t:B, 32-35, 2i2v:B, 32-35, 2j28:B, 32-35, 2qam:B, 32-35, 2qao:B, 32-35, 2qba:B, 32-35, 2qbc:B, 32-35, 2qbe:B, 32-35, 2qbg:B, 32-35, 2qbi:B, 32-35, 2qbk:B, 32-35, 2qov:B, 32-35, 2qox:B, 32-35, 3bbx:B, 32-35, 3df2:B, 32-35, 3df4:B, 32-35
GA
1hr0:A, 1454-1457, 1sm1:0, 2256-2259, 1vs6:B, 2311-2314, 1vs8:B, 2311-2314, 1vsa:w, 2447-2450, 1vsp:w, 2447-2450, 1yl3:A, 2340-2343, 2aw4:B, 2311-2314, 2awb:B, 2311-2314, 2b66:A, 2282-2285, 2b9n:A, 2282-2285, 2b9p:A, 2282-2285, 2d3o:0, 2277-2280, 2hgj:A, 2354-2357, 2hgq:A, 2354-2357, 2hgq:A, 2627-2630, 2hgu:A, 2354-2357, 2i2t:B, 2311-2314, 2i2t:B, 2404-2407, 2i2v:B, 2311-2314, 2i2v:B, 2404-2407, 2j01:A, 2242-2245, 2j01:A, 2335-2338, 2j01:A, 2747-2750, 2j03:A, 2242-2245, 2j03:A, 2335-2338, 2j03:A, 2747-2750, 2j28:B, 2311-2314, 2jl6:A, 2414-2417, 2jl6:A, 2826-2829, 2jl8:A, 2414-2417, 2jl8:A, 2826-2829, 2ogo:0, 2255-2258, 2om7:H, 3-6, 2qam:B, 2311-2314, 2qao:B, 2311-2314, 2qba:B, 2311-2314, 2qbc:B, 2311-2314, 2qbe:B, 2311-2314, 2qbg:B, 2311-2314, 2qbi:B, 2311-2314, 2qbk:B, 2311-2314, 2qov:B, 2311-2314, 2qov:B, 2404-2407, 2qox:B, 2311-2314, 2qoz:B, 2311-2314, 2qoz:B, 2404-2407, 2qp1:B, 2311-2314, 2qp1:B, 2404-2407, 2v47:A, 2742-2745, 2v49:A, 2742-2745, 2z4l:B, 2311-2314, 2z4n:B, 2311-2314, 2zjp:X, 2260-2263, 2zjq:X, 2260-2263, 3bbx:B, 2588-2591, 3cf5:X, 2260-2263, 3d5b:A, 2349-2352, 3d5b:A, 2442-2445, 3d5d:A, 2349-2352, 3d5d:A, 2442-2445, 3df2:B, 2311-2314, 3df4:B, 2311-2314, 3dll:X, 2260-2263
GC
1p9x:0, 2741-2744, 1z58:2, 2742-2745, 2o44:A, 2766-2769
GU
1vsa:w, 764-767, 1vsp:w, 764-767, 2jl6:A, 774-777, 2jl8:A, 774-777, 2v47:A, 747-750, 2v49:A, 747-750, 3d5b:A, 759-762, 3d5d:A, 759-762
UA
1bgz:A, 4-7, 1esy:A, 13-16, 1f6u:B, 13-16, 1ffk:0, 1823-1826, 1fjg:A, 619-622, 1hnw:A, 619-622, 1hnx:A, 619-622, 1hnz:A, 619-622, 1hr0:A, 619-622, 1i6u:C, 24-27, 1i6u:D, 24-27, 1i94:A, 622-625, 1i95:A, 622-625, 1i96:A, 622-625, 1ibk:A, 619-622, 1ibl:A, 619-622, 1ibm:A, 619-622, 1j5e:A, 619-622, 1jj2:0, 1873-1876, 1k73:A, 1873-1876, 1k8a:A, 1873-1876, 1k9m:A, 1873-1876, 1kc8:A, 1873-1876, 1kd1:A, 1873-1876, 1kqs:0, 1873-1876, 1m1k:A, 1873-1876, 1m90:A, 1873-1876, 1n32:A, 619-622, 1n33:A, 619-622, 1n34:A, 619-622, 1n36:A, 619-622, 1n8r:A, 1873-1876, 1nji:A, 1873-1876, 1njm:0, 876-879, 1njn:0, 876-879, 1njo:0, 876-879, 1njp:0, 876-879, 1nkw:0, 876-879, 1nwx:0, 876-879, 1nwy:0, 876-879, 1ond:0, 876-879, 1pns:A, 633-636, 1pns:A, 66-69, 1pnx:A, 633-636, 1pnx:A, 66-69, 1q7y:A, 1873-1876, 1q81:A, 1873-1876, 1q82:A, 1873-1876, 1q86:A, 1873-1876, 1qvf:0, 1873-1876, 1qvg:0, 1873-1876, 1s1h:A, 624-627, 1s1i:3, 1981-1984, 1s72:0, 1873-1876, 1voq:A, 633-636, 1vos:A, 633-636, 1vov:A, 633-636, 1vox:A, 633-636, 1voz:A, 633-636, 1vq4:0, 1873-1876, 1vq5:0, 1873-1876, 1vq6:0, 1873-1876, 1vq7:0, 1873-1876, 1vq8:0, 1873-1876, 1vq9:0, 1873-1876, 1vqk:0, 1873-1876, 1vql:0, 1873-1876, 1vqm:0, 1873-1876, 1vqn:0, 1873-1876, 1vqo:0, 1873-1876, 1vqp:0, 1873-1876, 1vs5:A, 636-639, 1vs7:A, 636-639, 1w2b:0, 1873-1876, 1xmo:A, 619-622, 1xmq:A, 619-622, 1xnq:A, 619-622, 1xnr:A, 619-622, 1yhq:0, 1873-1876, 1yi2:0, 1873-1876, 1yij:0, 1873-1876, 1yit:0, 1873-1876, 1yj9:0, 1873-1876, 1yjn:0, 1873-1876, 1yjw:0, 1873-1876, 1yl4:A, 619-622, 2avy:A, 636-639, 2aw7:A, 636-639, 2b64:A, 619-622, 2b9m:A, 619-622, 2b9o:A, 619-622, 2e5l:A, 620-623, 2gy9:A, 606-609, 2gyb:A, 606-609, 2hgi:A, 619-622, 2hgp:A, 619-622, 2hgr:A, 619-622, 2hhh:A, 619-622, 2i2p:A, 636-639, 2i2u:A, 636-639, 2j00:A, 619-622, 2j02:A, 619-622, 2jl5:A, 619-622, 2jl7:A, 619-622, 2o44:A, 1165-1168, 2otj:0, 1873-1876, 2otl:0, 1873-1876, 2ow8:y, 619-622, 2qal:A, 636-639, 2qan:A, 636-639, 2qb9:A, 636-639, 2qbb:A, 636-639, 2qbd:A, 636-639, 2qbf:A, 636-639, 2qbh:A, 636-639, 2qbj:A, 636-639, 2qex:0, 1873-1876, 2qnh:y, 619-622, 2qou:A, 636-639, 2qow:A, 636-639, 2qoy:A, 636-639, 2qp0:A, 636-639, 2uu9:A, 619-622, 2uua:A, 619-622, 2uub:A, 619-622, 2uuc:A, 619-622, 2uxb:A, 619-622, 2uxc:A, 619-622, 2uxd:A, 597-600, 2v46:A, 619-622, 2v48:A, 619-622, 2vho:A, 636-639, 2vqe:A, 619-622, 2vqf:A, 619-622, 2z4k:A, 636-639, 2z4m:A, 636-639, 3cc2:0, 1873-1876, 3cc4:0, 1873-1876, 3cc7:0, 1873-1876, 3cce:0, 1873-1876, 3ccj:0, 1873-1876, 3ccl:0, 1873-1876, 3ccm:0, 1873-1876, 3ccq:0, 1873-1876, 3ccr:0, 1873-1876, 3ccs:0, 1873-1876, 3ccu:0, 1873-1876, 3ccv:0, 1873-1876, 3cd6:0, 1873-1876, 3cma:0, 1873-1876, 3cme:0, 1873-1876, 3cpw:0, 1873-1876, 3df1:A, 636-639, 3df3:A, 636-639
UC
1nkw:9, 50-53, 1nwx:9, 50-53, 1nwy:9, 50-53, 1w2b:0, 20-23, 1xbp:9, 50-53, 2jl6:A, 27-30, 2jl8:A, 27-30, 2zjp:Z, 52-55, 2zjq:Y, 52-55, 2zjr:Y, 52-55, 3cf5:Z, 52-55
UU
1ffk:0, 820-823, 1jj2:0, 824-827, 1k73:A, 824-827, 1k8a:A, 824-827, 1k9m:A, 824-827, 1kc8:A, 824-827, 1kd1:A, 824-827, 1kqs:0, 824-827, 1m1k:A, 824-827, 1m90:A, 824-827, 1n8r:A, 824-827, 1nji:A, 824-827, 1q7y:A, 824-827, 1q81:A, 824-827, 1q82:A, 824-827, 1q86:A, 824-827, 1qvf:0, 824-827, 1qvg:0, 824-827, 1s1i:3, 823-826, 1s72:0, 824-827, 1vq4:0, 824-827, 1vq5:0, 824-827, 1vq6:0, 824-827, 1vq7:0, 824-827, 1vq8:0, 824-827, 1vq9:0, 824-827, 1vqk:0, 824-827, 1vql:0, 824-827, 1vqm:0, 824-827, 1vqn:0, 824-827, 1vqo:0, 824-827, 1vqp:0, 824-827, 1w2b:0, 824-827, 1yhq:0, 824-827, 1yi2:0, 824-827, 1yij:0, 824-827, 1yit:0, 824-827, 1yj9:0, 824-827, 1yjn:0, 824-827, 1yjw:0, 824-827, 2otj:0, 824-827, 2otl:0, 824-827, 2qa4:0, 823-826, 2qex:0, 824-827, 3cc2:0, 824-827, 3cc4:0, 824-827, 3cc7:0, 824-827, 3cce:0, 824-827, 3ccj:0, 824-827, 3ccl:0, 824-827, 3ccm:0, 824-827, 3ccq:0, 824-827, 3ccr:0, 824-827, 3ccs:0, 824-827, 3ccu:0, 824-827, 3ccv:0, 824-827, 3cd6:0, 824-827, 3cma:0, 824-827, 3cme:0, 824-827, 3cpw:0, 824-827