Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 6211 (cutoff=1.0 Å)
Cluster size 207 structure(s)
Representative structure 2qex:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
17ra:A, 5-8, 1eor:A, 4-7, 1f9l:A, 4-7, 1vs6:B, 1416-1419, 1vs8:B, 1416-1419, 2aw4:B, 1416-1419, 2awb:B, 1416-1419, 2i2t:B, 1416-1419, 2i2v:B, 1416-1419, 2j28:B, 1416-1419, 2qam:B, 1416-1419, 2qao:B, 1416-1419, 2qba:B, 1416-1419, 2qbc:B, 1416-1419, 2qbe:B, 1416-1419, 2qbg:B, 1416-1419, 2qbi:B, 1416-1419, 2qbk:B, 1416-1419, 2qou:A, 66-69, 2qov:B, 1416-1419, 2qox:B, 1416-1419, 2qoz:B, 1416-1419, 2qp1:B, 1416-1419, 2z4l:B, 1416-1419, 2z4n:B, 1416-1419, 3bbx:B, 1497-1500, 3df2:B, 1416-1419, 3df4:B, 1416-1419
AC
1j5a:A, 1029-1032, 1jzx:A, 1029-1032, 1jzy:A, 1029-1032, 1jzz:A, 1029-1032, 1k01:A, 1029-1032, 1kp7:A, 21-24, 1njm:0, 1021-1024, 1njn:0, 1021-1024, 1njo:0, 1021-1024, 1njp:0, 1021-1024, 1nkw:0, 1021-1024, 1nwx:0, 1021-1024, 1nwy:0, 1021-1024, 1ond:0, 1021-1024, 1p9x:0, 998-1001, 1sm1:0, 1021-1024, 2aar:0, 1021-1024, 2ogm:0, 1021-1024, 2ogn:0, 1021-1024, 2ogo:0, 1020-1023
AG
1j2b:C, 44-47, 1z58:2, 42-45
AU
3d5a:A, 618-621, 3d5c:A, 618-621
CA
1nkw:9, 63-66, 1nwx:9, 63-66, 1nwy:9, 63-66, 1pnu:9, 63-66, 1pny:9, 63-66, 1sm1:9, 63-66, 1xbp:9, 63-66
CC
2v48:W, 65-68
CG
1ffk:0, 30-33, 1jj2:0, 30-33, 1k73:A, 30-33, 1k8a:A, 30-33, 1k9m:A, 30-33, 1kc8:A, 30-33, 1kd1:A, 30-33, 1kqs:0, 30-33, 1m1k:A, 30-33, 1m90:A, 30-33, 1n8r:A, 30-33, 1nji:A, 30-33, 1q7y:A, 30-33, 1q81:A, 30-33, 1q82:A, 30-33, 1q86:A, 30-33, 1qvf:0, 30-33, 1qvg:0, 30-33, 1s1i:3, 30-33, 1s72:0, 30-33, 1vq4:0, 30-33, 1vq5:0, 30-33, 1vq6:0, 30-33, 1vq7:0, 30-33, 1vq8:0, 30-33, 1vq9:0, 30-33, 1vqk:0, 30-33, 1vql:0, 30-33, 1vqm:0, 30-33, 1vqn:0, 30-33, 1vqo:0, 30-33, 1vqp:0, 30-33, 1yhq:0, 30-33, 1yi2:0, 30-33, 1yij:0, 30-33, 1yit:0, 30-33, 1yj9:0, 30-33, 1yjn:0, 30-33, 1yjw:0, 30-33, 2otj:0, 30-33, 2otl:0, 30-33, 2qa4:0, 30-33, 2qex:0, 30-33, 3cc2:0, 30-33, 3cc4:0, 30-33, 3cc7:0, 30-33, 3cce:0, 30-33, 3ccj:0, 30-33, 3ccl:0, 30-33, 3ccm:0, 30-33, 3ccq:0, 30-33, 3ccr:0, 30-33, 3ccs:0, 30-33, 3ccu:0, 30-33, 3ccv:0, 30-33, 3cd6:0, 30-33, 3cma:0, 30-33, 3cme:0, 30-33, 3cpw:0, 30-33
GA
1tjz:A, 3-6, 2ow8:y, 1250-1253, 3bbo:A, 517-520
GG
1i97:A, 1462-1465
UA
1j5a:A, 1388-1391, 1jzx:A, 1388-1391, 1jzy:A, 1388-1391, 1jzz:A, 1388-1391, 1k01:A, 1388-1391, 1yl4:A, 277-280, 2b64:A, 277-280, 2b66:A, 1456-1459, 2b9m:A, 277-280, 2b9n:A, 1456-1459, 2b9n:A, 2040-2043, 2b9o:A, 277-280, 2b9p:A, 1456-1459, 2hgi:A, 277-280, 2hgp:A, 277-280, 2j00:A, 277-280, 2j02:A, 277-280
UC
3ccs:0, 2408-2411
UG
1i94:A, 35-38, 1i96:A, 35-38, 1n32:A, 32-35, 1n33:A, 32-35, 1n34:A, 32-35, 1voq:A, 32-35, 1vos:A, 32-35, 1vov:A, 32-35, 1vox:A, 32-35, 1voz:A, 32-35, 2b64:A, 32-35, 2b9m:A, 32-35, 2b9o:A, 32-35, 2f4v:A, 32-35, 2hgi:A, 32-35, 2hgp:A, 32-35, 2hgr:A, 32-35, 2uxd:A, 32-35, 2vhp:A, 32-35
UU
1jj2:0, 959-962, 1k73:A, 959-962, 1k8a:A, 959-962, 1k9m:A, 959-962, 1kc8:A, 959-962, 1kd1:A, 959-962, 1kqs:0, 959-962, 1m1k:A, 959-962, 1m90:A, 959-962, 1n8r:A, 959-962, 1nji:A, 959-962, 1njm:0, 1004-1007, 1njn:0, 1004-1007, 1njo:0, 1004-1007, 1njp:0, 1004-1007, 1p9x:0, 981-984, 1q7y:A, 959-962, 1q81:A, 959-962, 1q82:A, 959-962, 1q86:A, 959-962, 1qvf:0, 959-962, 1qvg:0, 959-962, 1s72:0, 959-962, 1sm1:0, 1004-1007, 1vq5:0, 959-962, 1vq6:0, 959-962, 1vq7:0, 959-962, 1vq8:0, 959-962, 1vq9:0, 959-962, 1vqk:0, 959-962, 1vql:0, 959-962, 1vqm:0, 959-962, 1vqn:0, 959-962, 1vqo:0, 959-962, 1vqp:0, 959-962, 1w2b:0, 959-962, 1yhq:0, 959-962, 1yi2:0, 959-962, 2otj:0, 959-962, 2qex:0, 959-962, 3cc2:0, 959-962, 3cc4:0, 959-962, 3cce:0, 959-962, 3ccs:0, 959-962, 3cma:0, 959-962, 3cme:0, 959-962, 3cpw:0, 959-962