Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(004)-Hairpin cluster 1258 (cutoff=0.5 Å with sequence identity)
Cluster size 494 structure(s)
Representative structure 1vql:0 (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence GAAA
Cluster members
GAAA
1dul:B, 24-29, 1ffk:0, 2224-2229, 1ffk:0, 681-686, 1ffk:0, 794-799, 1ffz:A, 250-255, 1fg0:A, 250-255, 1fjg:A, 1143-1148, 1fjg:A, 148-153, 1g1x:D, 9-14, 1gid:A, 47-52, 1gid:B, 47-52, 1grz:B, 54-59, 1hmh:A, 18-23, 1hmh:C, 18-23, 1hmh:E, 18-23, 1hnw:A, 1143-1148, 1hnw:A, 148-153, 1hnx:A, 1143-1148, 1hnx:A, 148-153, 1hnz:A, 1143-1148, 1hnz:A, 148-153, 1hq1:B, 24-29, 1hr0:A, 1143-1148, 1hr0:A, 148-153, 1hr2:A, 47-52, 1hr2:B, 48-53, 1i94:A, 1146-1151, 1i94:A, 989-994, 1i95:A, 1146-1151, 1i95:A, 989-994, 1i96:A, 1146-1151, 1i96:A, 989-994, 1i97:A, 989-994, 1ibk:A, 1143-1148, 1ibk:A, 148-153, 1ibl:A, 1143-1148, 1ibm:A, 1143-1148, 1j5a:A, 2274-2279, 1j5a:A, 595-600, 1j5e:A, 1143-1148, 1j5e:A, 148-153, 1jj2:0, 1295-1300, 1jj2:0, 2274-2279, 1jj2:0, 682-687, 1jj2:0, 798-803, 1jzx:A, 2274-2279, 1jzx:A, 595-600, 1jzy:A, 2274-2279, 1jzy:A, 595-600, 1jzz:A, 2274-2279, 1jzz:A, 595-600, 1k01:A, 2274-2279, 1k01:A, 595-600, 1k73:A, 1295-1300, 1k73:A, 2274-2279, 1k73:A, 682-687, 1k73:A, 798-803, 1k8a:A, 1295-1300, 1k8a:A, 2274-2279, 1k8a:A, 682-687, 1k8a:A, 798-803, 1k9m:A, 1295-1300, 1k9m:A, 2274-2279, 1k9m:A, 682-687, 1k9m:A, 798-803, 1kc8:A, 1295-1300, 1kc8:A, 2274-2279, 1kc8:A, 682-687, 1kc8:A, 798-803, 1kd1:A, 1295-1300, 1kd1:A, 2274-2279, 1kd1:A, 682-687, 1kd1:A, 798-803, 1kh6:A, 26-31, 1kqs:0, 1295-1300, 1kqs:0, 2274-2279, 1kqs:0, 682-687, 1kqs:0, 798-803, 1kxk:A, 33-38, 1l8v:A, 47-52, 1l8v:B, 47-52, 1m1k:A, 1295-1300, 1m1k:A, 2274-2279, 1m1k:A, 682-687, 1m1k:A, 798-803, 1m90:A, 1295-1300, 1m90:A, 2274-2279, 1m90:A, 682-687, 1m90:A, 798-803, 1mfq:A, 86-91, 1n32:A, 1143-1148, 1n32:A, 148-153, 1n32:A, 986-991, 1n33:A, 1143-1148, 1n66:A, 9-14, 1n8r:A, 1295-1300, 1n8r:A, 2274-2279, 1n8r:A, 682-687, 1n8r:A, 798-803, 1nbs:B, 118-123, 1nji:A, 1295-1300, 1nji:A, 2274-2279, 1nji:A, 682-687, 1nji:A, 798-803, 1njm:0, 2266-2271, 1njn:0, 2266-2271, 1njo:0, 2266-2271, 1njp:0, 2266-2271, 1nkw:0, 590-595, 1nwx:0, 590-595, 1nwy:0, 590-595, 1ond:0, 590-595, 1p9x:0, 2241-2246, 1p9x:0, 567-572, 1pns:A, 1159-1164, 1pns:A, 153-158, 1pnu:0, 2310-2315, 1pnx:A, 1159-1164, 1pnx:A, 153-158, 1pny:0, 2310-2315, 1q7y:A, 1295-1300, 1q7y:A, 2274-2279, 1q7y:A, 682-687, 1q7y:A, 798-803, 1q81:A, 1295-1300, 1q81:A, 2274-2279, 1q81:A, 682-687, 1q81:A, 798-803, 1q82:A, 1295-1300, 1q82:A, 2274-2279, 1q82:A, 682-687, 1q82:A, 798-803, 1q86:A, 1295-1300, 1q86:A, 2274-2279, 1q86:A, 682-687, 1q86:A, 798-803, 1qvf:0, 1295-1300, 1qvf:0, 2274-2279, 1qvf:0, 682-687, 1qvf:0, 798-803, 1qvg:0, 1295-1300, 1qvg:0, 2274-2279, 1qvg:0, 682-687, 1qvg:0, 798-803, 1rlg:C, 9-14, 1rlg:D, 9-14, 1ry1:A, 86-91, 1s1h:A, 1144-1149, 1s1h:A, 147-152, 1s1i:3, 2591-2596, 1s1i:3, 684-689, 1s1i:3, 797-802, 1s72:0, 1295-1300, 1s72:0, 2274-2279, 1s72:0, 682-687, 1s72:0, 798-803, 1sm1:0, 2266-2271, 1u6b:B, 20-25, 1un6:F, 35-40, 1voq:A, 1006-1011, 1vos:A, 1006-1011, 1vov:A, 1006-1011, 1vox:A, 1006-1011, 1voz:A, 1006-1011, 1vq4:0, 1295-1300, 1vq4:0, 2274-2279, 1vq4:0, 682-687, 1vq4:0, 798-803, 1vq5:0, 1295-1300, 1vq5:0, 2274-2279, 1vq5:0, 682-687, 1vq5:0, 798-803, 1vq6:0, 1295-1300, 1vq6:0, 2274-2279, 1vq6:0, 682-687, 1vq6:0, 798-803, 1vq7:0, 1295-1300, 1vq7:0, 2274-2279, 1vq7:0, 682-687, 1vq7:0, 798-803, 1vq8:0, 1295-1300, 1vq8:0, 2274-2279, 1vq8:0, 682-687, 1vq8:0, 798-803, 1vq9:0, 1295-1300, 1vq9:0, 2274-2279, 1vq9:0, 682-687, 1vq9:0, 798-803, 1vqk:0, 1295-1300, 1vqk:0, 2274-2279, 1vqk:0, 682-687, 1vqk:0, 798-803, 1vql:0, 1295-1300, 1vql:0, 2274-2279, 1vql:0, 682-687, 1vql:0, 798-803, 1vqm:0, 1295-1300, 1vqm:0, 2274-2279, 1vqm:0, 682-687, 1vqm:0, 798-803, 1vqn:0, 1295-1300, 1vqn:0, 2274-2279, 1vqn:0, 682-687, 1vqn:0, 798-803, 1vqo:0, 1295-1300, 1vqo:0, 2274-2279, 1vqo:0, 682-687, 1vqo:0, 798-803, 1vqp:0, 1295-1300, 1vqp:0, 2274-2279, 1vqp:0, 682-687, 1vqp:0, 798-803, 1vs5:A, 154-159, 1vs6:B, 1790-1795, 1vs6:B, 2321-2326, 1vs6:B, 629-634, 1vs7:A, 154-159, 1vs8:B, 1790-1795, 1vs8:B, 2321-2326, 1vs8:B, 629-634, 1w2b:0, 1295-1300, 1w2b:0, 2274-2279, 1w2b:0, 682-687, 1w2b:0, 798-803, 1x8w:A, 54-59, 1x8w:C, 54-59, 1xmq:A, 1138-1143, 1xnq:A, 1138-1143, 1xnr:A, 1138-1143, 1xnr:A, 985-990, 1y69:0, 2266-2271, 1y69:0, 590-595, 1yhq:0, 2274-2279, 1yhq:0, 682-687, 1yhq:0, 798-803, 1yi2:0, 2274-2279, 1yi2:0, 682-687, 1yi2:0, 798-803, 1yij:0, 2274-2279, 1yij:0, 682-687, 1yij:0, 798-803, 1yit:0, 2274-2279, 1yit:0, 682-687, 1yit:0, 798-803, 1yj9:0, 2274-2279, 1yj9:0, 682-687, 1yj9:0, 798-803, 1yjn:0, 2274-2279, 1yjn:0, 682-687, 1yjn:0, 798-803, 1yjw:0, 2274-2279, 1yjw:0, 682-687, 1yjw:0, 798-803, 1yl3:A, 654-659, 1ysh:A, 13-18, 2aar:0, 590-595, 2avy:A, 154-159, 2aw4:B, 1790-1795, 2aw4:B, 2321-2326, 2aw4:B, 629-634, 2aw7:A, 154-159, 2awb:B, 1790-1795, 2awb:B, 2321-2326, 2awb:B, 629-634, 2b66:A, 654-659, 2b9n:A, 654-659, 2b9p:A, 654-659, 2e5l:A, 1144-1149, 2e5l:A, 149-154, 2f4v:A, 1143-1148, 2gis:A, 73-78, 2go5:A, 86-91, 2gy9:A, 147-152, 2gya:0, 1704-1709, 2gya:0, 567-572, 2gyb:A, 147-152, 2hgi:A, 1143-1148, 2hgr:A, 1143-1148, 2hhh:A, 1143-1148, 2hhh:A, 148-153, 2i2t:B, 2321-2326, 2i2t:B, 629-634, 2i2v:B, 2321-2326, 2i2v:B, 629-634, 2j01:A, 2252-2257, 2j01:A, 641-646, 2j03:A, 2252-2257, 2j03:A, 641-646, 2j28:8, 35-40, 2j28:B, 1790-1795, 2j28:B, 2321-2326, 2j28:B, 629-634, 2j37:A, 86-91, 2jl5:A, 1143-1148, 2jl6:A, 2331-2336, 2jl6:A, 643-648, 2jl7:A, 1143-1148, 2jl8:A, 2331-2336, 2jl8:A, 643-648, 2o44:A, 2266-2271, 2o44:A, 590-595, 2ogm:0, 2266-2271, 2ogm:0, 590-595, 2ogn:0, 590-595, 2ogo:0, 589-594, 2oiu:P, 28-33, 2oiu:P, 59-64, 2oiu:Q, 10-15, 2oiu:Q, 59-64, 2otj:0, 1295-1300, 2otj:0, 2274-2279, 2otj:0, 682-687, 2otj:0, 798-803, 2otl:0, 1295-1300, 2otl:0, 2274-2279, 2otl:0, 682-687, 2otl:0, 798-803, 2pxb:B, 24-29, 2pxd:B, 24-29, 2pxe:B, 24-29, 2pxf:B, 24-29, 2pxk:B, 24-29, 2pxl:B, 24-29, 2pxp:B, 24-29, 2pxq:B, 24-29, 2pxt:B, 24-29, 2pxu:B, 24-29, 2pxv:B, 24-29, 2qa4:0, 1300-1305, 2qa4:0, 2279-2284, 2qa4:0, 681-686, 2qa4:0, 797-802, 2qal:A, 154-159, 2qam:B, 1790-1795, 2qam:B, 2321-2326, 2qam:B, 629-634, 2qan:A, 154-159, 2qao:B, 1790-1795, 2qao:B, 2321-2326, 2qao:B, 629-634, 2qb9:A, 154-159, 2qba:B, 1790-1795, 2qba:B, 2321-2326, 2qba:B, 629-634, 2qbc:B, 1790-1795, 2qbc:B, 2321-2326, 2qbc:B, 629-634, 2qbd:A, 154-159, 2qbe:B, 1790-1795, 2qbe:B, 2321-2326, 2qbe:B, 629-634, 2qbf:A, 154-159, 2qbg:B, 1790-1795, 2qbg:B, 2321-2326, 2qbg:B, 629-634, 2qbh:A, 154-159, 2qbi:B, 1790-1795, 2qbi:B, 2321-2326, 2qbi:B, 629-634, 2qbj:A, 154-159, 2qbk:B, 1790-1795, 2qbk:B, 2321-2326, 2qbk:B, 629-634, 2qex:0, 1295-1300, 2qex:0, 2274-2279, 2qex:0, 682-687, 2qex:0, 798-803, 2qou:A, 154-159, 2qov:B, 2321-2326, 2qov:B, 629-634, 2qow:A, 154-159, 2qox:B, 2321-2326, 2qox:B, 629-634, 2qoy:A, 154-159, 2qoz:B, 1790-1795, 2qoz:B, 2321-2326, 2qoz:B, 629-634, 2qp0:A, 154-159, 2qp1:B, 1790-1795, 2qp1:B, 2321-2326, 2qp1:B, 629-634, 2r8s:R, 48-53, 2rkj:C, 193-198, 2rkj:G, 193-198, 2rkj:K, 193-198, 2rkj:O, 193-198, 2uu9:A, 1143-1148, 2uua:A, 1143-1148, 2uua:A, 148-153, 2uub:A, 1143-1148, 2uuc:A, 1143-1148, 2uxb:A, 148-153, 2uxc:A, 1143-1148, 2uxc:A, 148-153, 2v47:A, 641-646, 2v49:A, 641-646, 2vqe:A, 1143-1148, 2vqe:A, 148-153, 2vqf:A, 1143-1148, 2z4k:A, 154-159, 2z4l:B, 1790-1795, 2z4l:B, 2321-2326, 2z4l:B, 629-634, 2z4m:A, 154-159, 2z4n:B, 1790-1795, 2z4n:B, 2321-2326, 2z4n:B, 629-634, 2zjp:X, 2177-2182, 2zjp:X, 568-573, 2zjq:X, 2177-2182, 2zjq:X, 568-573, 2zjr:X, 2174-2179, 2zjr:X, 568-573, 3bbn:A, 345-350, 3bbx:B, 1880-1885, 3bbx:B, 2598-2603, 3bbx:B, 629-634, 3bo3:B, 20-25, 3bwp:A, 258-263, 3cc2:0, 2274-2279, 3cc2:0, 682-687, 3cc2:0, 798-803, 3cc4:0, 2274-2279, 3cc4:0, 682-687, 3cc4:0, 798-803, 3cc7:0, 2274-2279, 3cc7:0, 682-687, 3cc7:0, 798-803, 3cce:0, 2274-2279, 3cce:0, 682-687, 3cce:0, 798-803, 3ccj:0, 2274-2279, 3ccj:0, 682-687, 3ccl:0, 2274-2279, 3ccl:0, 682-687, 3ccl:0, 798-803, 3ccm:0, 2274-2279, 3ccm:0, 682-687, 3ccm:0, 798-803, 3ccq:0, 2274-2279, 3ccq:0, 682-687, 3ccq:0, 798-803, 3ccr:0, 2274-2279, 3ccr:0, 682-687, 3ccr:0, 798-803, 3ccs:0, 2274-2279, 3ccs:0, 682-687, 3ccs:0, 798-803, 3ccu:0, 2274-2279, 3ccu:0, 682-687, 3ccu:0, 798-803, 3ccv:0, 2274-2279, 3ccv:0, 682-687, 3ccv:0, 798-803, 3cd6:0, 2274-2279, 3cd6:0, 682-687, 3cd6:0, 798-803, 3cf5:X, 2177-2182, 3cf5:X, 568-573, 3cma:0, 2274-2279, 3cma:0, 682-687, 3cma:0, 798-803, 3cme:0, 2274-2279, 3cme:0, 682-687, 3cpw:0, 1295-1300, 3cpw:0, 2274-2279, 3cpw:0, 682-687, 3cpw:0, 798-803, 3cul:C, 7-12, 3cul:D, 7-12, 3cun:C, 7-12, 3cun:D, 7-12, 3d0u:A, 142-147, 3d5a:A, 1143-1148, 3d5b:A, 2359-2364, 3d5b:A, 650-655, 3d5c:A, 1143-1148, 3d5d:A, 2359-2364, 3d5d:A, 650-655, 3df1:A, 154-159, 3df2:B, 1790-1795, 3df2:B, 2321-2326, 3df3:A, 154-159, 3df4:B, 1790-1795, 3df4:B, 2321-2326, 3dll:X, 568-573, 3e5c:A, 18-23, 3e5c:A, 41-46, 3e5e:A, 18-23, 3e5e:A, 41-46, 3e5f:A, 18-23, 3e5f:A, 41-46, 3eog:A, 272-277, 3eoh:A, 273-278