Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 7015 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 69 structure(s)
Representative structure 2vqe:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence NN
Cluster members
AA
2gya:0, 1355-1358
AC
2eev:A, 58-61
AG
2o44:A, 1175-1178
AU
1nz1:A, 17-20, 1xhp:A, 21-24
CU
1u6p:B, 23-26
GA
1fjg:A, 1250-1253, 1hnw:A, 1250-1253, 1hnx:A, 1250-1253, 1hnz:A, 1250-1253, 1hr0:A, 1250-1253, 1i95:A, 1253-1256, 1i96:A, 1253-1256, 1ibk:A, 1250-1253, 1ibl:A, 1250-1253, 1j5e:A, 1250-1253, 1n32:A, 1250-1253, 1pns:A, 1266-1269, 1pnx:A, 1266-1269, 1s1h:A, 1251-1254, 1tjz:A, 3-6, 1xmo:A, 1245-1248, 1xmq:A, 1245-1248, 1xnq:A, 1245-1248, 1xnr:A, 1245-1248, 2b64:A, 1250-1253, 2b9m:A, 1250-1253, 2b9o:A, 1250-1253, 2e5l:A, 1251-1254, 2hhh:A, 1250-1253, 2i2t:B, 536-539, 2i2v:B, 536-539, 2qbi:B, 536-539, 2qnh:y, 1250-1253, 2qoz:B, 536-539, 2qp1:B, 536-539, 2uu9:A, 1250-1253, 2uua:A, 1250-1253, 2uub:A, 1250-1253, 2uuc:A, 1250-1253, 2uxc:A, 1250-1253, 2uxd:A, 1228-1231, 2vhn:B, 536-539, 2vqe:A, 1250-1253, 2vqf:A, 1250-1253, 3bbo:A, 517-520, 3d5a:A, 1250-1253, 3d5c:A, 1250-1253, 3df2:B, 536-539, 3df4:B, 536-539
GG
3bbn:A, 683-686
UA
1j5a:A, 1388-1391, 1jzx:A, 1388-1391, 1jzy:A, 1388-1391, 1jzz:A, 1388-1391, 1k01:A, 1388-1391, 1njn:0, 1380-1383, 1y69:0, 1380-1383, 2b66:A, 1456-1459, 2b9n:A, 1456-1459, 2b9p:A, 1456-1459, 2hgj:A, 1456-1459, 2hgq:A, 1456-1459, 2hgu:A, 1456-1459, 2o43:A, 1380-1383, 2ogo:0, 1379-1382
UC
1vov:A, 1418-1421, 1vox:A, 1418-1421, 1voz:A, 1418-1421