Please cite:
Schudoma et al.,
Nucl. Acids Res. 38: 970-980.
DOI 10.1093/nar/gkp1010.
(002)-Segment cluster 7042 (cutoff=0.5 Å)
Cluster size 194 structure(s)
Representative structure 2vqf:A (&rarr PDB)
Downloads Representative structure (PDB) (MC-Annotate)
Member list
Consensus sequence DA
Cluster members
AA
1gid:B, 103-106, 1l8v:A, 103-106, 1l8v:B, 103-106, 2zjr:X, 1400-1403, 3bwp:A, 74-77, 3cf5:X, 1403-1406, 3eog:A, 74-77, 3eoh:A, 74-77
GA
1fjg:A, 1394-1397, 1fjg:A, 1454-1457, 1hnw:A, 1394-1397, 1hnw:A, 1454-1457, 1hnx:A, 1394-1397, 1hnx:A, 1454-1457, 1i96:A, 1397-1400, 1i96:A, 1457-1460, 1ibk:A, 1394-1397, 1ibk:A, 1454-1457, 1ibl:A, 1394-1397, 1ibl:A, 1454-1457, 1ibm:A, 1394-1397, 1ibm:A, 1454-1457, 1j5e:A, 1394-1397, 1j5e:A, 1454-1457, 1njm:0, 2256-2259, 1njn:0, 2256-2259, 1njo:0, 2256-2259, 1njp:0, 2256-2259, 1nkw:0, 2256-2259, 1nwx:0, 2256-2259, 1nwy:0, 2256-2259, 1ond:0, 2255-2258, 1pnu:0, 2300-2303, 1pny:0, 2300-2303, 1sm1:0, 2256-2259, 1vs5:A, 1477-1480, 1vs6:B, 2311-2314, 1vs6:B, 536-539, 1vs7:A, 1477-1480, 1vs8:B, 2311-2314, 1vs8:B, 536-539, 1xmo:A, 1388-1391, 1xmo:A, 1448-1451, 1xmq:A, 1388-1391, 1xmq:A, 1448-1451, 1xnq:A, 1388-1391, 1xnq:A, 1448-1451, 1xnr:A, 1388-1391, 1xnr:A, 1448-1451, 1y69:0, 2256-2259, 2aar:0, 2256-2259, 2avy:A, 1477-1480, 2aw4:B, 2311-2314, 2aw4:B, 536-539, 2aw7:A, 1477-1480, 2awb:B, 2311-2314, 2awb:B, 536-539, 2d3o:0, 2277-2280, 2e5l:A, 1455-1458, 2gy9:A, 1375-1378, 2gy9:A, 1435-1438, 2i2p:A, 1477-1480, 2i2t:B, 2311-2314, 2i2u:A, 1477-1480, 2i2v:B, 2311-2314, 2j01:A, 2242-2245, 2j03:A, 2242-2245, 2j28:B, 2311-2314, 2j28:B, 536-539, 2jl5:A, 1454-1457, 2jl6:A, 2321-2324, 2jl8:A, 2321-2324, 2o45:A, 2244-2247, 2ogm:0, 2256-2259, 2ogn:0, 2256-2259, 2ogo:0, 2255-2258, 2qal:A, 1477-1480, 2qam:B, 2311-2314, 2qam:B, 536-539, 2qan:A, 1477-1480, 2qao:B, 2311-2314, 2qao:B, 536-539, 2qb9:A, 1477-1480, 2qba:B, 2311-2314, 2qba:B, 536-539, 2qbb:A, 1477-1480, 2qbc:B, 2311-2314, 2qbc:B, 536-539, 2qbe:B, 2311-2314, 2qbe:B, 536-539, 2qbf:A, 1477-1480, 2qbg:B, 2311-2314, 2qbg:B, 536-539, 2qbi:B, 2311-2314, 2qbj:A, 1477-1480, 2qbk:B, 2311-2314, 2qbk:B, 536-539, 2qou:A, 1477-1480, 2qov:B, 2311-2314, 2qov:B, 536-539, 2qow:A, 1477-1480, 2qox:B, 2311-2314, 2qox:B, 536-539, 2qoy:A, 1477-1480, 2qoz:B, 2311-2314, 2qp0:A, 1477-1480, 2qp1:B, 2311-2314, 2uu9:A, 1394-1397, 2uu9:A, 1454-1457, 2uub:A, 1394-1397, 2uub:A, 1454-1457, 2uuc:A, 1394-1397, 2uuc:A, 1454-1457, 2uxc:A, 1394-1397, 2uxc:A, 1454-1457, 2uxd:A, 1372-1375, 2uxd:A, 1425-1428, 2vqe:A, 1394-1397, 2vqe:A, 1454-1457, 2vqf:A, 1394-1397, 2vqf:A, 1454-1457, 2z4l:B, 2311-2314, 2z4l:B, 536-539, 2z4m:A, 1477-1480, 2z4n:B, 2311-2314, 2z4n:B, 536-539, 2zjq:X, 2167-2170, 2zjr:X, 2164-2167, 3bbn:A, 1425-1428, 3bbx:B, 2588-2591, 3bbx:B, 536-539, 3cf5:X, 2167-2170, 3d5a:A, 1454-1457, 3d5c:A, 1454-1457, 3df2:B, 2311-2314, 3df3:A, 1477-1480, 3df4:B, 2311-2314, 3dll:X, 2167-2170
UA
1ffk:0, 1823-1826, 1jj2:0, 1873-1876, 1k73:A, 1873-1876, 1k8a:A, 1873-1876, 1k9m:A, 1873-1876, 1kc8:A, 1873-1876, 1kd1:A, 1873-1876, 1kqs:0, 1873-1876, 1m1k:A, 1873-1876, 1m90:A, 1873-1876, 1n8r:A, 1873-1876, 1nji:A, 1873-1876, 1q7y:A, 1873-1876, 1q81:A, 1873-1876, 1q82:A, 1873-1876, 1q86:A, 1873-1876, 1qvf:0, 1873-1876, 1qvg:0, 1873-1876, 1s1i:3, 1981-1984, 1s72:0, 1873-1876, 1vq4:0, 1873-1876, 1vq5:0, 1873-1876, 1vq6:0, 1873-1876, 1vq7:0, 1873-1876, 1vq8:0, 1873-1876, 1vqk:0, 1873-1876, 1vql:0, 1873-1876, 1vqm:0, 1873-1876, 1vqp:0, 1873-1876, 1w2b:0, 1873-1876, 1yhq:0, 1873-1876, 1yi2:0, 1873-1876, 1yij:0, 1873-1876, 1yit:0, 1873-1876, 1yj9:0, 1873-1876, 1yjn:0, 1873-1876, 1yjw:0, 1873-1876, 2otj:0, 1873-1876, 2otl:0, 1873-1876, 2qex:0, 1873-1876, 3cc2:0, 1873-1876, 3cc4:0, 1873-1876, 3cc7:0, 1873-1876, 3cce:0, 1873-1876, 3ccj:0, 1873-1876, 3ccl:0, 1873-1876, 3ccm:0, 1873-1876, 3ccq:0, 1873-1876, 3ccr:0, 1873-1876, 3ccs:0, 1873-1876, 3ccu:0, 1873-1876, 3ccv:0, 1873-1876, 3cd6:0, 1873-1876, 3cma:0, 1873-1876, 3cme:0, 1873-1876, 3cpw:0, 1873-1876